东南亚最早可能早在7万年前就被（解剖学意义上的）现代人抵达。在南部扩散路线期间，现代人被认为在约7万至5万年前经历了两次重要迁徙，形成了独特的东亚遗传分支。东南亚的人类定居史涉及最早的狩猎采集者（如尼格利陀人）、新石器时代的农业扩张以及南岛语系人群的大规模海洋迁徙。
考古发现
东南亚最古老的已知人类活动证据之一来自桑吉兰。2007年，研究人员在桑吉兰发现了两件牛骨上的切割痕迹，年代为150至160万年前，由贝壳工具造成——这是直立人早期使用贝壳工具的最古老证据，也是全世界最古老的贝壳工具使用记录。
2009年，考古学家在老挝惠安省的谭巴岭发现了现代人的部分颅骨和牙齿。放射性碳测年和沉积物测年确定其年代至少为约56,500 BP，而牙齿的同位素比测定指示约63,600 BP。这是东南亚地区最古老的解剖学现代人化石之一，早于马来西亚尼亚洞的发现。此外，泰国和越南的多处遗址（如泰国Wihan Nakin洞、越南Kuyean洞）发现了牙齿和臼齿化石，显示了直立人与智人之间的过渡形态，可能指示两者的杂交。
迁徙浪潮
最早定居东南亚的现代人类是狩猎采集者，至少在约40,000 BP前抵达。这些最早居民的当代残余群体（如马来西亚的塞芒人或菲律宾的阿埃塔人）通常被统称为尼格利陀人。最早的定居者已拥有足够的海洋技术跨越华莱士线，与最早定居萨胡尔（约45,000 BP）的时间相近。在末次盛冰期期间，海平面下降促进了人类迁徙，增加了东南亚人群之间的遗传混合。当时作为巽他古陆一部分的东南亚，很可能是巴布亚人、尼格利陀人和东亚人分化的地点。
人群的年代学扩散（Benton等，2012年，改編自Bellwood，2011年）。]]
新石器时代的特点是南亚语系和南岛语系人群从中国南方向东南亚大陆和东南亚群岛的数次迁徙。南亚语系人群通过多种陆路进入东南亚，最早从事黍和水稻种植的农业社会约在公元前1700年在低地和河流泛滥平原出现。
最广泛的迁徙事件是南岛语系扩张，约在5,500 BP（公元前3500年）从中国南方沿海经台湾开始。南岛语系人群利用远洋舷外支架和双体船，迅速殖民了东南亚群岛，并进一步扩散至密克罗尼西亚、美拉尼西亚、波利尼西亚、马达加斯加和科摩罗。他们主导了岛屿东南亚的低地和海岸，产生了现代岛屿东南亚人、密克罗尼西亚人、波利尼西亚人和马达加斯加人。最早的南岛语系人群约在公元前2200年从台湾到达菲律宾巴坦群岛和吕宋岛北部，此后迅速向下扩散至菲律宾其余岛屿和东南亚其他地区。
约4,000 BP，侗台语系人群因环境变化和人口变迁，从中国南方沿海（广东、广西、福建）迁至贵州、云南、海南和东南亚大陆，与当地的南亚语系、南岛语系、苗瑶语系和藏缅语族人群互动。
贸易与早期国家
到约公元前500年，东南亚大陆和群岛的领土公国已发展出以剩余作物种植和沿海贸易为基础的经济。红河三角洲的文郎（雄王时代，至少自公元前7世纪起至前258年）、伊洛瓦底江流域的骠国、湄公河下游的扶南等早期国家已形成。集约化的水稻种植在理想气候下产生了稳定的作物剩余，被统治精英用于征募和维持公共工程（如水渠和防御工事）的劳动力。东南亚地区被历史学家视为一个以海洋连通性为特征的文化和经济统一体，其南岛语系人群的海洋帝国文化在南中国海、泰国湾和爪哇海区域占据主导。
遗传学证据
遗传分析表明，东南亚经历了四次史前迁徙浪潮。第一次浪潮由大陆和平文化狩猎采集者构成，他们与现今安达曼人的翁奇人和马来西亚的贾海人在遗传上最为接近。丹尼索瓦人血统在这些人群中不存在，但菲律宾的马曼瓦人与含丹尼索瓦成分的巴布亚人发生了混合。
约4,000年前，来自东亚的新石器时代农民扩展进入东南亚，引入了南亚语系血统，在米拉布里人和赫廷人以及西部印尼人（特别是峇里人和爪哇人）中达到最高比例。约2,000年前，与现今赫蒙族、傣族、京族、泰族等密切相关的额外东亚血统被引入。南岛语系血统在约2,100年前（菲律宾）至1,800年前（印尼）被引入。由于与印度的文化交流，一些东南亚人群可建模为具有2%至16%不等的南亚相关血统。
古代与现代东亚人群可建模为主要来自翁奇人样的遗传特征（约76–79%），伴有较低水平的田园洞人样混合（21–24%）。东南亚人群则落在东亚人群与当地和平文化相关的额外翁奇人样血统之间。巴布亚人相关的血统在东南亚东部（）的人群中也被检测到。
参见
- 东南亚的古人类
- 东南亚史前史
- 南岛语系
- 南亚语系
- 早期人类迁徙
参考文献
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