本列表中包括臺灣特有種及臺灣特有亞種，地域上的分布包括臺灣、龜山島、琉球嶼、綠島、蘭嶼、澎湖、金門、馬祖。

刺胞動物
六放珊瑚綱

• 臺灣蕈珊瑚 Fungia taiwanensis
• 柴山多杯孔珊瑚 Polycyathus chaishanensis 第一級保育類
• 福爾摩沙偽絲珊瑚 Pseudosiderastrea formosa 第一級保育類

八放珊瑚綱

• 桃園紅足軟珊瑚 Erythropodium taoyuanensis
• 南灣肉質軟珊瑚 Sarcophyton nanwanensis
• 澎湖指形軟珊瑚 Sinularia penghuensis
• 丘突指形軟珊瑚 Sinularia tumulosa
• 望安指形軟珊瑚 Sinularia wanannensis

節肢動物
昆蟲綱
蜻蛉目 Odonata
不均翅亞目 Anisoptera
*弓蜓科 Cordullidae
#耀沂弓蜓 Macromia chui Asahina, 1968
*勾蜓科（鬼蜓科） Cordulegastridae
#短痣勾蜓 Chlorogomphus brevistigma Oguma, 1926
*春蜓科（箭蜓科） Gomphidae
#南山春蜓 Stylurus takashii (Asahina, 1966)
#球角春蜓 Stylogomphus change Asahina, 1966
#紹德春蜓（指名亞種） Leptogomphus sauteri sauteri Ris, 1912
#紹德春蜓（嘉義亞種） Leptogomphus sauteri formosanus Matsumura, 1926
#鉸剪春蜓 Sinogomphus formosanus Asahina, 1951
#錘角春蜓 Stylogomphus shirozui shirozui Asahina, 1963
*晏蜓科（蜓科） Aeshnidae
#石垣晏蜓（台灣亞種） Planaeschna ishigakiana flavostria Yeh, 1996
#泰雅晏蜓 Aeshna petalura taiyal Asahina, 1938
#陽明晏蜓 Planaeschna taiwana Asahina, 1951
*蜻蜓科（蜻科） Libellulidae
#黃基蜻蜓 Sympetrum speciosum taiwanum Asahina, 1951
#褐基蜻蜓 Urothemis signata yiei Asahina, 1972

均翅亞目 Zygoptera
*幽蟌科 Euphaeidae
#短尾幽蟌 Bayadera brevicauda brevicauda Fraser, 1928
#短腹幽蟌 Euphaea formosa Hagen, 1869
*珈蟌科（色蟌科、河蟌科、川蜻蛉科） Calopterygidae
#中華珈蟌 Psolodesmus mandarinus McLachlan, 1870
*琵蟌科（扇蟌科） Platycnemididae
#黃尾琵蟌 Coeliccia flavicauda flavicauda Ris, 1912
*鼓蟌科（隼蟌科、鼻蟌科） Chlorocyphidae
#簾格鼓蟌 Aristocypha baibarana (Matsumura, 1931)

直翅目 Orthoptera

• 蝗科 Acrididae

* 南投佛蝗 Phlaeoba nantouensis*

• 叢蟋科 Eneopteridae

* Beybienkoana gregaria*
* Beybienkoana karnyi*
** 蟋蟀亞科 Gryllinae
** Comidoblemmus maculatus*

• 蟋螽科 Gryllacrididae

* Neanias magnus*
* Phryganogryllacris subrectis*

• 螻蛄科 Gryllotalpidae

* 臺中螻蛄 Gryllotalpa dentista*

• 穴螽科 Rhaphidophoridae

* 臺灣突灶螽 Diestramima taiwanensis*
* 芒灶螽 Diestrammena ingens*

* Rhaphidophora taiwana*

• 菱蝗科 Tetrigidae

* Euparatettix macrocephalus*

• 螽斯科 Tettigoniidae

** 草螽亞科 Conocephalinae
** 大草螽 Conocephalus gigantius*
** 蘭嶼索羅門螽 Salomona ogatai*
** 蛩螽亞科 Meconematinae
** Eoxizicus bifurcatus*
** 臺灣纖畸螽 Leptoteratura taiwana*
** 長尾新刺膝螽 Neocyrtopsis longicauda*
** 蘭嶼印棘螽 Neophisis kotoshoensis*
** 賽德克泰雅螽 Taiyalia sedequiana*
** 斯氏掩耳螽 Elimaea schenklingi*
** 悅鳴雙針蟋 Dianemobius jucundus*
** 木村雙針蟋 Dianemobius kimurae*
** 寬胸雙針蟋 Dianemobius protransversus*
** 烏來雙針蟋 Dianemobius wulaius*
** 長翅異針蟋 Pteronemobius caudatus*
** 臺灣砂灘蟋蟀 Taiwanemobius formosanus*

• 蚤蝗科 Tridactylidae

* Bruntridactylus formosanus*

半翅目 Hemiptera
*蟬科 Cicadidae
**蟬亞科 Cicadinae
***蟬族 Cicadini
***渡邊幽蟬 Semia watanabei*
***熊蟬族 Cryptotympanini
***臺灣蝦夷蟬 Auritibicen chujoi*
***黃緣蝦夷蟬 Auritibicen flavomarginatus*
***蘭嶼熊蟬 Cryptotympana kotoshoensis*
***蜩蟬族 Dundubiini
***可禮大蟬 Macrosemia kareisana*
***鵝公髻山寒蟬 Meimuna gakokizana*
***五指山寒蟬 Meimuna goshizana*
***諸聲寒蟬 Meimuna multivocalis*
***高砂長瓣蟬 Platylomia bivocalis*
***小蟬族 Leptopsaltriini
***高山姬春蟬 Euterpnosia alpina*
***翠峰姬春蟬 Euterpnosia ampla*
***阿里山姬春蟬 Euterpnosia arisana*
***棲蘭姬春蟬 Euterpnosia chilanensis*
***七星山姬春蟬 Euterpnosia chishingsana*
***細姬春蟬 Euterpnosia gina*
***頰黑姬春蟬 Euterpnosia hohoguro*
***北埔姬春蟬 Euterpnosia hoppo*
***恆春姬春蟬 Euterpnosia koshunensis*
***蘭嶼姬春蟬 Euterpnosia kotoshoensis*
***賴氏姬春蟬 Euterpnosia laii*
***寬尾姬春蟬 Euterpnosia latacauta*
***高士佛姬春蟬 Euterpnosia olivacea*
***新港山姬春蟬 Euterpnosia madawdawensis*
***水社姬春蟬 Euterpnosia suishana*
***太平姬春蟬 Euterpnosia varicolor*
***青面姬春蟬 Euterpnosia viridifrons*
***臺灣虎翅蟬 Formocicada taiwana*
***北埔蟬 Taiwanosemia hoppoensis*
***黃羽暮蟬 Tanna auripennis*
***阿里山紋翅暮蟬 Tanna infuscata*
***花蓮暮蟬 Tanna karenkonis*
***紋翅暮蟬 Tanna ornatipennis*
***鼈甲暮蟬 Tanna sayurie*
***陽明山暮蟬 Tanna sozanensis*
***大坪暮蟬 Tanna taipinensis*
***小暮蟬 Tanna viridis*
***恆春羽衣蟬 Vagitanus virescens*
***蟪蛄族 Platypleurini
***小蟪蛄 Platypleura takasagona*

*蠟蟬科 Fulgoridae
*臺灣錐頭蠟蟬 Saiva formosana*

*圓飛蝨科 Issidae
*臺灣球瓢蠟蟬 Hemisphaerius formosus*

*蝽科 Pentatomidae
*福爾摩沙厲蝽 Eocanthecona formosa*
*臺灣盲異蝽 Urolabida taiwanensis*
*顯褐脈盲異蝽 Urolabida suppressa*

*黽蝽科 Gerridae
*江崎氏東方黽蝽 Amemboa esakii*
*東方黽蝽 Amemboa fumi*
*闊黽蝽 Metrocoris esakii*

*龜蝽科 Plataspidae
*臺灣異龜蝽 Ponsilasia formosana*

*束蝽科 Colobathristidae
*臺灣突束蝽 Phaenacantha famelica*

竹節蟲目 Phasmida/Phasmatodea

• 長角枝竹節蟲科 Lonchodidae

* 六點瘤胸竹節蟲 Trachythorax sexpunctata*

• 竹節蟲科 Phasmatidae

* 旗山長肛竹節蟲 Entoria banshoryoensis*
* 基隆長肛竹節蟲 Entoria kiirunensis*
* 恆春長肛竹節蟲 Entoria koshunensis*
* 長蓋長肛竹節蟲 Entoria longiopercula*
* 臺北長肛竹節蟲 Entoria taihokuensis*
* 蘭嶼筒胸竹節蟲 Phasmotaenia lanyuhensis*

廣翅目 Megaloptera

• 魚蛉科 Corydalidae

* 暗色準魚蛉 Parachauliodes nebulosus*

蛇蛉目 Raphidioptera

• 盲蛇蛉科 Inocelliidae

* 臺灣盲蛇蛉 Inocellia taiwana*

• 蛇蛉科 Raphididae

* Mongoloraphidia caelebs*
* 臺灣蛇蛉 Mongoloraphidia formosana*
* Mongoloraphidia taiwanica*

脈翅目 Neuroptera

• 蛾蛉科 Ithonidae

* 臺灣山蛉 Rapisma taiwanense*

• 蟻蛉科 Myrmeleontidae

** 蟻蛉亞科 Myrmeleontinae
*** 樹蟻蛉族 Dendroleontini
*** 少紋蟻蛉 Dendroleon esbenpeterseni*
*** 麗紋蟻蛉 Gatzara petrophila*
*** 蟻蛉族 Myrmeleontini
*** 白斑蟻蛉 Baliga asakurae*
*** 褐跗蟻蛉 Myrmeleon alticolus*
*** 海氏蟻蛉 Myrmeleon heppneri*
*** 胸紋蟻蛉 Myrmeleon littoralis*
*** 臀腋蟻蛉 Myrmeleon persimilis*
*** 沙阱蟻蛉 Myrmeleon punctinervis*
*** 王氏蟻蛉 Myrmeleon wangi*
*** 無脈蟻蛉族 Nemoleontini
*** 稀斑蟻蛉 Distoleon formosanus*
*** 粗腿蟻蛉 Distoleon littoralis*
*** 姬彎爪蟻蛉 Paraglenurus lotzi*

