在生物化学中，蛋白三聚體（protein trimer）是由三个通常以非共价键结合的大分子 （例如蛋白质或核酸） 形成的大分子复合物。蛋白质三聚体通常由蛋白质四级结构的组装而成。多肽单元上疏水区和亲水区之间的非共价相互作用有助于稳定四级结构。由于蛋白质三聚体由多个多肽亚基组成，因此它被认为是一种低聚物 。
它由三個相同蛋白質形成的三聚體稱為，如、真核生物的DNA夾（由三個組成）；由三個相異蛋白質形成的三聚體則稱為異源三聚體，如古菌的DNA夾（由PCNA1、PCNA2和PCNA3組成）。
孔蛋白通常以蛋白三聚體的形式排列在膜中。
參考文獻
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