二域系統（）是一种生物分类系统，它与现在最广为接受的三域系統不同，将所有生物分成两个域：细菌（Bacteria）和古菌（Archaea）。真核生物被视作古菌的一个分支。发现阿斯加德古菌之后，这个理论得到了有力的支持，因为遗传学证据表明阿斯加德古菌可能是真核生物的进化根源，真核生物应当划分为古菌的一个分支。
理论
新世紀的二域系統前便有雙域系統，在二戰前便有類似的尝试，但並未被廣泛接受。这种分类被称作。
真核生物起源于古菌
（上）與二域系統（下）]]
传统的三域系统假设真核生物与古菌关系更为密切，且与古菌为姊妹群。随着2000年代初更多新古菌的发现，这种区分变得模糊。在2004年，通过核糖体蛋白质测序和系统发育分析，研究人员认为古菌是真核生物的起源。 2007年对约6000个基因组的系统发育基因组分析也表明，真核生物起源于产甲烷菌（一种古菌）。
2008年，伦敦自然历史博物馆和纽卡斯尔大学的研究人员报告了对古菌、细菌和真核生物中53个基因的全面分析，这些基因包括核酸复制、转录和翻译机制的重要组成部分。结论是真核生物起源于古菌。2019年，Gergely J. Szöllősi领导的研究也得出了二域系统的结论。所进行的研究使用了3000多个基因家族。研究结论认为，真核生物很可能是由细菌进入宿主（很可能来自海姆达尔古菌）进化而来。
参考资料
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