鱗翅目 Lepidoptera
蝶 Rhopalocera
*灰蝶科 Lycaenidae
**翠灰蝶亞科 Theclinae
***虎灰蝶族 Aphnaeini
*#蓬萊虎灰蝶 Spindasis kuyanianus* (Matsumura)
***玳灰蝶族 Deudorigini
*#高砂燕灰蝶 Rapala takasagonis* (Matsumura)
***洒灰蝶族 Eumaeini
*#田中洒灰蝶 Satyrium tanakai* (Shirozu)
*#江崎洒灰蝶 Satyrium esakii* (Shirozu)
*#渡氏烏灰蝶 Fixsenia watarii* (Matsumura)
***瑤灰蝶族 Iolaini
*#褐翅青灰蝶 Tajuria caeruela* Nire
***翠灰蝶族 Theclini
*#台灣焰灰蝶 Japonica patungkoanui* Murayama
*#台灣榿翠灰蝶 Neozephyrus taiwanus* (Wileman)
*#台灣鐵灰蝶 Teratozephyrus yugaii* (Kano)
*#夸父璀灰蝶 Sibataniozephyrus kuafui* Hsu & Lin
*#西風翠灰蝶 Chrysozephyrus nishikaze* (Araki & Sibatani)
*#清金翠灰蝶 Chrysozephyrus yuchingkinus* Murayama & Shimonoya
*#單線翠灰蝶 Chrysozephyrus splendidulus* Murayama & Shimonoya
***鑽灰蝶族 Horagini
*#拉拉山鑽灰蝶 Horaga rarasana* Sonan
**銀灰蝶亞科 Curetinae
*#台灣銀灰蝶 Curetis brunnea* Wileman
***藍灰蝶族 Polyommatini
*#臺灣玄灰蝶 Tongeia hainani* (Bethune-Baker)
*#白雀斑灰蝶 Phengaris daitozana* Wileman
*弄蝶科 Hesperiidae
**弄蝶亞科 Hesperiinae
#台灣脈弄蝶 Thoressa horishana* (Matsumura)
#台灣赭弄蝶 Ochlodes formosanus* (Matsumura)
#奇萊孔弄蝶 Polytremis kiraizana* (Sonan)
#韋氏黃斑弄蝶 Potanthus wilemanni* (Evans)
#萬大弧弄蝶 Aeromachus bandaishanus* Murayama & Shimonoya
#墨子黃斑弄蝶 Potanthus motzui * Hsu, Li & Li
#霧社弧弄蝶 Aeromachus matudai* (Murayama)
**花弄蝶亞科 Pyrginae
#台灣窗弄蝶 Coladenia pinsbukana* (Shimonoya & Murayama)
#台灣瑟弄蝶 Seseria formosana* (Fruhstorfer)
#台灣颯弄蝶 Satarupa formosibia* (Strand)
#埔里星弄蝶 Celaenorrhinus horishanus* (Shirozu)
#黑澤星弄蝶 Celaenorrhinus kurosawai* (Shirozu)
#魑魅星弄蝶 Celaenorrhinus chihhsiaoi* (Hsu)
*粉蝶科 Pieridae
**黃粉蝶亞科 Coliadinae
***端粉蝶族 Colotini
*#台灣鉤粉蝶 Gonepteryx taiwana* Paravicini
*蛺蝶科 Nymphalidae
**眼蝶亞科 Satyrinae
#王氏波眼蝶 Ypthima wangi* Lee
#台灣黛眼蝶 Lethe mataja* Fruhstorfer
#永澤蛇眼蝶 Minois nagasawae* Matsumura
#玉山幽眼蝶 Zophoessa niitakana* Matsumura
#白帶波眼蝶 Ypthima akragas* Fruhstorfer
#江崎波眼蝶 Ypthima esakii* Shirozu
#狹翅波眼蝶 Ypthima angustipennis* Takahashi
#寶島波眼蝶 Ypthima formosana* Fruhstorfer
**蛺蝶亞科 Nymphalinae
***翠蛺蝶族 Euthaliini
#台灣翠蛺蝶 Euthalia formosana* Fruhstorfer
#馬拉巴翠蛺蝶 Euthalia malapana* Shirozu & Chung
***線蛺蝶族 Limenitini
#無邊環蛺蝶 Neptis reducta* Fruhtorfer
#蓬萊環蛺蝶 Neptis taiwana * Fruhstorfer
**螯蛺蝶亞科 Charaxinae
***閃蛺蝶族 Apaturini
*#台灣燦蛺蝶 Sephisa daimio* Matsumura
*#普氏白蛺蝶 Helcyra plesseni* (Fruhstorfer)
*鳳蝶科 Papilionidae
**鳳蝶亞科 Papilioninae
***裳鳳蝶族 Troidini
*#曙鳳蝶 Atrophaneura horishana* (Matsumura)
***鳳蝶族 Papilionini
*#台灣鳳蝶 Papilio thaiwanus* Rothschild
*#台灣寬尾鳳蝶 Agehana maraho* (Shiraki & Sonan)
*#雙環翠鳳蝶 Papilio hopponis* Matsumura
*#台灣琉璃翠鳳蝶（琉璃紋鳳蝶）　Papilio hermosanus* Rebel

蛾 Heterocera

• 草螟科 Crambidae

** 草螟亞科 Crambinae
** 雙紋細草螟 Roxita bipunctella*
** 蕨螟亞科 Musotiminae
** Ambia magnificalis*
** 黑珀蕨螟 Ambia melanistis*
** 野螟亞科 Pyraustinae
** Achyra takowensis*
** 阿里山黑帶野螟 Parbattia arisana*
** 斑野螟亞科 Spilomelinae
*** 絹鬚野螟族 Margaroniini
*** 吉爾卡絹野螟 Glyphodes chilka*
*** 彎囊絹鬚野螟 Palpita hypohomalia*
*** 纓突野螟族 Udeini
*** 大禹嶺紅痣纓突野螟 Udea stigmatalis tayulingensis*

• 裳蛾科 Erebidae

** 燈蛾亞科 Arctiinae
*** 燈蛾族 Arctiini
*** 三條橙燈蛾 Lemyra alikangensis*
*** 褐污橙燈蛾 Lemyra fallaciosa*
*** 石塚氏橙燈蛾 Lemyra ishizukai*
*** 寥點橙燈蛾 Lemyra moltrechti*
*** 臺灣望橙燈蛾 Lemyra nigricosta*
*** 湯馬士氏望橙燈蛾 Lemyra wernerthomasi*
*** 苔蛾族 Lithosiini
*** 丁嘉異美苔蛾 Aberrasine dingjiai*
*** 禮正異葩苔蛾 Aberrasine lichenshihi*
*** 井上氏繡苔蛾 Asuridia inouei*
*** 岸田氏繡苔蛾 Asuridia kishidai*
*** 露繡苔蛾 Asuridia rubripennis*
*** 士緯繡苔蛾 Asuridia wushipheri*
*** 褐白袍苔蛾 Barsura albidorsalis*
*** 南投黃緣苔蛾 Diduga nantouensis*
*** 臺灣黃緣苔蛾 Diduga taiwana*
*** 埔里松村葩苔蛾 Matsumursine horishanella*
*** 鹿蛾族 Syntomini
*** 黃頸鹿蛾 Amata edwardsii formosensis*
*** 三環大斑鹿蛾 Amata formosensis*
*** 橫斑鹿蛾 Amata issikii*
*** 三環小斑鹿蛾 Amata nigrifrons*
*** 大鹿蛾 Amata rantaisana*
*** 五斑小鹿蛾 Amata shirakii*
*** T紋透翅鹿蛾 Amata t-nigra*
*** 透翅鹿蛾 Amata wilemani*
*** 平斑鹿蛾 Caeneressa alikangiensis*
*** 豐采鹿蛾 Euchromia elegantissima formosana*
** 裳蛾亞科 Erebinae
*** 裳蛾族 Catocalini
*** 長野氏裳蛾 Catocala naganoi*
*** 白水氏裳蛾 Catocala shirozui*
*** 閃裳蛾族 Sypnini
*** 寶島朋閃裳蛾 Hypersypnoides formosensis*
** 毛足裳蛾亞科 Herminiinae
** Naarda blepharota*
** 灰奈裳蛾 Naarda cinerea*
** Naarda digitata*
** 旭宏奈裳蛾 Naarda hsuhonglini*
** Naarda nigrissima*
** 褐點奈裳蛾 Naarda ochronota*
** Naarda picata*
** Naarda secreta*
** 陽刺奈裳蛾 Naarda spinivesica*
** Naarda variegata*
** 毒蛾亞科 Lymantriinae
*** 毒蛾族 Lymantriini
*** 深山灰毒蛾 Lymantria pulverea*
*** 杉氏絡毒蛾 Lymantria sugii*
*** 古毒蛾族 Orgyiini
*** 阿里山麗毒蛾 Calliteara arizana*
*** 織結麗毒蛾（臺灣亞種） Calliteara contexta kezukai*
*** 埔里麗毒蛾 Calliteara horishanella*
*** 韋氏棕毒蛾 Ilema wilemani*
*** 接麗毒蛾 Calliteara saitonis*
*** 水社寮斑毒蛾 Olene suisharyonis*

• 篩蛾科 Ethmiidae

* 長棘篩蛾 Ethmia anfracta*
* 八斑篩蛾 Ethmia octanoma*
* 扇平篩蛾 Ethmia penesella*
* 國姓篩蛾 Ethmia susa*
* 寡斑篩蛾 Ethmia zygospila*

• 帶蛾科 Eupterotidae

* 阿里山帶蛾 Apha arisana*
* 埔里帶蛾 Apha horishana*
* 灰帶蛾 Apona fuliginosa*
* 灰紋帶蛾 Ganisa formosicola*
* 黑胸帶蛾 Palirisa cervina formosana*

• 尺蛾科 Geometridae

** 枝尺蛾亞科 Ennominae
*** 齒紋尺蛾族 Boarmiini
*** 鞍馬山霜尺蛾 Alcis anmashanensis*
*** 臺灣後眉尺蛾 Jankowskia taiwanensis*
*** 合歡橄欖花尺蛾 Paradarisa hehuana*
*** 族未定
*** 黃帶朱色彩斑尺蛾 Achrosis pulchra*
** 青尺蛾亞科 Geometrinae
*** 無繮青尺蛾族 Hemistoliti
*** 傅氏無繮青尺蛾 Hemistola fui*
*** 黃緣無繮青尺蛾 Hemistola monotona*
*** 雲杉無繮青尺蛾 Hemistola piceacola*
*** 臺灣無繮青尺蛾 Hemistola taiwanensis*
*** 突尾尺蛾族 Joditi
*** 巒大山突尾尺蛾 Jodis rantaizanensis*
*** 盧山尖尾尺蛾 Maxates acutigoniata*
*** 巴陵尖尾尺蛾 Maxates extrambigua*
*** 平波尖尾尺蛾 Maxates microdonta*
*** 黃星尖尾尺蛾 Maxates lactipuncta*
*** 隱紋尖尾尺蛾 Maxates quadripunctata*
*** 紅臉尖尾尺蛾 Maxates rufolimbata*
*** 齒紋尖尾尺蛾 Maxates sinuolata*
*** 突緣尖尾尺蛾（指名亞種） Maxates versicauda versicauda*
** 波尺蛾亞科 Larentiinae
*** 族 Chesiadini
*** 臺灣盜尺蛾 Docirava flavilinata*
*** 族 Dyspteridini
*** 迷四斑波尺蛾（臺灣亞種） Heterophleps confusa punkikonis*
*** 臺灣四斑波尺蛾 Heterophleps taiwana*
*** 白線四斑波尺蛾 Heterophleps variegata*
*** 垂線四斑波尺蛾 Heterophleps violescens*
*** 球果尺蛾族 Eupitheciini
*** 蘭嶼扳手波尺蛾 Ziridava orchidensis*
*** 毛翅尺蛾族 Trichopterygini
*** 雅夷尺蛾 Esakiopteryx venusta*
*** 花蓮洱尺蛾 Trichopterigia adorabilis*
*** 傅氏洱尺蛾 Trichopterigia fui*
*** 明毛翅尺蛾 Trichopterigia fusconotata*
*** 緣點洱尺蛾 Trichopterigia kishidai*
*** 白點洱尺蛾 Trichopterigia nivocellata*
*** 天池洱尺蛾 Trichopterigia tianchii*
*** 矢崎氏洱尺蛾 Trichopterigia yazakii*
*** 妖洱尺蛾 Trichopterigia yoshimotoi*
** 星尺蛾亞科 Oenochrominae
** 顏氏沙尺蛾 Sarcinodes yeni*
** 枝尺蛾亞科 Ennominae
** 張氏尾尺蛾 Ourapteryx changi*

