徐家汇博物院是天主教教会在中國上海创办的博物馆。
1847年天主教教会在上海徐家汇创建徐家汇天主堂时，即开始陆续将传教士在长江流域收集到的生物标本收藏在教堂内。1868，法国人韩伯禄出任司铎，於是将本人收集的各种生物标本和教堂原来的收藏汇集在一起，建立了自然历史博物院，因其位于徐家汇，故又称徐家汇博物院或徐家汇自然历史博物院。该馆收藏中以麋鹿最为豐富。1883年，韩伯禄又在教堂东南側（今漕溪北路南丹路转角）兴建博物院建筑，每天下午免费对外开放。
由于藏品不断增加，原建筑已容不下众多的藏品，1930年震旦大学在上海法租界吕班路劳神父路购地兴建大学和附中的新校舍，于是教会将博物院移交震旦大学管理，并由教会拨专款在新校舍兴建三层的新博物院（地址位於現今的重庆南路225号），并改称震旦博物院。为纪念韩伯禄，该博物院也叫作韩伯禄博物院，1933年冬开放。该院除收藏中国的生物标本外，还兼藏亚洲其他地区的生物标本，博物院设立研究室，先后出版多本专著。國府遷台前夕，该院的藏品大多被运出中国大陸，上海戰役後博物院由上海军管会接管，剩下的大部分藏品移交上海自然博物馆，博物館同時關閉。
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