在南極洲，只有少數的鳥類(約50種) 能適應沿岸極地氣候的生活。其中，南极磷虾大概是南極生物地理區中的關鍵物種，是該地大部份動物的主要食物來源。
數個南冰洋群島，包含南乔治亚岛和南桑威奇群岛、南奧克尼群島、南謝德蘭群島、布韦岛、克羅澤群島、爱德华王子群岛、赫德島、凯尔盖朗群岛以及麥當勞群島等諸島有時也被看作是南極生物地理區的一部份，這些島嶼的氣候較南極本土溫和，並有較豐富的物種多樣性；不過本表並不列入這些地區的鳥類。
企鵝目 Sphenisciformes
*企鵝科 Spheniscidae
- Pygoscelis antarctica]]
* 王企鵝屬 Aptenodytes*
*# 皇帝企鵝 Aptenodytes forsteri*
*# 國王企鵝 Aptenodytes patagonicus*
* 阿德利企鵝屬 Pygoscelis*
*# 巴布亞企鵝（紳士企鵝） Pygoscelis papua*
*# 阿德利企鵝 Pygoscelis adeliae*
*# 南極企鵝（帽带企鹅、頰帶企鵝、鬍鬚企鵝） Pygoscelis antarctica*
* 冠企鵝屬 Eudyptes*
*# 南跳岩企鵝 Eudyptes chrysocome*
*# 北跳岩企鵝 Eudyptes moseleyi*
*# 峽灣企鵝（鳳冠企鵝、福德蘭企鵝） Eudyptes pachyrhynchus*
*# 史納爾島企鵝 Eudyptes robustus*
*# 皇家企鵝 Eudyptes schlegeli*
*# 冠毛企鵝（豎毛企鵝） Eudyptes sclateri*
*# 馬可羅尼企鵝（長冠企鵝） Eudyptes chrysolophus*
*# †查塔姆企鵝 Eudyptes chathamensis*
* 黃眼企鵝屬 Megadyptes*
*# 黃眼企鵝 Megadyptes antipodes*
*# †怀塔哈企鹅 Megadyptes waitaha*
* 小藍企鵝屬 Eudyptula*
*# 小藍企鵝（神仙企鵝） Eudyptula minor*
*# 白鰭企鵝 Eudyptula albosignata*
* 環企鵝屬 Spheniscus*
*# 黑腳企鵝（非洲企鵝、斑嘴環企鵝） Spheniscus demersus*
*# 麥哲倫企鵝（麥氏環企鵝） Spheniscus magellanicus*
*# 漢波德企鵝（洪氏環企鵝） Spheniscus humboldti*
*# 加拉帕戈斯企鵝（加拉巴戈企鵝、加島環企鵝） Spheniscus mendiculus*
鸌形目 Procellariiformes
*信天翁科 Diomedeidae
#漂泊信天翁 - Diomedea exulans*（Wandering Albatross（
#灰头信天翁 - Thalassarche chrysostoma*（Gray-headed Albatross）※易危
#黑眉信天翁 - Thalassarche melanophris*（Black-browed Albatross）
#黑信天翁 - Phoebetria fusca*（Sooty Albatross）※瀕危
#淡額黑信天翁 - Phoebetria palpebrata* (Light-mantled Albatross) ※近危
*鸌科 Procellariidae
#巨鸌 - Macronectes giganteus* ※易危
#Macronectes halli* （Hall's Giant Petrel）※近危
#银灰暴风鹱 - Fulmarus glacialoides*
#南极鹱 - Thalassoica antarctica* ※繁殖特有種
#海角鹱 - Daption capense*
#雪鹱 - Pagodroma nivea*
#灰脸圆尾鹱 - Pterodroma macroptera*
#白头圆尾鹱 - Pterodroma lessonii*
#蓝鹱 - Halobaena caerulea*（Blue Petrel）
#Pachyptila vittata*（Broad-billed Prion）
#Pachyptila salvini*（Salvin's Prion）
#鸽锯鹱 - Pachyptila desolata*（Antarctic Prion）
#细嘴锯鹱 - Pachyptila belcheri* （Slender-billed Prion）
#仙锯鹱 - Pachyptila turtur* （Fairy Prion）
#灰鸌 - Procellaria cinerea* （Gray Petrel） ※近危
#白颏风鹱（白額鸌） - Procellaria aequinoctialis*（White-chinned Petrel）
#Aphrodroma brevirostris*（Kerguelen Petrel）
#灰剪水鹱 (灰水薙鳥) - Puffinus griseus*（Sooty Shearwater） ※近危
*海燕科 Hydrobatidae
#灰背海燕 - Garrodia nereis*（Gray-backed Storm-Petrel）
#黄蹼洋海燕 - Oceanites oceanicus*（Wilson's Storm-Petrel）
#黑腹舰燕 - Fregetta tropica*（Black-bellied Storm-Petrel）
*鵜燕科 Pelecanoididae
#南乔治湾鹈燕 - Pelecanoides georgicus*（South Georgia Diving-Petrel）
#鹈燕 - Pelecanoides urinatrix*（Common Diving-Petrel）
鵜形目 Pelecaniformes
*鸕鷀科 Phalacrocoracidae
#Phalacrocorax bransfieldensis*（Antarctic Shag）
#蓝眼鸬鹚 Phalacrocorax atriceps*（Imperial Shag）
#Phalacrocorax melanogenis*（Crozet Shag）
鸛形目 Ciconiiformes
*鷺科 Ardeidae
#黃頭鷺 - Bubulcus ibis*（Cattle Egret）
雁形目 Anseriformes
*雁鴨科 Anatidae
#黄嘴鸭 - Anas georgica*（Yellow-billed Pintail）
鴴形目 Charadriiformes
*鞘嘴鷗科 Chionididae
#白鞘嘴鸥 - Chionis alba*（Snowy Sheathbill）
*賊鷗科 Stercorariidae
#南極賊鷗 - Stercorarius maccormicki*（South Polar Skua）
#Stercorarius antarctica*（Brown Skua）
*鷗科 Laridae
#黑背鸥 - Larus dominicanus*（Kelp Gull）
*燕鷗科 Sternidae
#北极燕鸥 - Sterna paradisaea*（Arctic Tern）
#南極燕鷗 - Sterna vittata*（Antarctic Tern）
參見
*鸟类全基因组测序分类系统
*Howard-Moore鳥類分類系統
*Clements鳥類分類系統
- Sibley-Ahlquist鳥類分類系統
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