• 折角蛾科 Lecithoceridae

** 瘤折角蛾亞科 Torodorinae
** 卵斑塊三角折角蛾 Deltoplastis ovatella*
** 玉山首秀折角蛾 Halolaguna rafikana*
** 臺灣秀折角蛾 Halolaguna taiwana*
** Torodora albicruris*
** Torodora capillaris*
** 溪南山瘤折角蛾 Torodora chinanensis*
** 梅峰瘤折角蛾 Torodora meifengensis*
** 芹影瘤折角蛾 Torodora minari*
** Torodora parasciadosa*
** Torodora parthenopis*
** 屏東瘤折角蛾 Torodora pingtungensis*
** 黑帶瘤折角蛾 Torodora umbriella*

• 刺蛾科 Limacodidae

* 小杉綠刺蛾 Caiella pygmy*
* 河田氏枯刺蛾 Mahanta kawadai*

• 夜蛾科 Noctuidae

** 虎夜蛾亞科 Agaristinae
** 岸田絢虎夜蛾 Alloasteropetes olivacea*
** 大白斑虎蛾 Chelonomorpha formosana formosana*
** 五斑虎蛾 Exsula albomaculata*
** 苔蘚夜蛾亞科 Bryophilinae
** 臺灣異綠蘚夜蛾 Stenoloba assimilis taiwana*
** 明蘚夜蛾 Stenoloba clarescens*
** Stenoloba domina*
** 地衣綠蘚夜蛾 Stenoloba lichenosa*
** 曼雷綠蘚夜蛾 Stenoloba manleyi formosana*
** 暗基綠蘚夜蛾 Stenoloba nigrabasalis*
** 橄欖綠蘚夜蛾 Stenoloba olivacea*
** 青蘚夜蛾 Stenoloba nora*
** 橙緣綠蘚夜蛾 Stenoloba rufosagitta*
** 硯敏綠蘚夜蛾 Stenoloba yenminia*
** 夜蛾亞科 Noctuinae
*** 夜蛾族 Noctuini
*** 臺灣地老虎 Agrotis taiwana*
*** 綠叉組夜蛾 Anaplectoides fuscivirens*
*** 藍綠組夜蛾 Anaplectoides inouei*
*** 半叉組夜蛾 Anaplectoides semivirens*
*** 黃炎歹夜蛾 Diarsia arenosoides*
*** 煙歹夜蛾 Diarsia carnipennis*
*** 黑褐歹夜蛾 Diarsia cia*
*** 寶島歹夜蛾 Diarsia formosensis*
*** 黑帶歹夜蛾 Diarsia nigrafasciata*
*** 黑點歹夜蛾 Diarsia nigrosigna*
*** 曲紋歹夜蛾 Diarsia sinuosa*
*** 灰褐歹夜蛾 Diarsia subtincta*
*** 紅褐歹夜蛾 Diarsia taidactyla*
*** 黃褐歹夜蛾 Diarsia unica*
*** 吉本歹夜蛾 Diarsia yoshimotoi*
*** 寶島狹翅夜蛾 Hermonassa formontana*
*** 半圓狹翅夜蛾 Hermonassa hemicyclia*
*** 浮狹翅夜蛾 Hermonassa inconstans*
*** 雷氏狹翅夜蛾 Hermonassa legraini*
*** 普氏狹翅夜蛾 Hermonassa plantei*
*** 蓬萊鐵色夜蛾 Himachalia formosana*
*** 高山擬狹翅夜蛾 Pseudohermonassa owadai*
*** 遙扇夜蛾 Sineugraphe elkalandozta*
*** 褐紋魯夜蛾 Xestia csoevarii*
*** 臺彩魯夜蛾 Xestia enyachangae*
*** 淡黃魯夜蛾 Xestia flavilinea*
*** 黛紫魯夜蛾 Xestia supravidua*
*** 繁縷魯夜蛾 Xestia tamsi*
*** 山根魯夜蛾 Xestia yamanei*

• 瘤蛾科 Nolidae

** 瘤蛾亞科 Nolinae
** 吉本氏明瘤蛾 Casminola yoshimotoi*
** Manoba suffusata*
** 建明瘤蛾 Nola chienmingfui*
** 中赭帶瘤蛾 Nola danii*
** 美鈴瘤蛾 Nola meilingchani*
** 士緯瘤蛾 Nola shipherwui*
** 白襯瘤蛾亞科 Chloephorinae
** 花布麗瘤蛾 Camptoloma carum*
** 小翠瘤蛾 Hylophilodes esakii*
** 長翅粉翠瘤蛾 Hylophilodes rara*
** 太平粉翠瘤蛾 Hylophilodes tsukusensis*
** 臺灣裁瘤蛾 Pterogonia taiwanensis*

• 舟蛾科 Notodontidae

** 舟蛾亞科 Notodontinae
** 鹿枝背舟蛾 Harpyia formosicola*
** 黯翅白頸異齒舟蛾（臺灣亞種） Hexafrenum leucodera yamamotoi*
** 斑白頸異齒舟蛾 Hexafrenum maculifer*
** 金舟蛾亞科 Spataliinae
** 宇老荻舟蛾 Dypna yulaonensis*
** 錦舟蛾 Ginshachia elongata*
** 達邦繁花舟蛾 Mangea dabanga*
** 雙星繁花舟蛾 Mangea gemina*
** 異舟蛾亞科 Thaumetopoeinae
** 白雪舟蛾 Gazalina purificata*

• 透翅蛾科 Sesiidae

** 透翅蛾亞科 Sesiinae
** 黃帶新透翅蛾 Synanthedon auritincta*
** 擬黃帶新透翅蛾 Synanthedon auritinctaoidis*
** 流星新透翅蛾 Synanthedon ceraunus*
** 霧社新透翅蛾 Synanthedon mushana*
** 鳳凰新透翅蛾 Synanthedon phoenix*
** 素華新透翅蛾 Synanthedon suhua*

