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Jmol

Jmol是一款用于三维化学结构分子建模的计算机软件。它是一个开源的Java编写的三维化学结构查看器。其名称源于[[Java|[J]ava]](编程语言)和[mol]ecules(分子)的结合,同时也指代mol文件格式。 JSmol则是将Jmol的功能以JavaScript语言实现的一个版本。它可以嵌入到网页中,用于展示分子及其他结构的可交互三维模型,用户无需安装任何额外的软件,只需使用网络浏览器即可(它不依赖Java运行)。 Jmol和…

ChemDraw

*'是一个化学信息学的画图软件,最初由Selena "Sally" Evans、David A. Evans、Stewart Rubenstein三人在1985年发布,三人也因此成立了CambridgeSoft公司,2011年被珀金埃尔默收购,2022年珀金埃尔默公司拆分后软件版权归于新成立的Revvity。 文件格式 最初使用的文件檔案格式是扩展名为.cdx的文件,在引入XML后改为.cdxml,此外还兼容.mol、.sdf、.skc…

AIMAll

AIMAll 是由 Todd A. Keith 开发的用于进行AIM计算化学分析的跨平台软件。它同时提供了一个图形界面,能将有效电荷、键径等信息可视化。该软件以其它量子化学软件计算得出的波函数为基础,以波函数文件(wfn 或 wfx 格式)为输入文件。该软件同时提供了一个小程序,用于将GAUSSIAN的格式化检查点文件(fchk文件)转换为 wfn 和 wfx 格式。它支持大部分的从头计算法和密度泛函理论得到的波函数,并且在输入文件正确…

PyMOL

PyMOL是一个开放源码,由使用者贊助的分子三维结构显示软件。由Warren Lyford DeLano编写,並且由DeLano Scientific LLC將它商業化。DeLano Scientific LLC是一個私人的軟體公司,它致力於創造讓普遍的科學與教育社群都能取得的好用軟體工具。 PyMOL适用于创作高品質的小分子或是生物大分子(特别是蛋白質)的三维结构圖像。軟體的作者宣称,在所有正式发表的科學文獻中的蛋白質結構圖像中,有四…

Kalzium

Kalzium(來自德語的鈣)是一個開源的元素週期表軟體。 它包含103個化學元素的資訊,其中包括質量、電荷、圖片、發現信息、化學和能量數據、和這個原子的模型。該週期表本身可以設定為記數系統、物質狀態、和顏色編碼等各種顯示方式。 外部連結 [http://edu.kde.org/kalzium/ Kalzium主頁] [https://web.archive.org/web/20050206223816/http://docs.kde.…