色孔菌属
*'（学名：Tinctoporellus*）是多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
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干皮菌属
干皮菌属（屬名：），又名乾皮孔菌屬，为多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
茯苓属
茯苓属（学名：Wolfiporia），也称沃菲卧孔菌属，是多孔菌科下的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
范氏孔菌属
范氏孔菌属（学名：）也称万德孔菌属，为多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
干酪菌属
干酪菌属（学名：）为多孔菌科的一属真菌。本属有119个种。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
全缘孔菌属
全缘孔菌属（学名：）为多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
彩孔菌属
*'（学名：Hapalopilus*）是多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
浅孔菌属
浅孔菌属（学名：）也称线齿菌属，为多孔菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
菱孔菌属
菱孔菌属（学名：Favolus），也作棱孔菌属，为多孔菌科的一属真菌。此属的模式种为Favolus brasiliensis。 下级分类 , Index Fungorum认定菱孔菌属有 25 个物种。 }}
棘刚毛菌属
棘刚毛菌属（学名：Echinochaete）届称棘刚毛状菌属，是多孔菌科下的一个属。 下属分类 本属包括以下物种： 参考資料
叉丝孔菌属
叉丝孔菌属（学名：）为多孔菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
小异薄孔菌属
小异薄孔菌属（学名：）为多孔菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
异薄孔菌属
异薄孔菌属（学名：）为多孔菌科的一个属。 下属物种 本属包括以下物种：
拟迷孔菌属
拟迷孔菌属（学名：Daedaleopsis），是多孔菌科下的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考資料
灰蓝孔菌属
*'（学名：Cyanosporus*）是多孔菌科的一属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
洛伊菌属
洛伊菌属（学名：），为多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
二丝孔菌属
*'（学名：Diplomitoporus*）是多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献
形拟小孔菌属
形拟小孔菌属（学名：）也称小小孔菌属、微孔菌属，为多孔菌科的一属真菌。本属有23种。 下属物种 本属包括以下物种： 參考文獻
粉孔菌属
粉孔菌属（学名：）为多孔菌科的一属真菌。 下属物种 本属包括以下物种： 參考文獻
干菌属
*'（学名：Xerotus*）是多孔菌科下的一个属。 下属物种 本属包括以下物种： 参考文献