• 斑蛾科 Zygaenidae

** 螢斑蛾亞科 Chalcosiinae
** 紅帶鉗尾斑蛾 Achelura sanguifasciata*
** 蓬萊薄翅斑蛾 Agalope formosana*
** 花蓮薄翅斑蛾 Agalope pica*
** 三斑薄翅斑蛾 Agalope trimacula*
** 王氏薄翅斑蛾 Agalope wangi*
** 小斑蛾亞科 Procridinae
** 合歡山亮腹狹翅斑蛾 Arachotia hohuanshanensis*
** 鹿野氏藍紋斑蛾 Clelea kanoi*
** 普臺藍紋斑蛾 Clelea simplicior*
*** Argopus chiui*
*** Argopus formosanus*
*** Argopus miyakei*
*** Aphthona laetoides*
*** 臺灣側刺葉蚤 Aphthona taiwana*
*** Aphthonoides lesagei*
*** 臺灣長刺葉蚤 Aphthonoides taiwanicus*
*** Asiorestia taiwana*
*** 黑緣布魯葉蚤 Burumoseria yuae*
*** Euphitrea flavicornis*
*** Euphitrea taiwana*
*** Halticorcus miwai*
*** Halticorcus saigusai*
*** Halticorcus sasajii*
*** Halticorcus smetanai*
*** Hemipyxis apicicostata*
*** Hemipyxis flavipes*
*** 蓬萊溝腳葉蚤 Hemipyxis formosana*
*** Hemipyxis fulvoculata*
*** Hemipyxis lineata*
*** Hemipyxis liukueiana*
*** Hemipyxis persimilis*
*** Hemipyxis rarashana*
*** Hemipyxis taihorinensis*
*** 武田溝腳葉蚤 Hemipyxis takedai*
*** 黑緣溝腳葉蚤 Hemipyxis yasumatsui*
*** Hespera montana*
*** Ivalia bella*
*** Ivalia uenoi*
*** Lanka bicolor*
*** Lanka minor*
*** Lanka nigra*
*** Lipromela formosana*
*** Lipromorpha montana*
*** Lipromorpha shirozui*
*** 阿里山長跗葉蚤 Longitarsus arisanus*
*** 雙色長跗葉蚤 Longitarsus bicoloriceps*
*** 黃角藍長跗葉蚤 Longitarsus chujoi*
*** 合歡山長跗葉蚤 Longitarsus hohuanshanus*
*** 石川長跗葉蚤 Longitarsus ishikawai*
*** Longitarsus nakanei*
*** Longitarsus taiwanicus*
*** Longitarsus waltherhorni*
*** Luperomorpha kurosawai*
*** Luperomorpha saigugai*
*** 佐佐木寡毛葉蚤 Luperomorpha sasajii*
*** 黃腹瘦葉蚤 Mandarella flaviventris*
*** 上野瘦葉蚤 Mandarella uenoi*
*** 通條木瘦葉蚤 Mandarella tsoui*
*** Trachytetra takizawai (=Zipangia recticollis*)
*** 族 Anisoderini
*** 長筒鐵甲蟲 Lasiochila bicolor*
*** 鋸龜金花蟲族 Basiprionotini
*** 大黃龜金花蟲 Basiprionota angusta*
*** 族 Botryonopini
*** Botryonopa bicolor*
*** 族 Callispini
*** 端白麗扁鐵甲蟲 Callispa houjayi*
*** 紅胸麗扁鐵甲蟲 Callispa tsoui*
*** 龜金花蟲族 Cassidini
*** Thlaspida tsaoi*
*** 族 Gonophorini
*** Agoniella sonani*
*** 三色脈翅鐵甲蟲 Agonita tricolor*
*** 黑脈翅鐵甲蟲 Agonita unicolor*
*** 鐵甲蟲族 Hispini
*** Asamangulia horni*
*** 嘉義鐵甲蟲 Dactylispa chiayiana*
*** 中條鐵甲蟲 Dactylispa chujoi*
*** 島嶼鐵甲蟲 Dactylispa insulicola*
*** Dactylispa kumatai*
*** 波緣鐵甲蟲 Dactylispa latipennis*
*** 宮本鐵甲蟲 Dactylispa miyamotoi*
*** 臺灣鐵甲蟲 Dactylispa taiwana*
*** 黑鐵甲蟲 Hispellinus callicanthus*
*** Rhoptrispa dilaticornis*
*** 小扁鐵甲蟲族 Leptisini
*** 三輪氏小扁鐵甲蟲 Leptispa miwai*
*** 瘤龜金花蟲族 Notosacanthini
*** Notosacantha arisana*
*** 紹德瘤龜金花蟲 Notosacantha sauteri*
*** Notosacantha shibatai*
*** 族 Oncocephalini
*** 厚潔方鐵甲蟲 Prionispa houjayi*
*** Oncocephala formosana*
** 金花蟲亞科 Chrysomelinae
*** 金花蟲族 Chrysomelini
*** 一色肥腳金花蟲 Gonioctena issikii*
*** 上川肥腳金花蟲 Gonioctena kamikawai*
*** 大澤肥腳金花蟲 Gonioctena osawai*
*** Odontoedon taiwanus*
*** 山桐子金花蟲 Plagiosterna maculicollis insularis**
*** 族 Doryphorini
*** 清金榆金花蟲 Ambrostoma chinkinyui*
** 窄頸金花蟲亞科 Criocerinae
*** 窄頸金花蟲族 Criocerini
*** 三輪氏長頸金花蟲 Lilioceris miwai*
*** 細頸金花蟲族 Lemini
*** 枸杞細頸金花蟲 Lema decempunctata*
*** Lema esakii*
*** 藍翅細頸金花蟲 Lema fortunei*
*** 恆春細頸金花蟲 Lema koshunensis*
*** Ortholema gracilenta*
** 筒金花蟲亞科 Cryptocephalinae
*** 族 Clytrini
*** Aetheomorpha sauteri*
*** 筒金花蟲族 Cryptocephalini
*** Coenobius babai*
*** Coenobius breveoculatus*
*** Coenobius chujoi*
*** Coenobius collaris*
*** 藍溝胸姬筒金花蟲 Coenobius endoi*
*** Coenobius flavescens*
*** Coenobius kaohsiungensis*
*** 紅胸姬筒金花蟲 Coenobius taiwanus*
*** Coenobius yosionis*
*** Cryptocephalus hamifasciatus*
*** Cryptocephalus hiro*
*** Cryptocephalus hohuanshanus*
*** 縱條黃筒金花蟲 Cryptocephalus kanoi*
*** Cryptocephalus kiyoyamai*
*** Cryptocephalus makii*
*** Cryptocephalus mitchyi*
*** 黃紋筒金花蟲 Cryptocephalus moya*
*** Cryptocephalus nigronotaticollis*
*** 華麗筒金花蟲 Cryptocephalus nitidissimus*
*** Cryptocephalus nitobei*
*** 黃腹藍筒金花蟲 Cryptocephalus ruri*
*** Cryptocephalus sauteri*
*** 黑白筒金花蟲 Cryptocephalus solus*
*** 臺灣筒金花蟲 Cryptocephalus taiwanus*
*** 蓬萊齒爪筒金花蟲 Melixanthus formosensis*
*** 黃胸齒爪筒金花蟲 Melixanthus tubu*
*** Smaragdina apiciflava*
*** 大八星長筒金花蟲 Smaragdina kuromon*
*** 縱條長筒金花蟲 Smaragdina kurosuji*
*** Smaragdina maculicollis*
*** 三宅長筒金花蟲 Smaragdina miyakei*
*** Smaragdina miyatakei*
*** 卵黃長筒金花蟲 Smaragdina nomurai*
*** 八星長筒金花蟲 Smaragdina octomaculata*
*** 異紋長筒金花蟲 Smaragdina variabilis*
*** Tituboea ohbayashii*
** 猿金花蟲亞科 Eumolpinae
*** 族 Bromiini
*** 六斑毛猿金花蟲 Aoria quinquemaculta*
*** Demotina alni*
*** Demotina decoratella*
*** Demotina incostata*
*** Demotina montana*
*** Fidia shirozui*
*** Hyperaxis nigrescens*
*** 池端金毛猿金花蟲 Trichochrysea chihtuana*
*** 臺灣金毛猿金花蟲 Trichochrysea okinawana taiwana*
*** Xanthonia striatipennlis*
*** Xanthonia taiwana*
*** 猿金花蟲族 Eumolpini
*** Colaspoides okumai*
*** Colaspoides persicariae*
*** Colaspoides sauteri*
*** 臺灣卵猿金花蟲 Colaspoides taiwanaus*
*** 紫豔大猿金花蟲 Platycorynus sauteri*
*** 族 Typophorini
*** 毛胸溝腳猿金花蟲 Basilepta cornuta*
*** Basilepta elegans*
*** Basilepta issikii*
*** Basilepta sublateralis*
*** 脈翅溝腳猿金花蟲 Basilepta varians*
*** Nodina issikii*
*** Nodina sauteri*
*** 蓬萊島嶼猿金花蟲 Rhyparida formosana*
*** 蘭嶼島嶼猿金花蟲 Rhyparida kotoensis*
** 螢金花蟲亞科 Galerucinae
*** 族 Galerucini
*** 條背缺翅螢金花蟲 Apterogaleruca hirtihumeralis*
*** 上野缺翅螢金花蟲 Apterogaleruca uenoi*
*** Hirtigaleruca aptera*
*** 陳氏裸螢金花蟲 Lochmaea cheni*
*** 玉山裸螢金花蟲 Lochmaea jungchani*
*** 杜鵑裸螢金花蟲 Lochmaea lesagei*
*** 雪山裸螢金花蟲 Lochmaea smetanai*
*** 曹氏裸螢金花蟲 Lochmaea tsoui*
*** 朝氏梅螢金花蟲 Menippus asahinai*
*** Mimastracella bicolor*
*** 端黃裸胸螢金花蟲 Mimastracella flavomargianata*
*** 嘉理斯毛螢金花蟲 Pyrrhalta gressitti*
*** 伊賀毛螢金花蟲 Pyrrhalta igai*
*** 石原毛螢金花蟲 Pyrrhalta ishiharai*
*** Pyrrhalta kobayashii*
*** 梅峰毛螢金花蟲 Pyrrhalta meifena*
*** Pyrrhalta ohbayashii*
*** 白水毛螢金花蟲 Pyrrhalta shirozui*
*** 臺灣毛螢金花蟲 Pyrrhalta taiwana*
*** 瀧澤毛螢金花蟲 Pyrrhalta takizawai*
*** 曹氏毛螢金花蟲 Pyrrhalta tsoui*
*** 皺翅綠毛螢金花蟲 Pyrrhalta viridipennis*
*** 族 Hylaspini
*** 黃腹藍豔螢金花蟲 Arthrotus abdominalis*
*** Arthrotus fulvus*
*** Arthrotus gressitti*
*** 平島豔螢金花蟲 Arthrotus hirashimai*
*** 中根豔螢金花蟲 Arthrotus nakanei*
*** Arthrotus saigusai*
*** Arthrotus shibatai*
*** 三色豔螢金花蟲 Arthrotus tricolor*
*** 藍黑豔擬守瓜 Dercetina itoi*
*** 白水綠豔擬守瓜 Dercetina shirozui*
*** 紹德廣螢金花蟲 Gallerucida sauteri*
*** 白水廣螢金花蟲 Gallerucida shirozui*
*** 榕二星螢金花蟲 Morphosphaera bimaculata*
*** Proegmena taiwana*
*** 族 Luperini
*** Adiscus apicalis*
*** Adiscus arisanus*
*** Adiscus issikii*
*** Adiscus longicornis*
*** Adiscus matudai*
*** Adiscus mediofulvus*
*** Adiscus melanopterus*
*** Adiscus nigromaculatus*
*** Adiscus osawai*
*** Adiscus sauteri*
*** Adiscus sungkangensis*
*** 臺灣胖筒金花蟲 Adiscus taiwanus*
*** 周氏琉璃擬守瓜 Agetocera choui*
*** 大琉璃擬守瓜 Agetocera discedens*
*** 花東琉璃擬守瓜 Agetocera huatungensis*
*** 臺灣琉璃擬守瓜 Agetocera taiwans*
*** 素芳琉璃擬守瓜 Agetocera yuae*
*** 斑胸翠螢金花蟲 Apophylia asahinai*
*** 黑翠螢金花蟲 Apophylia miyamotoi*
*** 蘭嶼黃守瓜 Aulacophora kotoensis*
*** 鈍色守瓜 Aulacophora opacipennis*
*** 黃腳翠螢金花蟲 Apophylia velai*
*** 黑額盔螢金花蟲 Cassena sasajii*
*** Calomicrus collaris*
*** 黃褐姬豔螢金花蟲 Calomicrus jungchangi*
*** Calomicrus kurosawai*
*** Calomicrus minutissimus*
*** 陳氏直守瓜 Clerotilia cheni*
*** 蓬萊直守瓜 Clerotilia formosana*
*** 紅頸長刺螢金花蟲 Neochya hirashimai*
** 廣肩金花蟲亞科 Megalopodinae
** Temnaspis elegans (=Colobaspis elegans*)
** 亞科 Anthribinae
*** 族 Allandrini
*** Plintheria diversa*
*** 族 Corrhecerini
*** Penestica brevis brevis*
*** 族 Discotenini
*** Autotropis fulvescens*
*** Autotropis modesta conspersa*
*** Autotropis modesta rugulosa*
*** Autotropis montana taiwana*
*** 族 Phloeophilini
*** Bothrus taiwanus*
*** 族 Platyrhinini
*** Apatenia infans*
*** Hypseus angulatus*
*** Hypseus arcifer*
*** Phaulimia vicina*
*** 族 Ptychoderini
*** Mecotropis taiwanus*
*** 族 Sintorini
*** Sintor fasciatus*
*** Sintor pustulatus*
*** 族 Tophoderini
*** Derisemias taiwanus*
*** 族 Tropiderini
*** Acorynus luzonicus lanhsuanus*
*** Cedus amabilis*
*** Cedus diversus*
*** Cedus prominens*
*** Litocerus bicuspis*
*** Litocerus disallus*
*** Litocerus tokarensis yoshimii*
*** Litocerus tuberculatus*
*** Nessiodocus trifasciatus*
*** Tropideres nanus*
*** Tropideres roelofsi poecilus*
*** 族 Xylinadini
*** Xylinada phycus*
*** 族 Zygaenodini
*** Atinellia affinis*
*** Atinellia signata*
*** Atinellia tessellata*
*** Atinellia variegata*
*** Exechesops frontalis*
*** Illis elisa*
*** Rhaphitropis carinata*
*** Rhaphitropis cylindrica*
*** Rhaphitropis guttifer taiwanus*
*** Rhaphitropis pigmaea*
** 亞科 Apolectinae
** Apolecta paraplesia*
** 亞科 Choraginae
*** 族 Araecerini
*** Araecerus siliquae*
*** Deropygus grammicus*
*** Deropygus niger*
*** Valenfriesia deropygoides*
*** 族 Choragini
*** Choragus brevior*
*** Choragus distendens*
*** 族 Stenorhinini
*** Stenorhis bifoveolatus*
*** Stenorhis cylindratus*

