科扎克共有序列, 或Kozak 序列 ,是在真核生物的mRNA中共有的(gcc)gccRccAUGG序列 。它在翻译过程的启动中扮演了重要角色。,得名自揭示了其重要性的玛丽莲·科扎克。
序列标识为(gcc)gccRccAUGG, 源自科扎克对大范围的样本(共约699种)的归纳和分析,其中:
小写字母表示此位置处最常见的碱基(仍然可以变化);
大写字母表示高度保守的碱基,例如“AUGG”序列是不变的或很少,甚至根本没有变化,唯一的例外是IUPAC的模糊码。“R”这表明嘌呤(A或G)总是在这个位置上(科扎克声称A更常见)
括号内的序列((gcc))重要性不明。
科扎克的研究局限于脊椎动物的一部分(例如人类,牛,猫,狗,鸡,豚鼠,仓鼠,小鼠,猪,兔,羊,非洲爪蟾)。
简介
这个序列在mRNA分子上被核糖体识别为翻译起始位点,即蛋白质是由此开始被该mRNA分子编码的。核糖体需要此序列,或一个可能的可变形式(见下文)来启动翻译。Kozak序列不应与核糖体结合位点(RBS)相混淆,后者一般为信使RNA的5'端帽或内部核糖体进入位点(IRES)。
在体内(In vivo),不同的mRNA上这段区域往往不完全匹配,由一个给定的mRNA合成蛋白质的量取决于Kozak序列的强度。 这个序列中的一些核苷酸比其它的更重要:AUG是最重要的,因为它是实际的起始密码子,在对应蛋白质的N-末端编码一个甲硫氨酸。(很少地,CUG被用作起始密码子,编码亮氨酸,而不是典型的蛋氨酸作为起始。)“AUG”的A被定为1号位的话,对于一个“强”的Kozak序列,核苷酸在相对于1号核苷酸的4号位(即G所在的位置)和-3号位(即R的位点,没有号码0的位置)必须匹配一般的Kozak序列。“适中”强度的Kozak序列只有上述两个中的一个匹配,而“弱”的两个都不匹配。在-1和-2的cc并不那么保守,但有助于提升整体强度。有证据表明, 在-6位的G在翻译起始中也是重要。 从这样的位点起始的翻译,mRNA序列需要有额外的特性,以便使核糖体识别起始密码子。
变异
研究显示β-珠蛋白基因(β+45;人类)在-6位G—>C的变异表现打乱血液和生物合成功能的表型。这是首个被发现的人类Kozak序列变异。它在一个意大利东南部的地中海贫血家庭中被发现。
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|酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae)||子囊菌门||aAaAaAATGTCt
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|粘菌 (Dictyostelium discoideum)||变形虫门||aaaAAAATGRna
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|纤毛虫||纤毛虫门||nTaAAAATGRct
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|Trypanosomatidae||眼虫门||nnnAnnATGnC
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参见
*夏因-达尔加诺序列, 原核生物的核糖体结合位点。
参考
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