Ascalaph Designer 是一套自由及開源的桌面分子建模與模擬軟體,由 Agile Molecule 開發,主要作者為 Alexey(Alexei)Nikitin。
它在單一 圖形使用者介面(GUI)中整合分子建模與視覺化、分子力學/分子動力學(MM/MD)、以及藉由外部量子化學程式(例如 CP2K 與 )進行的量子化學計算工作流程。
- 授權:GNU GPL v2。
- SourceForge 專案頁顯示最後更新日期為 2016-02-08。
- 在《Zoology》研究中,作者以 Ascalaph Designer 建立黏液相關化合物並以 Firefly/PC GAMESS 進行 ab initio 計算,後續進行分子動力學交互作用模擬。
- 在《European Polymer Journal》研究中,作者明確指出分子動力學模擬使用 Ascalaph Designer。
相關的分子動力學引擎文獻
- 的方法與程式設計曾以 Computer Physics Communications 論文形式發表(DOI: 10.1016/S0010-4655(99)00529-9)。
參見
- 分子動力學
- 計算化學
- 分子建模
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- AMBER
- GROMACS
- LAMMPS
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- CP2K
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外部連結
- (官方頁)
- (官方下載/版本資訊頁)
- (SourceForge 專案頁)
註釋
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