• 捲葉象鼻蟲科 Attelabidae

*** 斷紋球背象鼻蟲 Pachyrhynchus nobilis yamianus*
*** 大圓斑球背象鼻蟲 Pachyrhynchus sarcitis kotoensis* 第二級保育類
*** 條紋球背象鼻蟲 Pachyrhynchus sonani* 第二級保育類
*** 小圓斑球背象鼻蟲 Pachyrhynchus tobafolius* 第二級保育類
*** 族 Sitonini
*** Eugnathus cleroides*
*** 族 Tanymecini
*** Megamecus misellus*
** 亞科 Lixinae
*** 族 Lixini
*** Gasteroclisus rufitibialis (=Lixus rufitibialis*)
** 亞科 Molytinae
*** 族 Aedemonini
*** Mechistocerus thaiwanus*
*** 族 Gasterocercini
*** Orochlesis anteplagiata*
*** 族 Mecysolobini
*** Merus konoi*
*** Merus yoshidai*
*** 族 Molytini
*** Dysceroides bipustulatus*
*** Euthycus excisus*
*** Hylobius niitakensis niitakensis*
*** Kobuzo kikuchii*
*** Morimotodes polynices*
*** Pimelocerus kanoi*
*** Pimelocerus minowai*
*** Pimelocerus orientalis formosanus*
*** 族 Paipalesomini
*** Peribleptus bipustulatus*
*** 族 Psepholacini
*** Therebus orthocnemis*
*** 族 Trachodini
*** Acicnemis biarcuata*
*** Acicnemis bickhardti*
*** Acicnemis cruciata*
*** Acicnemis nobilis*
*** 族 Trigonocolini
*** Trigonocolus alternans*
** 長小蠹亞科 Platypodinae
*** 族 Platypodini
*** 紹德截尾長小蠹 Crossotarsus sauteri*
*** 阿里山長小蠹 Platypus arisannensis*
*** 木材長小蠹 Platypus dasycauda*
*** 埔里長小蠹 Platypus horishensis*
*** 彎弓長小蠹 Platypus lunatulus*
*** 番石榴長小蠹 Platypus niijimai*
*** 龍腦香長小蠹 Platypus obtusipennis*
*** 八齒長小蠹 Platypus octodentatus*
*** 橡樹長小蠹 Platypus querci*
*** 太平山長小蠹 Platypus taiheizanensis*
*** 松徨長小蠹 Treptoplatypus xylographus*
*** 族 Tesserocerini
*** V字小蠹 Diapus aulacus*
** 小蠹亞科 Scolytinae
*** 梢小蠹族 Cryphalini
*** Cryphalus formosanus*
*** Cryphalus taiwanus*
*** 林小蠹族 Hylurgini
*** Xylechinus arisanus*
*** 膚小蠹族 Phloeosinini
*** Phloeosinus arisanus*
*** Cyclorhipidion ohnoi (=Neonectes babai*)
** 粒龍蝨亞科 Laccophilinae
** 臺灣彩裳粒龍蝨 Neptosternus taiwanensis*

叩頭蟲總科 Elateroidea

• 菊虎科 Cantharidae

** 菊虎亞科 Cantharinae
*** 菊虎族 Cantharini
*** 雙色異角菊虎 Cephalomalthinus bicoloriceps*
*** 雙印異角菊虎 Cephalomalthinus biimpressus*
*** 名符異角菊虎 Cephalomalthinus denominatus*
*** 奮起湖異角菊虎 Cephalomalthinus fenchihuensis*
*** 黃鞘異角菊虎 Cephalomalthinus flavipennis*
*** 蓬萊異角菊虎 Cephalomalthinus formosanus*
*** 嘉理思異角菊虎 Cephalomalthinus gressitti*
*** 花蓮異角菊虎 Cephalomalthinus hualiensis*
*** 黑澤異角菊虎 Cephalomalthinus kurosawai*
*** 寬鬚異角菊虎 Cephalomalthinus laticornis*
*** 梨山異角菊虎 Cephalomalthinus lishanensis*
*** 微異角菊虎 Cephalomalthinus minor*
*** 南投異角菊虎 Cephalomalthinus nantouensis*
*** 玄首異角菊虎 Cephalomalthinus nigriceps*
*** 棍節異角菊虎 Cephalomalthinus piluchiensis*
*** 屏東異角菊虎 Cephalomalthinus pingtungensis*
*** 佐藤異角菊虎 Cephalomalthinus satoi*
*** 絲鬚異角菊虎 Cephalomalthinus simplicicornis*
*** 四稜異角菊虎 Cephalomalthinus ssulingensis*
*** 近墨異角菊虎 Cephalomalthinus subnigra*
*** 臺北異角菊虎 Cephalomalthinus taipeianus*
*** 臺灣異角菊虎 Cephalomalthinus taiwanus*
*** 桃園異角菊虎 Cephalomalthinus taoyuanus*
**** 宜蘭異角菊虎 Cephalomalthinus taoyuanus ilanensis*
**** 桃園異角菊虎 Cephalomalthinus taoyuanus taoyuanus*
*** 上野異角菊虎 Cephalomalthinus uenoi*
*** 叉形長角菊虎 Habronychus furcatus*
*** 中線長角菊虎 Habronychus intermixtus*
*** 黑澤長角菊虎 Habronychus kurosawai*
*** 拉拉山單爪菊虎 Habronychus lalashanensis*
*** 長角單爪菊虎 Habronychus longicornis*
*** 粗腿單爪菊虎 Habronychus multilimbatus*
*** 南投長角菊虎 Habronychus nantouanus*
*** 紹德長角菊虎 Habronychus sauteri*
*** 阿里山異菊虎 Lycocerus arisanensis*
*** 暗黑異菊虎 Lycocerus atroopacus*
*** 橙胸小黑異菊虎 Lycocerus aurantiacus*
*** 雙閡異菊虎 Lycocerus bipartitus*
*** 橙艷異菊虎 Lycocerus chosokeiensis*
*** 中條異菊虎 Lycocerus chujoi*
*** 帶稜異菊虎 Lycocerus costulatus*
*** 細身異菊虎 Lycocerus elongatipes*
*** 福音小黑異菊虎 Lycocerus evangelium*
*** 臺南琉璃異菊虎 Lycocerus fainanus*
*** 黃邊琉璃異菊虎 Lycocerus flavimarginalis*
*** 纖跗異菊虎 Lycocerus gracilitarsis*
*** 嘉理思異菊虎 Lycocerus gressitti*
*** 漢斯異菊虎 Lycocerus hansi*
*** 金太郎小黑異菊虎 Lycocerus kintaroi*
*** 拉拉山異菊虎 Lycocerus lalaensis*
*** 斑樁異菊虎 Lycocerus maculiceps*
*** 斑胸異菊虎 Lycocerus maculithorax*
*** 正孝琉璃異菊虎 Lycocerus masatakai*
*** 南山異菊虎 Lycocerus nanshanensis*
*** 角鬚緋異菊虎 Lycocerus nigricollis*
*** 小青黑異菊虎 Lycocerus nigripennis*
*** 新里琉璃異菊虎 Lycocerus niisatoi*
*** 紋繪異菊虎 Lycocerus pictus*
*** 毛足異菊虎 Lycocerus pilipes*
*** 柔毫異菊虎 Lycocerus pubescens*
*** 擬黑姬異菊虎 Lycocerus rhagonychiformis*
*** 緋色異菊虎 Lycocerus russulus*
*** 佐藤琉璃異菊虎 Lycocerus satoi*
*** 靛青異菊虎 Lycocerus semicyaneus*
*** 下村氏異菊虎 Lycocerus shimomurai*
*** 桃園琉璃異菊虎 Lycocerus taoyuanus*
*** 翠峰異菊虎 Lycocerus tsuifengensis*
*** 文泉異菊虎 Lycocerus wenchuani*
*** 烏來異菊虎 Lycocerus wulaianus*
*** 平世異菊虎 Lycocerus yangi*
*** 奕霆紋繪異菊虎 Lycocerus yitingi*
*** 灰胸圓胸菊虎 Prothemus hisamatsui*
*** 姬圓胸菊虎 Prothemus minor*
*** 野津氏圓胸菊虎 Prothemus notsui*
*** 碧綠圓胸菊虎 Prothemus piluensis*
*** 芝田氏圓胸菊虎 Prothemus shibatai*
*** 多色圓胸菊虎 Prothemus varicolor*
*** 渡邊氏圓胸菊虎 Prothemus watanabei*
*** 米榭黑姬菊虎 Rhagonycha micheli*
*** 臺灣黑姬菊虎 Rhagonycha taiwanonigra*
*** 鄒狹胸菊虎 Stenothemus cou*
*** 雙子狹胸菊虎 Stenothemus gemini*
*** 豺狼狹胸菊虎 Stenothemus lupus*
** 亞科 Agrypninae
*** 族 Agrypnini
*** Adelocera ami*
*** Adelocera gressitti*
*** Adelocera shibatai*
*** Adelocera shirozui shirozui*
*** Adelocera takasago*
*** Adelocera youngi*
*** Agrypnus ami*
*** Agrypnus argillaceus shirozui*
*** Agrypnus babanus*
*** Agrypnus dilatipennis*
*** Agrypnus formosanus*
**** Agrypnus formosanus formosanus*
**** Agrypnus formosanus lanyuanus*
*** Agrypnus liukueiensis*
*** Agrypnus muscroides*
*** Agrypnus polishaensis*
*** Agrypnus shirakii*
*** Agrypnus taciturnus koshunensis*
*** Agrypnus takasago*
*** Agrypnus tuberculipennis*
*** Lacon atayal*
*** Lacon churakagi*
*** Lacon kikuchii*
*** Lacon kintaroui*
*** Lacon kushihige*
*** Lacon puriensis*
*** Lacon ramatasenseni*
*** Lanelater pescadorensis*
*** Meristhus babai*
*** 族 Conoderini
*** Drasterius collaris taiwanus*
*** Heteroderes changi*
*** Neodrasterius kiyoyamai*
*** 族 Hemirhipini
*** Cryptalaus elongatus*
*** Cryptalaus mus*
*** Cryptalaus shibatai*
*** 族 Pseudomelanactini
*** Anthracalaus chujoi*
*** 族未定
*** Tetrigus babai*
*** Tetrigus taiwanus*
** 亞科 Cardiophorinae
*** 族 Cardiophorini
*** Cardiophorus baibaranus*
*** Cardiotarsus babai*
*** Cardiotarsus housaianus*
*** Cardiotarsus taiwanus*
*** Cardiotarsus yagii*
*** Platynychus anpingensis*
*** Platynychus imasakai*
*** Platynychus taiwanus*
*** Ryukyucardiophorus babai*
** 亞科 Dendrometrinae
*** 族 Dendrometrini
*** Gambrinus nanshanensis (=Limoniscus nanshanensis*)
*** Hemicrepidius nigripennis*
*** Hemicrepidius rufangulus rufangulus*
*** Limonius onyx*
*** Limonius sapphirus*
*** 族 Prosternini
*** Actenicerus formosensis*
*** Actenicerus mushanus*
*** Actenicerus takeshii*
** 叩頭蟲亞科 Elaterinae
*** 族 Adrastini
*** Glyphonyx ami*
*** Glyphonyx apayao*
*** Glyphonyx arisanus*
*** Glyphonyx atayal*
*** Glyphonyx brunneipennis*
*** Glyphonyx castaneus*
*** Glyphonyx chipenensis*
*** Glyphonyx exilis*
*** Glyphonyx flavicollis*
*** Glyphonyx formosanus*
*** Glyphonyx fuscicollis*
*** Glyphonyx grossus*
*** Glyphonyx housaii*
*** Glyphonyx kankaui*
*** Glyphonyx kintaroui*
*** Glyphonyx kuni*
*** Glyphonyx laszlorum*
*** Glyphonyx liukuiensis*
*** Glyphonyx longicornis*
*** Glyphonyx longipennis*
*** Glyphonyx longulus*
*** Glyphonyx marginalis*
*** Glyphonyx muneaka*
*** Glyphonyx nitidicollis*
*** Glyphonyx oiwakensis*
*** Glyphonyx paiwan*
*** Glyphonyx parallelaris*
*** Glyphonyx rubiginosus*

