圆杆菌科
圆杆菌科（学名：）为噬纤维菌目的一科细菌。此科的模式属为圆杆菌属(Cyclobacterium)。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
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桃色杆菌科
桃色杆菌科（学名：）为噬纤维菌目的一科细菌。此科的模式属为(Persicobacter)。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
微颤蓝细菌科
微颤蓝细菌科（学名：）为噬纤维菌目的一个科。此科的模式属为微颤蓝细菌属(Microscilla)。 下级分类 艾森氏杆菌属 Eisenibacter Hahnke et al., 2017 微颤蓝细菌属 Microscilla Pringsheim, 1951 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
薄层杆菌科
**'（学名：Hymenobacteraceae）是噬纤维菌目下的一个科。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献
粉红色杆状菌科
**'（学名：Roseivirgaceae）为噬纤维菌目的一科细菌。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献
噬纤维菌目
噬纤维菌目 （学名：）为噬纤维菌纲的唯一一目细菌。此目细菌的模式属为噬纤维菌属(Cytophaga)。 下属分类 本目包括以下科： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
螺状菌科
螺状菌科 （学名：）为噬纤维菌目的一科细菌。此科的模式属为螺状菌属(Spirosoma)。 下属分类 本科包括以下属： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
火色杆菌科
火色杆菌科（学名：）为噬纤维菌目的一科细菌。此科的模式属为火色杆菌属(Flammeovirga)。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
噬纤维菌科
噬纤维菌科 （学名：）为噬纤维菌目的一科细菌。此科的模式属为噬纤维菌属(Cytophaga)。 下级分类 本科包括以下属： 参考文献 * LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature