2008–09年香港甲組足球聯賽是二戰後第 64 屆賽事。本屆賽事有多達 13 隊球隊參與角逐，是自1974–75球季後首次甲組聯賽有13 隊球隊參與。揭幕戰一如以往由上屆聯賽冠軍南華對上屆聯賽亞軍公民，結果雙方賽和 1–1，各得1分。
聯賽戰至第二十五輪，南華於旺角大球場以 2–1 擊敗康宏晨曦，提前一輪奪得聯賽錦標，成功衛冕，這亦是該隊屆來第 39 次奪得聯賽冠軍。
參賽球隊
球隊變遷
加入球隊
*淦源（從乙組升班）
*天水圍飛馬（新加入）
*香雪上清飲（新加入）
*四海（新加入）
離開球隊
*寶路華流浪（降級乙組）
球隊易名
*和富大埔更名為「新界地產和富大埔」
*聯華紅牛更名為「謝菲聯」
*華家堡更名為「屯門普高」
外援制度
上賽季的外援制度「註12出7」一直被人批評，認為引入過多外援會扼殺本港球員的發展機會，並且會造成某支球隊壟斷局面。因此於本賽季的外援制度會改為「註9出6」，更會於下賽季進一步收緊至「註8出5」，以確保本港球員出場的機會。
比賽球場
本屆賽事的甲組隊一般均沒有自己的主球場，因此大部分賽事會於旺角大球場舉行，一些較重要賽事則會被安排到香港大球場上演。而本屆賽事中的國內球隊謝菲聯，已被香港足總拒絕使用他們位於國內的主球場；而另一隊國內球隊香雪上清飲亦因場地質素及配套設施的問題，同樣被香港足總拒絕他們於主場（壆崗足球俱樂部球場）作賽。另外，新界地產和富大埔已成功向香港足總申請於他們區內的球場作賽，可是另一隊區隊天水圍飛馬的申請則未能順利通過，只獲准部分重要賽事於他們區內的元朗大球場進行比賽。
聯賽資料
積分榜
最後更新：2009年5月10日
本屆積分榜會根據以下規定來排列：
- 積分；2. 對賽成績；3. 對賽之得失球差；4. 對賽之得球；5. 總得失球差；6. 總得球
由於高級組銀牌冠軍天水圍飛馬在當時並非香港足球總會的基本會員，所以新界地產和富大埔憑奪得足總盃冠軍而獲得亞洲足協盃分組賽席位。
射手榜
最後更新：2009年5月10日
賽果
最後更新：2009年5月10日
主隊比分列前。
每輪排名
最后更新：2009年5月10日
按照每輪實際的進行時間先後排序。
球賽資料
第一周
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*本輪輪空球隊：四海
第二周
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*本輪輪空球隊：南華
第三周
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*本輪輪空球隊：愉園
第四周
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*本輪輪空球隊：屯門普高
第五周
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*本輪輪空球隊：香雪上清飲
由於天水圍飛馬於比賽中超額使用非本地球員，香港足球總會紀律專責小組判天水圍飛馬以0比3負予南華。
這兩場賽事因天雨關係而延期舉行。
第六周
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*本輪輪空球隊：謝菲聯
第七周
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*本輪輪空球隊：傑志
第八周
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*本輪輪空球隊：天水圍飛馬
第九周
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*本輪輪空球隊：康宏晨曦
第十周
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*本輪輪空球隊：淦源
第十一周
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*本輪輪空球隊：新界地產和富大埔
第十二周
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*本輪輪空球隊：東方
第十三周
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*本輪輪空球隊：公民
由於旺角大球場需要進行保養工程，這三場賽事延期舉行。
第十四周
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*本輪輪空球隊：四海
第十五周
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*本輪輪空球隊：南華
第十六周
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*本輪輪空球隊：愉園
第十七周
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*本輪輪空球隊：屯門普高
此球賽原定於2月14日下午4時正於元朗大球場舉行，現會安排移往旺角大球場及於2月14日下午3時正舉行。
第十八周
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*本輪輪空球隊：香雪上清飲
第十九周
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*本輪輪空球隊：謝菲聯
第二十周
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*本輪輪空球隊：傑志
這場賽事因雷暴關係而延期舉行。
第二十一周
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*本輪輪空球隊：天水圍飛馬
由於場地鬆軟及濕滑，這兩場賽事因而延期舉行。
第二十二周
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*本輪輪空球隊：康宏晨曦
由於場地鬆軟及濕滑，這兩場賽事因而延期舉行。
第二十三周
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*本輪輪空球隊：淦源
第二十四周
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*本輪輪空球隊：新界地產和富大埔
這場賽事因雷暴關係而延期至舉行。
第二十五周
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*本輪輪空球隊：東方
由於大埔運動場草地情況欠佳，新界地產和富大埔餘下主場賽事被安排到旺角大球場上演。
第二十六周
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*本輪輪空球隊：公民
入場人數與收入
獎項
香港足球明星選舉
以下資料為本賽季香港甲組足球聯賽各獎項之得主：
關注
疑似假球事件
2009年3月31日（第二十三輪）屯門普高對愉園的聯賽，屯門普高於完場前7分鐘內連失四球以1比5落敗，中場球員周偉明在球隊輸到1比2時大叫「出聲呀，幾多球呀！換我出場呀！」。翌日，張天德在其網誌宣佈因難忍陣中4名國援未盡全力，體育精神不敵金錢而宣佈掛靴。另外兩名隊友蕭亮及梁志立亦分別在網誌中表達對球隊表現的不滿。
香港足球總會於2009年4月6日召開會議討論，決定向廉政公署尋求協助。4月9日，屯門普高就假球事件內部向足總提交調查報告，報告中各球員均否認參與打假波，而曾經提出質疑的球員亦一致改口風，解釋打假波之說純屬誤會和推測。
獎金分配
以下資料為本賽季香港甲組足球聯賽各獎項之獎金分配：
相關條目
*香港甲組足球聯賽
*亞洲足協盃
*2008–09年香港乙組足球聯賽
*2008–09年香港高級組銀牌
*2008–09年香港聯賽盃
*2008–09年香港足總盃
參考
外部連結
*[https://web.archive.org/web/20110314143739/http://www.hkfa.com/zh-hk/index.php 香港足球總會官網]
*[https://web.archive.org/web/20080915043514/http://www.hkgogoal.com/index.php 香港波網]
*[https://www.eaff.com/c/10fa/fa04/league.html 東亞足球協會官網]
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