*** Glyphonyx rufithorax*

*** Glyphonyx shirozuanus*
*** Glyphonyx taiwan*
*** Glyphonyx taiwanus*
*** Glyphonyx takasago*
*** Glyphonyx vunun*
*** Lanecarus amianus*
*** Lanecarus babai*
*** Lanecarus lineatus*
*** Silesis mutabilis*
*** 族 Agriotini
*** Agriotes babanus*
*** Agriotes fulgens*
*** Agriotes gracilis*
*** Agriotes liukuiensis*
*** Agriotes shirozui*
*** Agriotes shykshanus*
*** Agriotes takasago*
*** Agriotes yushihanus*
*** Chatanayus fuscus*
*** Chatanayus taiyarui*
*** Ectinus nokozanus*
*** 族 Ampedini
*** Ampedus agnatus*
*** Ampedus fabiani*
*** Ampedus formosensis*
*** Ampedus fulvipennis*
*** Ampedus habunensis*
*** Ampedus kintaroui*
*** Ampedus kuangtangi*
*** Ampedus lalashanus*
*** Ampedus leptgracilis*
*** Ampedus lini*
*** Ampedus masamichii*
*** Ampedus masculatus*
*** Ampedus narai*
*** Ampedus procerus*
*** Ampedus pseudoflavobasalis*
*** Ampedus shirozui*
*** Ampedus taichangi*
*** Ampedus tattakensis*
*** Ampedus viridipennis*
*** Ampedus yagii*
*** Ampedus yushiroi*
*** 族 Dicrepidiini
*** Neopsephus takasago*
*** Neopsephus formosanus*
*** Neopsephus shibatai*
*** 叩頭蟲族 Elaterini
*** Agonischius yokoyamai*
*** Ludioschema apayao*
*** Ludioschema marginicolle*
*** Ludioschema opacipenne*
*** Ludioschema taikozanum*
*** Ludioschema vittiger formosanum*
*** Mulsanteus foldvarii*
*** Mulsanteus peregovitsi*
*** Mulsanteus shirozui*
*** Sericus formosanus*
*** Taiwanostethus tanidai*
*** Vuilletus babai*
*** Vuilletus mushanus*
*** Vuilletus yagii*
*** 族 Megapenthini
*** Abelater babanus*
*** Abelater bousaianus*
*** Abelater imasakai*
*** Abelater kentingensis*
*** Abelater makiharai*
*** Abelater matsudai*
*** Abelater nigrolineatus*
*** Abelater taiwanus*
*** Agaripenthes babai*
*** Amamipenthes formosensis*
*** Hayekpenthes babakinsanus*
*** Hayekpenthes parallelaris*
*** Hayekpenthes suginoi*
*** Megapenthes oblongicollis*
*** Megapenthes tattakensis*
** 亞科 Negastriinae
*** 族 Negastriini
*** Fleutiauxellus babanus*
*** Oedostethus cryptohypnoidus*
*** Oedostethus nitobei*
*** 族未定
*** Arhaphes takasago*
** 尖鞘叩頭蟲亞科 Oxynopterinae
*** 大青叩頭蟲族 Campsosternini
*** 臺灣大青叩頭蟲 Campsosternus guishuni*
*** 虹彩叩頭蟲 Campsosternus watanabei* 第二級保育類
*** 紅緣大青叩頭蟲 Campsosternus yasuakii*
*** 梳角叩頭蟲族 Pectocerini
*** Pectocera babai*
*** Pectocera formosana*
*** Pectocera kobayashii*

牙蟲總科 Hydrophiloidea

• 圓牙蟲科 Georissidae

* Georissus formosanus*

• 牙蟲科 Hydrophilidae

** 牙蟲亞科 Hydrophilinae
*** 族 Acidocerini
*** Agraphydrus decipiens*
*** Agraphydrus politus*
*** 伊蘇蒼白牙蟲 Enochrus esuriens*
*** Enochrus natalensis*
*** Enochrus parumstriatus*
*** Enochrus sauteri*
*** Helochares sauteri*
*** 毛腿牙蟲族 Anacaenini
*** Anacaena jengi*
*** Anacaena smetanai*
*** Crenitis formosana*
*** 族 Hydrobiusini
*** Hydrocassis taiwana*
*** 長節牙蟲族 Laccobiini
*** Laccobius politus*
*** Oocyclus magnifica*
*** Pelthydrus jengi*
** 陸牙蟲亞科 Sphaeridiinae
*** 陷口牙蟲族 Coelostomatini
*** 臺灣陷口牙蟲 Coelostoma taiwanense*
*** 族 Omicrini
*** Psalitrus sauteri*

筒蠹蟲總科 Lymexyloidea

• 筒蠹蟲科 Lymexylidae

* Arractoerus monticola*

金龜子總科 Scarabaeoidea

• 鍬形蟲科 Lucanidae

** 斑紋鍬形蟲亞科 Aesalinae
*** 斑紋鍬形蟲族 Aesalini
*** 斑紋鍬形蟲 Aesalus imanishii*
*** 鍾氏熱帶斑紋鍬形蟲 Echinoaesalus chungi*
** 鍬形蟲亞科 Lucaninae
*** 肥角鍬形蟲族 Aegini
*** 面天肥角鍬形蟲 Aegus jengi*
*** 高山肥角鍬形蟲 Aegus kurosawai*
*** 鋸鍬形蟲族 Cladognathini
*** 臺灣鬼鍬形蟲 Prismognathus formosanus*
*** 碧綠鬼鍬形蟲 Prismognathus piluensis*
*** 鹿角鍬形蟲 Rhaetulus crenatus crenatus*
*** 細身赤鍬形蟲族 Cyclommatini
*** 豔細身赤鍬形蟲 Cyclommatus asahinai*
*** 細身赤鍬形蟲 Cyclommatus scutellaris*
*** 大鍬形蟲族 Dorcini
*** 直顎鏽鍬形蟲 Dorcus carinulatus*
*** 細角大鍬形蟲 Dorcus gracilicornis*
*** 深山扁鍬形蟲 Dorcus kyanrauensis*
*** 平頭大鍬形蟲 Dorcus miwai*
*** 望月鍬形蟲 Dorcus mochizukii*
*** 條背大鍬形蟲 Dorcus reichei clypeatus*
*** 長角大鍬形蟲 Dorcus schenklingi* 第二級保育類
*** 臺灣鏽鍬形蟲 Dorcus taiwanicus*
*** 刀鍬形蟲 Dorcus yamadai*
*** 矮鍬形蟲族 Figulini
*** 徐氏豆鍬形蟲 Figulus hsui*
*** 羅氏角葫蘆鍬形蟲 Nigidius lohi*
*** 深山鍬形蟲族 Lucanini
*** 承遠深山鍬形蟲 Lucanus chengyuani*
*** 大屯姬深山鍬形蟲 Lucanus datunensis*
*** 臺灣深山鍬形蟲 Lucanus formosanus*
*** 栗色深山鍬形蟲 Lucanus kanoi*
**** 栗色深山鍬形蟲 Lucanus kanoi kanoi*
**** 黑腳深山鍬形蟲 Lucanus kanoi ogakii*
**** 漆黑深山鍬形蟲 Lucanus kanoi piceus*
*** 黑澤深山鍬形蟲 Lucanus kurosawai*
*** 黃腳深山鍬形蟲 Lucanus miwai*
*** 姬深山鍬形蟲 Lucanus swinhoei*
*** 宇老深山鍬形蟲 Lucanus yulaoensis*
*** 下村角金龜 Dicronocephalus shimomurai*
*** 墾丁脊頭鰓金龜 Miridiba kuraruana*

• 白蟻科 Termitidae

* 木下象白蟻 Nasutitermes kinoshitae*

膜翅目 Hymenoptera

• 地花蜂科 Andrenidae

* 陳氏姬花蜂 Andrena cheni*
* 南投姬花蜂 Andrena nantouensis*
* 臺灣姬花蜂 Andrena taiwanella*
* 楊氏姬花蜂 Andrena yangi*

• 蜜蜂科 Apidae

* 短頰熊蜂 Bombus angustus*
* 信義熊蜂 Bombus formosellus*
* Bombus monozonus*
* 楚南熊蜂 Bombus sonani*

• 癭蜂科 Cynipidae

* Andricus formosanus*
* Andricus pseudocurvator*
* Andricus songshui*

• 蟻科 Formicidae

** 鈍針蟻亞科 Amblyoponinae
** 布農鈍針蟻 Amblyopone bruni*
** 酒井鈍針蟻 Amblyopone sakaii*
** 軍蟻亞科 Dorylinae
** 點腹迷蟻 Aenictus punctiventris*
** 山蟻亞科 Formicinae
** 臭巨山蟻 Camponotus habereri*
** 台北巨山蟻 Camponotus formosensis*
** 甜蜜巨山蟻 Camponotus variegatus dulcis*
** 寶島臀山蟻 Acropyga butteli*
** 雨師臀山蟻 Acropyga yushi*
** 家蟻亞科 Myrmicinae
** 高橋長腳家蟻 Aphaenogaster takahashii*
** 天蓬痕胸家蟻 Temnothorax tianpeng*
** 席氏舉尾家蟻 Crematogaster schimmeri*
** 厚背刺家蟻 Acanthomyrmex crassispinus*
** 粗斜毛家蟻 Eurhopalothrix procera*
** 臺灣黑豔家蟻 Myrmecina taiwana*
** 針蟻亞科 Ponerinae
** 甲仙顎針蟻 Anochetus subcoecus*
** 臺灣顎針蟻 Anochetus taiwaniensis*

• 姬蜂科 Ichneumonidae

** 姬蜂亞科 Ichneumoninae
** 截角偽圓孔姬蜂 Pseudalomya truncaticornis*

軟甲綱
十足目 Decapoda
異尾下目 Anomura

• 蟬蟹科 Hippidae

* 臺灣鼠蟬蟹 Emerita taiwanensis*

短尾下目 Brachyura

• 溪蟹科 Potamidae

* 拉氏明溪蟹 Candidiopotamon rathbuni*
* 黃灰澤蟹 Geothelphusa albogilva*
* 厚圓澤蟹 Geothelphusa ancylophallus*
* 雙色澤蟹 Geothelphusa bicolor*
* 北山澤蟹 Geothelphusa boreas*
* 藍灰澤蟹 Geothelphusa caesia*
* 日月潭澤蟹 Geothelphusa candidiensis*
* 邱氏澤蟹 Geothelphusa chiui*
* 棲蘭澤蟹 Geothelphusa cilan*
* 灰甲澤蟹 Geothelphusa cinerea *
* 扁足澤蟹 Geothelphusa dolichopodes*
* 顯齒澤蟹 Geothelphusa eucrinodonta*
* 寬甲澤蟹 Geothelphusa eurysoma*
* 鏽色澤蟹 Geothelphusa ferruginea*
* 細足澤蟹 Geothelphusa gracilipes*
* 海端澤蟹 Geothelphusa haituan*
* 侯氏澤蟹 Geothelphusa holthuisi*
* 宜蘭澤蟹 Geothelphusa ilan*
* 老王澤蟹 Geothelphusa laowang*
* 蘭嶼澤蟹 Geothelphusa lanyu*
* 李氏澤蟹 Geothelphusa leeae*
* 力里澤蟹 Geothelphusa lili*
* 綠島澤蟹 Geothelphusa lutao*
* 馬卡道澤蟹 Geothelphusa makatao*
* 宮崎氏澤蟹 Geothelphusa miyazakii*
* 高山澤蟹 Geothelphusa monticola*
* 南澳澤蟹 Geothelphusa nanao*
* 楠西澤蟹 Geothelphusa nanhsi*
* 黃綠澤蟹 Geothelphusa olea*
* 屏東澤蟹 Geothelphusa pingtung*
* 神山澤蟹 Geothelphusa shernshan*
* 諸喜田澤蟹 Geothelphusa shokitai*
* 賽夏澤蟹 Geothelphusa siasiat*
* 達觀澤蟹 Geothelphusa takuan*
* 大里澤蟹 Geothelphusa tali*
* 太魯閣澤蟹 Geothelphusa taroko*
* 大武澤蟹 Geothelphusa tawu*
* 蔡氏澤蟹 Geothelphusa tsayae*
* 王氏澤蟹 Geothelphusa wangi*
* 霧臺澤蟹 Geothelphusa wutai*
* 陽明山澤蟹 Geothelphusa yangmingshan*
* 東引南海溪蟹 Nanhaipotamon dongyinese*
* 臺灣南海溪蟹 Nanhaipotamon formosanum*

