假单胞菌界

{{Automatic taxobox
| image = E. coli Bacteria (7316101966).jpg
| image_caption = 放大25,000倍的大肠杆菌细胞
| taxon = Pseudomonadati
| authority = (Gibbons & Murray 1978) Oren & Göker 2024
| type_genus = 假单胞菌属
Pseudomonas
| type_genus_authority = Migula 1894 (1980年批准名单)
| subdivision_ranks = 门
| subdivision_ref =
| subdivision = *遥远杆状菌门 Abditibacteriota
*酸杆菌门 Acidobacteriota
*产水菌门 Aquificota

• Atribacterota

*拟杆菌门 Bacteroidota

• Balneolota
• Caldisericota
• Calditrichota

*衣原体门 Chlamydiota

• Chlorobiota
• Chrysiogenota

候选门级 Cloacimonadota "Ca.* Cloacimonadota"

• Coprothermobacterota
• Deferribacterota
• Dictyoglomerota
• Elusimicrobiota
• Fibrobacterota
• Gemmatimonadota
• Kiritimatiellota

候选门级 Latescibacterota "Ca.* Latescibacterota"

• Lentisphaerota
• Nitrospinota

*硝化螺旋菌門 Nitrospirota

• Planctomycetota

*假单胞菌门（变形菌门） Pseudomonadota
*红嗜热盐菌门 Rhodothermota
*螺旋体门 Spirochaetota
*热脱硫杆菌门 Thermodesulfobacteriota
*热微菌门 Thermomicrobiota
*疣微菌门 Verrucomicrobiota
候选门级 Zhuqueibacterota "Ca.* Zhuqueibacterota"
| synonyms = “水生细菌” "Hydrobacteria" Battistuzzi & Hedges, 2009（学名：）是一个包含大约三分之一原核生物物种的一个界，其中大部分及其亲属是革兰氏阴性细菌。它是更大的细菌界——芽孢杆菌界的近亲，而芽孢杆菌大多是革兰氏阳性细菌

1978年，吉本斯（Gibbons）和默里（Murray）描述了（），有时也用它来代替假单胞菌界。然而，“细长菌”包含了蓝细菌（芽孢杆菌界的一个成员），并且不属于现在普遍接受的三域系统。但该定义并未包含分子系统发育学或统计分析。此外，该定义也未遵循三域系统，而是声称真核生物+古菌的谱系嵌套在细菌中，是放线菌门的近亲，而任何分子系统发育学都不支持这一谱系。

进化
据推测，假单胞菌界和芽孢杆菌界在大约30亿年前分化，这表明当时陆地（大陆）已被原核生物占领。

一些无根源的分子系统发育分析并不支持这种芽孢杆菌界和假单胞菌界的二分法，但最近的基因组分析，目前，对于假单胞菌界和芽孢杆菌界之外的细菌门（从而证明Selabacteria分类单元的合理性）存在争议，并且可能包括或不包括梭杆菌。

细菌领域内两个主要分支（假单胞菌界和芽孢杆菌界）的定义主要来自于基因组的根源性系统发育分析。非根源性分析并未完全支持这一划分，该分析提醒人们，根源性生命树状图的重要性。

近期两次细菌系统发育分析均支持假单胞菌界和芽孢杆菌界的划分。然而，他们对细胞壁的进化有不同的解释，一个人得出结论，细菌的最后共同祖先是革兰氏阳性细菌，而另一个人则得出结论，它是革兰氏阴性细菌。下面的树状图是从最近的两项研究中重新绘制的，显示了细菌门和总门（超门）的系统发育，其中梭杆菌的位置尚未确定，DST是芽孢杆菌界的最近亲属：

参考文献