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候选门级辐射类群

Wikipedia · 2026-06-23 维基百科 👁 1 阅读

候选门级辐射类群（，简称）是细菌的一个演化辐射分支，其中的物种大多数尚未被培养，只能从宏基因组和单细胞测序得知其存在。由于它们的体积只有纳米级，与其他细菌相比极为微小，因而也被称为“纳米细菌”（，纳米细菌也可以指一类曾被认为是细菌的纳米级大小的矿物，二者没有直接关系）或“超小细菌”（）。

在研究早期（2016年前后），候选门级辐射类群被认为可能含有70多个门，代表了细菌中15%的门级多样性，然而，根据基于相对演化分歧的基因组分类数据库（GTDB），认为它只是一个单一的门，早期的高估是源于核糖体蛋白的快速进化。通常来说，候选门级辐射类群的细菌基因组较小，缺少几种生物合成途径以及核糖体蛋白。因此人们猜测它是专性共生生物。

早期研究中，学者将现属于本类群的几个门归类为一个超门，命名为Patescibacteria，因此，这个名称也被视为候选门级辐射类群的一个异名，现在GTDB中仍在使用这个名称，因为本类群在该数据库中被视为一个门。

本类群的成员一般难以培养，因此在依赖培养的研究方法中会被遗漏。此外，它们有一些独特的核糖体特征，因此在依赖16S rRNA的研究中也会被遗漏。它们的rRNA基因似乎负责编码蛋白质，并且含有，这些特征在细菌中很少见，不过之前也有发现过。由于这些内含子，本类群的成员在16S rRNA的研究中无法被检测到；此外，所有成员都缺乏，这是一种在营共生生活的细菌中常见的特征。]]

早期的一些基于核糖体蛋白和蛋白家族的系统发育研究认为候选门级辐射类群是细菌中最早分化的谱系，以下是各个门（正常字体）和超门（粗体）之间的系统发育关系：根据这些研究，候选门级辐射类群与相关细菌类群的进化关系如下：

{{Clade
|style= font-size:100%; line-height:100%
|label1=细菌域（Bacteria）
|1={{clade
|1=薄壁菌门（Gracilicutes）
|label2=大地菌（Terrabacteria）
|2=
}}
}}

临时分类
根据{{le|国际原核生物命名法规|International Code of Nomenclature of Prokaryotes|国际原核生物命名-{zh-cn:法规;zh-tw:規約}-}}，原核生物类群必须有纯培养物才能获得正式名称，而候选门级辐射类群的绝大多数物种无法满足这个资格。然而，一些临时名称或已经得到公认。到2017年为止，本类群下有Parcubacteria和Microgenomates两个超门得到承认。|
{{clade|style=font-size:90%;line-height:90%;width:400px
|1={{Clade
|1="Wirthbacteria" (CG2-30-54-11)
|2={{Clade
|1=
|2=
}}
}}
}}
}}
{{cladogram|title=Microgenomatia的系统发育

参见

  • 细菌分类表

参考资料
外部链接

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#细菌学

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