臺菲漁業衝突是指中華民國與菲律賓兩國數十年來在各自主張之專屬經濟海域重疊區域上多次發生的時候漁業糾紛，甚至造成漁民傷亡。漁業署統計從1990年至2012年，菲律賓就扣留了108艘台灣漁船。有漁民指到南海捕魚時必須帶大筆現金在身上，以應付菲律賓海巡署公務船的「登船安檢」。這個習慣被形容為漁民之間的「潛規則」。
事件
1968年
*1968年7月20日，東港漁船連春財號遭菲律賓扣捕。
2004年
*東港籍漁船成福利號在菲律賓北方巴丹群島海域被一艘菲律賓武裝艦艇以機關槍掃射，導致船長王保生因為身中數槍，當場斃命。
2004年4月
*琉球籍興億福號漁船因為機件故障漂流至菲律賓巴丹群島海域擱淺，海岸巡防署接獲船長陳泰隆求救訊息後，派出花蓮艦馳援。結果遭到島上武裝份子開槍攻擊，興億福號被洗劫一空，最終船上6名船員成功獲救。
2006年1月
*1月5日，臺東縣籍漁船滿春億號在巴丹群島東南方約500公尺處海域作業時，遭到菲律賓警察朝著駕駛艙以M14和M16步槍連續掃射，導致船長陳安老右大腿動脈中彈，失血過多死亡，胞弟陳明德臀部中彈受傷。
2009年5月
*屏東縣琉球籍漁船紫福添號於5月12日，因躲避颱風駛近菲律賓海域，等到風雨過後準備返航，卻被當地海巡隊以越界捕魚為由遭扣押。當持船上成員包括船長洪勝福等兩名台籍幹部及10名印尼漁工全數遭軟禁。由於當地漁業單位多，漁船被扣後多方單位以罰款為由多重索錢，期間家屬多次到菲律賓斡旋，前後付款150萬元新台幣仍不放行。至8月3日船長趁天候不佳，斷纜逃出菲國港口，於8月4日安全返回屏東東港。
2013年5月
*5月9日，台灣屏東縣琉球鄉籍漁船廣大興28號於巴士海峽裏中華民國（台灣）主張之經濟海域上捕魚時，被菲律賓海巡署的漁政公務船（編號MCS-3001）開槍攻擊與追逐。事件當中廣大興28號船員洪石成中彈身亡。此事使得台菲關係越見緊張。另外，事件發生當時，另艘台灣漁船「明正福12號」亦在附近，但未注意到廣大興28號已被攻擊，之後同艘公務船轉向明正福12號，整整追逐3個半小時，整起事件最終導致中華民國海軍、空軍與海巡直接南下，以海上演訓警告菲律賓政府。
參考資料
連結
*[https://web.archive.org/web/20130609080151/http://nrch.cca.gov.tw/ccahome/tvnews/tvnews_meta.jsp?xml_id=0006140992&maintitle=%0A++++++++%E6%BC%81%E8%88%B9%0A&dofile=cca-1-20001-nw-ttvdy-19880707_30-n.asf 屏東東港漁船在公海作業被菲船艦扣留]
*[https://web.archive.org/web/20130609080222/http://nrch.cca.gov.tw/ccahome/tvnews/tvnews_meta.jsp?xml_id=0006160016&maintitle=%0A++++++++%E6%BC%81%E8%88%B9%E8%A2%AB%E6%89%A3%E4%BA%8B%E4%BB%B6%0A&dofile=cca-1-20001-nw-ttvdy-19910416_26-n.asf 農委會營救被扣在菲東港三艘漁船]
*[https://web.archive.org/web/20130609080643/http://nrch.cca.gov.tw/ccahome/tvnews/tvnews_meta.jsp?xml_id=0006160535&maintitle=%0A++++++++%E4%B8%AD%E8%8F%B2%E6%BC%81%E6%A5%AD%E7%B3%BE%E7%B4%9B%3B%E6%BC%81%E8%88%B9%0A&dofile=cca-1-20001-nw-ttvdy-19910508_14-n.asf 屏東吉隆號和先結群號漁船返回東港 受親友歡迎]
*[http://dailynews.sina.com/bg/tw/twlocal/udn/su/20090805/0123540710.html 菲扣兩月餘…我漁船趁夜「逃」回家]
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