• 相手蟹科 Sesarmidae

* 寬腹針肢蟹 Bresedium eurypleon*
* 金額擬相手蟹 Leptarma aurifrons*
* 霍氏瘦相手蟹 Leptarma liho*
* 嘉祥擬相手蟹 Parasesarma chiahsiang*
* 珊瑚擬相手蟹 Parasesarma corallicum*
* 鑽斑擬相手蟹 Parasesarma gemmatum*
* 延遲仿相手蟹 Sesarmops mora*

• 弓蟹科 Varunidae

* 王爺擬方額蟹 Parapyxidognathus ongia*
* 千歲擬方額蟹 Parapyxidognathus tshiansue*
* 臺灣扁絨螯蟹 Platyeriocheir formosa*
* 酒井折顎蟹 Ptychognathus sakaii*
* 王氏三強蟹 Tritodynamia wangi*

真蝦下目 Caridea

• 匙指蝦科 Atyidae

* 條紋米蝦 Caridina faciata*
* 臺灣米蝦 Caridina formosae*
* 假鋸齒米蝦 Caridina pseudodenticulata*
* 湧泉新米蝦 Neocaridina fonticulata*
* 凱達格蘭新米蝦 Neocaridina ketagalan*
* 赤崁新米蝦 Neocaridina saccam*

唇足綱
地蜈蚣目 Geophilomorpha

• 長頭地蜈蚣科 Mecistocephalidae

* Arrup sauteri*
* 張氏地蜈蚣 Mecistocephalus changi*
* Mecistocephalus nannocornis*
* Mecistocephalus yanagiharai*

• 科 Linotaeniidae

* Strigamia japonica*

石蜈蚣目 Lithobiomorpha

• 石蜈蚣科 Lithobiidae

* Lithobius bidivisa*
* 基隆石蜈蚣 Lithobius keelungensis*
* 嘉義石蜈蚣 Lithobius kiayiensis*
* Lithobius lineatus*
* 梅峰石蜈蚣 Lithobius meifengensis*
* 王氏石蜈蚣 Lithobius ongi*
* 清泉石蜈蚣 Lithobius qingquanensis*

脊索動物
哺乳類
偶蹄目
*牛科 Bovidae
#台灣長鬃山羊 Naemorhedus swinhoei (Gray) 台灣特有種
*鹿科 Cervidae
#台灣梅花鹿 Cervus nippon taiouanus (Blyth) 台灣特有亞種
#臺灣水鹿 Rusa unicolor swinhoii (Sclater) 台灣特有亞種
#山羌 Muntiacus reevesi micrurus (Sclater) 台灣特有亞種

*豬科
#台灣野豬 *

鼩形目
*鼩鼱科（尖鼠科）
#小麝鼩 Crocidura suaveolens hosletti Jameson & Jones
#山階氏鼩鼱 Anourosorex squamipes yamashinai Kuroda 台灣特有種
#台灣灰鼩鼱 Crocidura attenuata tanakae Kuroda
#台灣煙尖鼠 Soriculus fumidus Thomas
#長尾麝鼩 Crocidura tadae Tokuda & Kano
#細尾長尾鼩 Soriculus sodalis Thomas
*鼴鼠科 Talpidae
#台灣鼴鼠 Mogera insularis insularis (Swinhoe)

啮齿目
*鼠科 Muridae
#台灣森鼠 Apodemus semotus Thomas
#刺鼠 Niviventer coxingi (Swinhoe)
#高山白腹鼠 Niviventer culturatus (Thomas)
*倉鼠科
#台灣高山田鼠 Microtus kikuchii (Kuroda)
*松鼠科 Sciuridae
#大赤鼯鼠 Petaurista philippensis (Elliot) 台灣特有亞種
#台灣小鼯鼠 Belomys pearsoni kaleensis (Swinhoe)
#白面鼯鼠 Petaurista lena Thomas 台灣特有亞種
#長吻松鼠 Dremomys pernyi owstoni (Thomas)

兔形目
*兔科 Leporidae
#台灣野兔 Lepus sinensis formosus Thomas

鱗甲目
Pholidota
*穿山甲科（鯪鯉科） Manidae
#台灣穿山甲 Manis pentadactyla pentadactyla Linnaeus

靈長目

• 獼猴科 Cercopithecidae

* 台灣獼猴 Macaca cyclopis*

翼手目
*蝙蝠科 Vespertilionidae
#台灣長耳蝠 Plecotus taivanus Yoshiyuki
#台灣鼠耳蝠 Myotis taiwanensis Linde
#台灣管鼻蝠 Murina puta Kishida
#崛氏棕蝠 Eptesicus serotinus horikawai Kishida
#渡瀨氏鼠耳蝠 Myotis rufoniger watasei (Thomes)
#黃金鼠耳蝠 Myotis formosus flavus (Hodgson)
#黃頸蝠 Arielulus torquatus Gabor & Lee
#寬吻鼠耳蝠 Myotis latirostris Kishida
*大蝙蝠科 Pteropodidae
#台灣狐蝠 Pteropus dasymallus formosus Sclater
*葉鼻蝠科 Hipposideridae
#台灣葉鼻蝠 Hipposideros terasensis Kisida
#無尾葉鼻蝠 Coelops frithi formosanus Horikawa
*蹄鼻蝠科 Rhinolophidae
#台灣大蹄鼻蝠 Rhinolophus formosae Sanborn
#台灣小蹄鼻蝠 Rhinolophus monoceros Andersen

食肉目
*貓科 Felidae
#台灣雲豹 Neofelis nebulosa brachyurus Swinhoe 台灣特有亞種
*靈貓科（貍科） Viverridae
#白鼻心 Paguma larvata taivana Swinhoe 台灣特有亞種
#麝香貓 Viverricula indica taivana Schwarz 台灣特有亞種
*熊科 Ursidae
#台灣黑熊 Ursus thibetanus formosanus Swinhoe 台灣特有亞種
*鼬科 Mustelidae
#台灣小黃鼠狼 Mustela formosana* 台灣特有種
#華南鼬鼠 Mustela sibirica davidiana (Milne-Edwards) 台灣特有亞種
#黃喉貂 Martes flavigula chrysospila Swinhoe 台灣特有亞種
#鼬獾 Melogale moschata subaurantiaca Swinhoe 台灣特有亞種

鳥類
雀形目
]]
*八哥科Sturnidae
*八哥 Acridotheres cristatellus formosanus* 臺灣特有亞種
*山雀科 Paridae
*黃山雀 Machlolophus holsti* Seebohm 臺灣特有種
*赤腹山雀 Parus varius castaneoventris* Gould 臺灣特有種
*青背山雀Parus monticolus insperatus* (Swinhoe) 臺灣特有亞種
*煤山雀 Parus ater ptilosus* Ogilvie-Grant 臺灣特有亞種
*卷尾科Dicruridae
*大卷尾 Dicrurus macrocercus* 臺灣特有亞種
*小卷尾 Dicrurus aeneus* 臺灣特有亞種
*雀科}- Fringillidae
*台灣灰鷽 Pyrrhula erythaca* 臺灣特有種
*臺灣朱雀 Carpodacus formosanus* 臺灣特有種
*褐鷽 Pyrrhula nipalensis* 臺灣特有亞種
*畫眉科 Timaliidae（鶲科 Muscicapidae 畫眉亞科 Timalinae）
*大彎嘴 Pomatorhinus erythrogenys* 臺灣特有種
*小彎嘴 Pomatorhinus ruficollis* 臺灣特有種
*山紅頭 Stachyris ruficeps* 臺灣特有亞種
*金翼白眉 Trochalopteron morrisonianum* (Ogilvie-Grant) 臺灣特有種
*白耳畫眉 Heterophasia auricularis* (Swinhoe) 臺灣特有種
*臺灣白喉噪眉 Ianthocincla ruficeps* 臺灣特有種
*褐頭花翼 Fulvetta formosana* 臺灣特有種

*冠羽畫眉 Yuhina brunneiceps* Ogilvie-Grant 臺灣特有種
*紋翼畫眉 Actinodura morrisoniana* Ogilvie-Grant 臺灣特有種
*竹鳥 Garrulax poecilorhynchus poecilorhynchus* Gould 臺灣特有種
*臺灣畫眉 Leucodioptron taewanum（Garrulax canorus taewanus* Swinhoe）臺灣特有種

*黃胸藪眉 Liocichla steerii* Swinhoe 臺灣特有種
*頭烏線 Alcippe brunnea* 臺灣特有亞種
*繡眼畫眉 Alcippe morrisonia* 臺灣特有種
*岩鷚科 Prunellidae
*岩鷚 Prunella collaris* 臺灣特有亞種
*啄花鳥科 Dicaeidae
*紅胸啄花鳥 Dicaeum ignipectus* 臺灣特有亞種
*綠啄花鳥 Dicaeum concolor* 臺灣特有亞種
*黃鸝科 Oriolidae
*朱鸝 Oriolus traillii ardens* (Swinhoe) 臺灣特有亞種
*鴉科 Corvidae

*臺灣藍鵲 Urocissa caerulea* (Gould) 臺灣特有種
*松鴉 Garrulus glandarius taivnus* Gould 臺灣特有亞種
*星鴉 Nucifraga caryocatactes owstoni* 臺灣特有亞種
*樹鵲 Dendrocitta formosae formosae* 臺灣特有亞種
*鵯科 Pycnonotidae
*白頭翁 Pycnonotus sinensis formosae* 臺灣特有亞種
*白環鸚嘴鵯 Spizixos semitorques* 臺灣特有亞種
*紅嘴黑鵯 Hypsipetes leucocephalus nigerrimus* 臺灣特有亞種
*烏頭翁 Pycnonotus taivanus* 臺灣特有種
*棕耳鵯 Hypsipetes amaurotis* 臺灣特有亞種
*鶲科 Muscicapidae
**小剪尾 Enicurus scouleri fortis (Hartert) 臺灣特有亞種
*小翼鶇 Brachypteryx montana* Ogilvie-Grant 臺灣特有種
*臺灣紫嘯鶇 Myiophoneus insularis* Gould 臺灣特有種
*白尾鴝 Cinclidium leucurum montium* (Swinhoe) 臺灣特有亞種
*台湾白眉林鸲 Tarsiger formosanus* 臺灣特有種

