{{Automatic taxobox
| image = Wolbachia.png
| image_caption = 穿透式電子顯微鏡下的昆蟲細胞,細胞被沃爾巴克體(Wolbachia)感染
授權:Public Library of Science / Scott O'Neill
| authority = Garrity et al. 2006
| taxon=Alphaproteobacteria
| subdivision_ranks = 亞綱
| subdivision =
- Magnetococcidae
** Magnetococcales
*** Magnetococcaceae
- Rickettidae
**立克次體目 Rickettsiales
***Anaplasmataceae
***Midichloriaceae
***Rickettsiaceae
**Pelagibacterales
*** (subgroups I-V)
- Caulobacteridae
**Holosporales
**柄桿菌目 Caulobacterales
***Caulobacteraceae
**Parvularculales
***Parvularculaceae
**根瘤菌目 Rhizobiales
***Aurantimonadaceae
***Bartonellaceae
***Beijerinckiaceae
***Bradyrhizobiaceae
***Brucellaceae
***Cohaesibacteraceae
***Hyphomicrobiaceae
***Methylobacteriaceae
***Methylocystaceae
***Phyllobacteriaceae
***根瘤菌科 Rhizobiaceae
***Rhodobiaceae
***Xanthobacteraceae
***紅細菌目 Rhodobacterales
***Rhodobacteraceae
**紅螺菌目 Rhodospirillales
***Acetobacteraceae
***紅螺菌科 Rhodospirillaceae
***其他紅螺菌目未分類成員。此綱的成員變異性極大,且共通點極少,但他們確實系出同源。α-變形菌大多都是革兰氏阴性菌,而有些包內寄生的物種缺少肽聚醣,而造成革蘭氏染色變異。
特性
α-變形菌包含多種細菌,其中包含光自營細菌、植物共生菌(如根瘤菌)、內共生細菌(如Wolbachia),和胞內寄生細菌(如立克次體)。
此外,本綱還包含已滅絕的。真核生物的祖先攝入了此種細菌,進行內共生作用,成為後來的粒線體。還有一種生物技術上很喜歡使用的農桿菌(Rhizobium radiobacter)也是本綱成員,科學家常常使用本物種來將外來DNA導入植物基因體中。另外,一些光自營生物像是遍在遠洋桿菌(Pelagibacter ubique)也屬於此綱,α-變形菌的微生物可能佔了海洋微生物的10%左右。
演化及基因體
關於本綱所屬的目,有人反對現行的分類法,尤其是*'的地位,但大體上大家還是普遍接受。細菌的分類學一直是分類學家相當頭痛的問題,因為細菌的基因會彼此互相交流,且基因歧異度相當高(像是遍在遠洋桿菌由於他的寄生行為,就會精簡化他的基因體)。在某些目中,其成員的GC含量變異也大的誇張,而反對方也有他們自己的論述。後來有人發現用以判斷分類依據的rRNA中,GC含量好像好像不太會受基因體變異影響。因此,rRNA中GC含量較高的 Holosporales 就被和低GC含量的Pelagibacterales和立克次體目分開了立克次體亞綱則由細胞內寄生的立克次體目(Rickettsiales),以及可以在胞外單獨生存的Pelagibacterales。柄桿菌亞綱則由Holosporales、紅螺旋菌目(Rhodospirillales)、鞘脂單胞菌目(Sphingomonadales)、紅細菌目( Rhodobacterales)、柄桿菌目(Caulobacterales)、Kiloniellales、Kordiimonadales、短小盒菌目(Parvularculales),和Sneathiellales*。
α-变形菌纲包括以下亚纲:
; Magnetococcidae亚纲
; Rickettidae亚纲
; Caulobacteridae亚纲
{{common taxon list|italic=no
|全孢菌目 |Holosporales |Szokoli et al. 2020
|柄桿菌目 |Caulobacterales |
- 柄杆菌科 Caulobacteraceae
|短小盒菌目 |Parvularculales |
*短小盒菌科 Parvularculaceae
|根瘤菌目 |Rhizobiales |
*橙单胞菌科 Aurantimonadaceae
*巴通体科 Bartonellaceae
*拜叶林克氏菌科 Beijerinckiaceae
*慢生根瘤菌科 Bradyrhizobiaceae
*布魯氏菌科 Brucellaceae
*黏着杆菌科 Cohaesibacteraceae
*生丝微菌科 Hyphomicrobiaceae
*甲基杆菌科 Methylobacteriaceae
*甲基孢囊菌科 Methylocystaceae
*叶杆菌科 Phyllobacteriaceae
*根瘤菌科 Rhizobiaceae
*红菌科 Rhodobiaceae
*黄色杆菌科 Xanthobacteraceae
|红杆菌目 |Rhodobacterales |Garrity et al. 2006
- Neomegalonemataceae Hördt et al. 2020
- 副球菌科 Paracoccaceae Liang et al. 2022
- 玫瑰杆菌科 Roseobacteraceae Liang et al. 2021
|紅螺菌目 |Rhodospirillales |
*红杆菌科 Acetobacteraceae
*紅螺菌科 Rhodospirillaceae
*其他紅螺菌目未分類成員
而樹狀圖則是根據'The All-Species Living Tree' Project所提供的16s rRNA分析結果
{{Clade
|1={{clade
|1=?Aquaspirillum polymorphum ♠ (Williams and Rittenberg 1957) Hylemon et al. 1973
|2=?Furvibacter ♠ Lee et al. 2007
|3=?Kopriimonas byunsanensis ♠ Kwon et al. 2005
|4=?Magnetococcus marinus Bazylinski et al. 2012 (in press)
|5=?Micavibrio aeruginosavorus ♠ Lambina et al. 1983
|6=?Polymorphum gilvum ♠ Cai 2010
|7=?Reyranella massiliensis Pagnier et al. 2011
|8=?Ronia tepidophila ♠
|9=?Subaequorebacter tamlense ♠ Lee 2006
|10=?Tuberoidobacter mutans ♠
|11=?Vibrio adaptatus Muir et al. 1990
|12=?Vibrio cyclosites Muir et al. 1990
|13=Rhodovibrio
|14={{clade
|1=紅螺菌科 Rhodospirillaceae 2
|2=
}}
}}
}}
*註:
資料取自美国国家生物技术信息中心(NCBI)
參考文獻
外部連結
*
- [http://www.bacterialphylogeny.info/groupspecific/alphaproteo/alpha.html Bacterial (Prokaryotic) Phylogeny Webpage: Alpha Proteobacteria.]
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