根井标准距离(),在一些華文文獻裡更常被寫作Nei氏遗传距离,是由日裔美国群体遗传学家根井正利()於1972年提出的一种计算遗传距离的方法。
根井标准距离假设了遗传差异是突变和漂变两个因素造成的,适用于每年或每个世代的遗传变化速率稳定的情况。在这种情况下,群体间的根井标准距离(D)与彼此分化的时间成正比,公式如下:
:\begin{align}
D=-\ln\frac{\sum \limits_\ell \sum \limits_{u} X_{u} Y_{u}}{\sqrt{(\sum \limits_{\ell} \sum \limits_{u} X_{u}^2)(\sum \limits_{\ell} \sum \limits_{u} Y_{u}^2)}}
\end{align}
這樣的話,我們可以把根井的标准距离公式寫成這樣:
:
D = -\ln \frac{J_{XY}}{\sqrt{J_XJ_Y}}
參考文獻
Genetic distance#Nei's standard genetic distance
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