*栗背林鴝 Tarsiger johnstoniae* (Ogilvie-Grant) 臺灣特有種
*鉛色水鶇 Phoenicurus* 臺灣特有亞種
*鶇科 Turdidae（鶲科 Muscicapidae 鶇亞科 Turdinae）
*白頭鶇 Turdus poliocephalus niveiceps* (Hellmayr) 臺灣特有種
*戴菊科 Regulidae
*火冠戴菊鳥 Regulus goodfellowi* Ogilvie-Grant 臺灣特有種
*鳾科 Sittidae
*茶腹鳾 Sitta europaea* (Verreaux, 1871) 臺灣特有亞種
*樹鶯科 Cettiidae
*深山鶯 Horornis acanthizoides* 臺灣特有亞種
*小鶯 Horornis fortipes robustipes* 臺灣特有亞種
*扇尾鶯科Cisticolidae
*斑紋鷦鶯 Prinia criniger *臺灣特有亞種
*黃頭扇尾鶯 Cisticola exills* 臺灣特有亞種
*褐頭鷦鶯 Prinia inornata flavirostris* 臺灣特有亞種
*鶲科 Muscicapidae（鶲科 Muscicapidae 鶲亞科 Muscicapinae）
*黃胸青鶲 Ficedula hyperythra innexa* (Swinhoe) 臺灣特有亞種
*黃腹琉璃Niltava vivida* (Swinhoe) 臺灣特有種
*王鶲科 Monarchidae
*黑枕藍鶲 Hypothymis azurea oberholseri* 臺灣特有亞種
*蝗鶯科 Locustellidae
*臺灣短翅鶯 Locustella alishanensis* 臺灣特有種
*鷦鷯科 Troglodytidae
*鷦鷯 Troglodytes troglodytes taivanus* 臺灣特有亞種
*鸚嘴科 Panuridae（鶲科 Muscicapidae 鸚嘴亞科 Paradoxornithinae）
*粉紅鸚嘴 Sinosuthora webbiana bulomacha* 臺灣特有亞種
*黃羽鸚嘴 Suthora verreauxi morrisoniana* 臺灣特有亞種
*鷦眉科 Pnoepygidae
*臺灣鷦眉 Pnoepyga formosana* 臺灣特有種

鶴形目
Gruiformes
*三趾鶉科Turnicidae
*棕三趾鶉 Turnix suscitator* 臺灣特有亞種
*秧雞科 Rallidae
*灰胸秧雞 Rallus striatus* 臺灣特有亞種
*灰腳秧雞 Rallina eurizonoides* 臺灣特有亞種

鴷形目
Piciformes
*五色鳥科（鬚鴷科） Capitonidae
*五色鳥 Megalaima nuchalis* 臺灣特有種
*啄木鳥科 Picidae
*大赤啄木 Dendrocopos leucotos insularis* (Gould) 臺灣特有亞種

鴞形目 Strigiformes
*草鴞科 Tytonidae
*東方草鴞 Tyto longimembris pithecops*（Swinhoe,1866） 臺灣特有亞種

*鴟鴞科 Strigidae
*灰林鴞 Strix aluco yamadae* ,1936 臺灣特有亞種
*黃嘴角鴞 Otus spilocephalus hambroecki*（Swinhoe,1870） 臺灣特有亞種
*領鵂鶹 Glaucidium brodiei pardalotum*（Swinhoe,1863） 臺灣特有亞種
*蘭嶼角鴞 Otus elegans botelensis* Kuroda,1928 臺灣特有亞種

夜鷹目 Caprimulgiformes
*夜鷹科 Caprimulgidae
*南亞夜鷹 Caprimulgus affinis stictomus* 臺灣特有亞種

雨燕目 Apodiformes
*雨燕科 Apodidae
*灰喉針尾雨燕 Apus nipalensis* 臺灣特有亞種
*小雨燕 Apus nipalensis* 臺灣特有亞種

雞形目 Galliformes
*雉科 Phasianidae
*臺灣山鷓鴣 Arborophila crudigularis*（Swinhoe,1864） 臺灣特有種
*臺灣竹雞 Bambusicola sonorivox* Gould,1863 臺灣特有種
*帝雉 Syrmaticus mikado* ,1906 臺灣特有種
*環頸雉 Phasianus colchicus formosanus* ,1870 臺灣特有亞種
*藍腹鷴 Lophura swinhoii*（Gould,1863）臺灣特有種

鴿形目
*鳩鴿科 Columbidae
*金背鳩 Streptopelia orientalis* 臺灣特有亞種
*紅頭綠鳩 Treron formosae formosae* Swinhoe 臺灣特有亞種

鷹形目
*鷹科（鷲鷹科） Accipitridae
*大冠鷲 Spilornis cheela hoya* Swinhoe 臺灣特有亞種
*松雀鷹 Accipiter virgatus fuscipectus* (Mees) 臺灣特有亞種
*鳳頭蒼鷹 Accipiter trivirgatus formosae* Mayr 臺灣特有亞種

爬蟲類
有鱗目Squamata

• 壁虎科

龜山壁虎 Gekko guishanicus Lin and Yao 台灣特有種

蜥蜴亞目 Lacertilia (Sauria)
*石龍子科Scincidae
#中國石龍子 Eumeces chinensis formosensis (Gray)
#台灣滑蜥 Scincella formosensis (Van Denburgh)
#台灣蜓蜥 Sphenomorphus taiwanensis Chen & Lue
#白斑石龍子 Eumeces chinensis leucosticus Hikida
*守宮科（壁虎科） Gekkonidae
#雅美鱗趾蝎虎 Lepidodactylus yami Ota
#蘭嶼守宮　　Gekko kikuchii (Oshima)
*飛蜥科 Agamidae
#呂氏攀蜥 Japalura luei Ota, Chen & Shang
#牧氏攀蜥 Japalura makii Ota
#斯文豪氏攀蜥 Japalura swinhonis Gunther
#短肢攀蜥 Japalura brevipes Gressitt
*蛇蜥科Anguidae
#台灣蛇蜥 Ophisaurus formosensis Kishida
*蜥蜴科（正蜥科） Lacertidae
#台灣草蜥 Takydromus formosanus Boulenger
#南台草蜥 Takydromus sauteri Van Denburgh
#雪山草蜥 Takydromus hsueshanesis Lin & Cheng
#蓬萊草蜥 Takydromus stejnegeri Van Denburgh

蛇亞目 Serpentes
*盲蛇科 Typhlopidae
#大盲蛇 Typhlops koshunensis Oshima
*黃頷蛇科（遊蛇科） Colubridae
#台灣赤煉蛇 Phabdophis formosanus Maki
#台灣鈍頭蛇 Pareas formosensis (Van Dengurgh)
#泰雅鈍頭蛇 Pareas atayal (You, Poyarkov & Lin, 2015)
#駒井氏鈍頭蛇 Pareas komaii (Maki, 1931)
#台灣標蛇 Achalinus formosanus Boulenger
#花尾斜鱗蛇 Pseudoxendon stejnegeri stejnegeri Barbour
#金絲蛇 Amphiesma miyajimae Maki
#斯文豪氏遊蛇 Phabdophis swinhonis (Gunther)
#標蛇 Achalinus niger Maki
*蝙蝠蛇科（眼鏡蛇科） Elapidae
#帶紋赤蛇 Hemibungarus sauteri (Steindachner)
*蝮蛇科（蝰科、鎖蛇科） Viperidae
#菊池氏龜殼花 Trimeresurus gracilis Oshima
#阿里山龜殼花 Ovophis makazayazaya (Schmidt)

兩棲類
無尾目
*蟾蜍科Bufonidae
#盤古蟾蜍 Bufo bankorensis
*狹口蛙科Microhylidae
#史丹吉氏小雨蛙 Micryletta steinegeri
*赤蛙科Ranidae
#斯文豪氏蛙 Odorrana swinhoana
#梭德氏赤蛙 Rana sauteri
*樹蛙科Rhacophoridae
#褐樹蛙 Buergeria robusta
#面天樹蛙 Kurixalus idiootocus
#碧眼樹蛙 Kurixalus berylliniris
#王氏樹蛙 Kurixalus wangi
#翡翠樹蛙 Rhacophorus prasinatus
#諸羅樹蛙 Rhacophorus arvalis
#台北樹蛙 Rhacophorus taipeianus
#莫氏樹蛙 Rhacophorus moltrechti
#橙腹樹蛙 Rhacophorus aurantiventris

有尾目
Urodela

*山椒魚科Hynobiidae
#臺灣山椒魚 Hynobius formosanus
#楚南氏山椒魚 Hynobius sonani
#南湖山椒魚 Hynobius glacialis
#阿里山山椒魚 Hynobius arisanensis
#觀霧山椒魚 Hynobius fuca

硬骨魚類
鶴鱵目 Beloniformes

• 鱵科 Hemiramphidae

* 臺灣下鱵 Hyporhamphus taiwanensis*

鯉形目 Cypriniformes

• 腹吸鰍科 Gastromyzontidae

* 纓口臺鰍 Formosania lacustre*

• 爬鰍科 Balitoridae

* 臺灣間爬岩鰍 Hemimyzon formosanus*
* 沈氏間爬岩鰍 Hemimyzon sheni*
* 臺東間爬岩鰍 Hemimyzon taitungensis*
* 玉山間爬岩鰍 Hemimyzon yushanensis*
* 埔里中華爬岩鰍 Sinogastromyzon puliensis*

• 鯉科 Cyprinidae

* 臺灣石𩼧 Acrossocheilus paradoxus*
* 高身鏟頜魚 Onychostoma alticorpus*

• 鮈科 Gobionidae

* 陳氏鰍鮀 Gobiobotia cheni*
* 高身小鰾鮈 Microphysogobio alticorpus*
* 短吻小鰾鮈 Microphysogobio brevirostris*
* 飯島氏銀鮈 Squalidus iijimae*

• 鯝科 Xenocyprididae

* 溪流細鯽 Aphyocypris amnis*
* 菊池氏細鯽 Aphyocypris kikuchii*
* 莫氏細鯽 Aphyocypris moltrechti*
* 臺灣鬚鱲 Candidia barbata*
* 屏東鬚鱲 Candidia pingtungensis*
* 大鱗梅氏鯿 Metzia mesembrinum*
* 粗首馬口鱲 Opsariichthys pachycephalus*

胡瓜魚目 Osmeriformes

• 銀魚科 Salangidae

* 尖頭銀魚 Salanx acuticeps*

鱸形目 Perciformes

• 鰕虎科 Gobiidae

* 谷津氏猴鯊 Cryptocentrus yatsui*
* 楊氏羽衣鯊 Myersina yangii*
* 明潭吻鰕虎 Rhinogobius candidianus*
* 細斑吻鰕虎 Rhinogobius delicatus*
* 臺灣吻鰕虎 Rhinogobius formosanus*
* 大吻鰕虎 Rhinogobius gigas*
* 恆春吻鰕虎 Rhinogobius henchuenensis*
* 蘭嶼吻鰕虎 Rhinogobius lanyuensis*
* 斑帶吻鰕虎 Rhinogobius maculafasciatus*
* 南臺吻鰕虎 Rhinogobius nantaiensis*
* 短吻紅斑吻鰕虎魚 Rhinogobius rubromaculatus*

鮭形目 Salmoniformes

• 櫻花鉤吻鮭 Oncorhynchus formosanus

鯰形目 Siluriformes

• 鮰科 Amblycipitidae

* 臺灣鮰 Liobagrus formosanus*

• 鱨科 Bagridae

* 短臀擬鱨 Pseudobagrus brevianalis*

相關連結
*臺灣保育物種列表
*台灣特有種列表
*台灣植物特有種列表
*臺灣蝴蝶列表
*台灣兩棲動物列表

参考文献
外部連結
*[http://www.tesri.gov.tw/ 中華民國行政院農委會特有生物研究保育中心]
*[http://taibif.tw/zh 臺灣生物多樣性資訊入口網]