假胡麻草属
假胡麻草属（学名：Centrantheropsis）是玄参科下的一个属。该属仅有假胡麻草（Centrantheropsis rigida）一种，分布于中国贵州。 参考文献
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方茎草属
方茎草属（学名：Leptorhabdos）是玄参科下的一个属，为直立草本植物。该属仅有方茎草（Leptorhabdos parviflora）一种，分布于中亚及喜马拉雅山西部。 参考文献
藏玄参属
藏玄参属（学名：Oreosolen）是玄参科下的一个属，为簇生、稍肉质草本植物。该属共有2种，分布于喜马拉雅一带。 参考文献
短冠草属
短冠草属（学名：Sopubia）是玄参科下的一个属，为直立草本植物。该属共有20种，分布于东半球热带地区。 参考文献
钟萼草属
钟萼草属（学名：Lindenbergia）是列当科下的一个属，为一年生或多年生草本植物。该属共有15－20种，分布于热带亚洲和非洲。 参考文献
山罗花属
山罗花属（学名：Melampyrum）是玄参科下的一个属，为一年生、直立、半寄生草本植物。该属共有约35种，分布于北温带。 参考文献
直果草属
直果草属（学名：Orthocarpus）是玄参科下的一个属，为一年生草本植物。该属共有约25种，分布于美国西海岸。 参考文献
疗齿草属
疗齿草属（学名：Odontites）是玄参科下的一个属，为一年生、直立、分枝、半寄生草本植物。该属共有20种以上，分布于地中海区、非洲北部及亚洲温带地区。 参考文献
金鱼草属
金鱼草属（学名：Antirrhinum），是屬於車前草科下的一个属 金鱼草属傳統上被歸類到玄参科。 參考 * 金魚草 参考文献
地黄属
地黄属（学名：Rehmannia）是列當科下的一个属，为多年生草本植物。该属共有6－8种，分布于亚洲东部。 物种 本属包括以下物种： 天目地黄 Rehmannia chingii 黄花地黄 Rehmannia chrysantha 高地黄 Rehmannia elata 地黄 Rehmannia glutinosa 湖北地黄 Rehmannia henryi 裂叶地黄 Rehmannia piasezkii 茄叶地黄 Rehmannia…
玄参属
玄参属（学名：Scrophularia）是玄参科下的一个属，为一年生或多年生、常有臭味的草本植物。该属共有约200－300种，分布于北温带。 下属物种 本属包括以下物种： ;杂交种： 参考文献
独脚金属
独脚金属（学名：Striga）是玄参科下的一个属，为矮小草本植物。该属共有约20种，分布于东半球热带和亚热带地区。 該屬植物一株就可產出9萬至50萬枚種子（雖然很大一部分沒有活力），這些種子在地下可以潛藏10年之久。在其他植物種子發芽時，它們會隨著寄主一起發芽，奪取寄主的養分，因此在非洲及其他一些地區的國家導致嚴重的作物損失。而其發芽的契機是感應到了寄主根系分泌的独脚金内酯。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
毛蕊花属
毛蕊花属（学名：Verbascum）是玄参科下的一个属，为二年生、少数多年生草本或亚灌木植物。该属共有约300种，分布于北温带。 下属物种 本属包括以下物种： ;杂交种： ;归入本属的物种： 参考文献
御烛木属
*'（学名：Rhabdotosperma*）是玄参科的一属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
毛麝香属
毛麝香属（学名：Adenosma）是玄参科下的一个属，为草本植物。该属共有约15种，分布于印度、马来西亚、大洋洲和中国。 属名Adenosma来源于希腊语aden（腺体）和osme（香味）的合成词，指本属植物叶子具香味。 参考文献
三翅萼属
三翅萼属（学名：Legazpia）是玄参科下的一个属，为草本植物。该属共有2种，分布于亚洲东南部至大洋洲。 参考文献
小米草属
小米草属（学名：Euphrasia）是列當科下的一个属，为一年生或多年生草本植物，本属植物常寄生于禾本科植物的根上。该属共有200种，分布于全球各地。 参考文献
五齿萼属
五齿萼属（学名：Pseudobartsia）是玄参科下的一个属，为一年生草本植物。该属仅有五齿萼（Pseudobartsia yunnanensis）一种，分布于中国云南。 参考文献
崖白菜属
崖白菜属（学名：Triaenophora）是玄参科下的一个属，为多年生草本植物。该属共有2种，分布于中亚和中国。 下属物种 全缘叶呆白菜 Triaenophora integra 呆白菜 Triaenophora rupestris 参考文献