DNA超螺旋(DNA supercoiling)是指DNA双螺旋链在某些情况下扭转时产生的更高级别的三维卷曲结构。当末端固定或呈环状的DNA双螺旋链发生扭转时,扭转应力无法通过旋转末端来释放,便会产生超螺旋现象。
DNA的超螺旋是一种普遍存在的现象,它存在于所有类型的细胞中,包括细菌(Prokaryotes)、古菌(Archaea)和真核生物(Eukaryotes)这三大生命域。此外,超螺旋结构也深刻影响着DNA的复制和转录等关键生物学过程。
超螺旋结构的成因
超螺旋结构的成因,是DNA双螺旋结构内部引入了结构性张力(Structural Strain),而DNA分子有着缓解张力的趋势,便进一步盘绕成超螺旋结构。结构性张力的引入,主要由细胞内的拓扑异构酶(Topoisomerase)造成。这两种拓扑酶拓扑异构酶能暂时性地切断DNA的一股或两股链,让DNA链段移动或旋转后,再将切口重新连接。这一过程会对DNA分子拓扑结构的关键参数——连环数(linking number)产生影响。不同的拓扑异构酶具有不同的切割和连接模式,对连环数产生的影响也不同。简单来说,拓扑异构酶主要分为两种类型:
- I 型拓扑异构酶(Type I Topoisomerase) :通过切断DNA双螺旋中的一股,使其旋转以改变连环数。此类拓扑异构酶每次作用通常改变1个连环数(ΔL = ±1)。
- II 型拓扑异构酶(Type II Topoisomerase) :同时切断DNA的两股,让另一段双螺旋DNA穿过此缺口后再重新连接。此类拓扑异构酶每次作用通常改变2个连环数(ΔL = ±2)。
在这两种拓扑异构酶的作用下,DNA分子碱基对数目不变但连环数发生增加或减少,从而导致额外张力的产生。
如果DNA链条的末端处于能够自由旋转的状态,额外张力就能够通过自由末端的扭转释放出去,从而将每个连环中的碱基数目恢复至正常。然而,真核细胞的细胞核内DNA链条往往并非杂乱自由的状态,而是高度有序的结构,并且往往被组织成一系列的环状结构域(loop domains)。这些环的基部会锚定在一个被称为“核基质”或“核骨架”的蛋白网络上。这种锚定方式意味着,尽管整条染色体是线性的,但它被分成了许多个拓扑学上独立的闭合区域。在这些环状结构域内,DNA的旋转受到限制,其行为类似于环状DNA:
- 具绞旋线超螺旋(Plectonemic):形态类似于扭转的电话线,是从细胞中提取出的纯化DNA在溶液中的常见形态。
- 螺管式超螺旋(Toroidal/Solenoidal):DNA缠绕在蛋白质(如染色质中的组蛋白)周围形成的结构,这种缠绕方式更为紧密,是真核細胞中DNA的主要存在形式。
怀特公式
扭转数(T:twisting number)绞拧数(W:writhing number)與环绕数(L:Linking number)之間的關係可寫成:
::L = T + W
- L(环绕数)定义为当一个环状双螺旋DNA分子平铺在平面时,一条链跨越另一条链的次数;
- T(扭转数)指一条链绕双螺旋假想轴缠绕的圈数
- W(缠绕数)亦称为超螺旋数(Number Of Turns Of Superhelix)。
一般情况下,大多数生物体的DNA是负超螺旋。
生物学功能与临床意义
在生物体内,DNA普遍以超螺旋的形式存在,细胞内的DNA会在这两种拓扑异构酶的持续作用下,动态地在放松与旋紧状态间转换。这一现象对于将庞大的DNA分子紧密压缩并容纳于细胞核内至关重要。这种酶能够引入正超螺旋,即“过旋”DNA。
參見
- 核酸結構
- 染色體
- 組織蛋白
*環狀dna
参考资料
外部連結
评论 (0)