蛋白质设计是指对新的蛋白质分子进行合理的设计，以期赋予其新颖的活性、行为或特定用途，并借此深入探究蛋白质功能的基本原理。蛋白质的设计可以从零开始（称为从头设计，de novo design），也可以通过对已知蛋白质结构及其序列进行计算性的变异（称为蛋白质再设计）来实现。
合理的蛋白质设计方法旨在预测能够折叠成特定结构的一系列蛋白质序列。这些预测出的序列随后可通过多肽合成、定点诱变或人工基因合成等实验方法进行验证。
合理的蛋白质设计可追溯至1970年代中期。随着对影响蛋白质结构稳定性的各种因素的理解越来越深刻，以及更优异计算方法的不断发展，通过合理设计成功获得水溶性乃至跨膜多肽和蛋白质的案例已屡见不鲜。
参见
- 合成生物学
参考文献
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