生物分類學（）簡稱分類学（），是关于生物个体的鉴定（identification）、归类（classification）和命名（nomenclature）的原理和方法的学科；此三要件间有相互依存的关系。生物分類學範圍包括：研究生物类群间的异同程度，阐明生物间的亲缘关系、演化过程和发展规律。
要將生物分類，首先要知道生物與非生物的定義，但是我們似乎沒有辦法準確定義，以病毒來說，雖然可在其他生物體內寄生並複製，但在生物體外卻沒有一般生物的特徵如製造或攝取營養，生殖等現象。又如引起瘋牛病的朊粒（prion）可以造成感染卻無DNA成分，一直以來，DNA被視為生命遺傳物質，經由與RNA的轉錄轉譯過程，形成蛋白質，再進一步形成組成細胞的各個部分，如細胞膜、胞器等，而細胞則是我們長久以來所認為組成生命體的最小單位。
生物命名规范
关于如何为生物命名的原则有很多国际协议，例如《国际植物命名法规》（，简称ICBN）、《国际动物命名法规》（International Code of Zoological Nomenclature，简称ICZN）以及《》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）。第四版的生物命名法规（BioCode）草案在2000年出版，它试图在5个领域标准化命名，但现在还没有被正式采纳。《国际病毒命名和分类法规》（International Code of Virus Classification and Nomenclature，简称ICVCN）是属于生物命名法规的。
生物分界(kingdom)和域(domain)
传统上，生物分为五界(kingdom)，
- 原核生物界(bacteria) -- 原生生物界(protista) -- 真菌界(fungus) -- 植物界(plant) -- 动物界(animal)
Copeland提出过四界说：
- 原核生物界 -- 原生生物界 -- 植物界 -- 动物界
也有人使用三域系統说。这种分类方法是依據细胞是否有核以及细胞膜和细胞壁的差异。
- 古菌域(archaea) -- 细菌域(bacteria) -- 真核域(eukaryota)
另有一些不属于上述所有分类的介于生物和非生物之间的生命形式，即只能寄生于细胞内的病毒，而它们在细胞外并不表现出活跃的生命形式。
- 病毒 -- 类病毒 -- 朊粒
分类表
生物分類總表
这个列表以[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/ NCBI Taxonomy] 上的分類爲基礎。
生物詳細分類表
- 古菌分類表
- 細菌分類表
- 植物分類表 (NCBI)
- 动物分类表
- 真菌分类表
- 原生生物分类表
古菌域
包含嗜鹽菌、一些超嗜熱菌、嗜酸菌等。
細菌域
包含放線菌、衣原體、支原體、立克次體等。
真核生物域
植物界
包含綠藻、輪藻、苔蘚植物、蕨類植物、種子植物等。
真菌/後生動物組
真菌/後生動物組除動物界和真菌外，還包含領鞭毛蟲、魚醉菌等。
動物界
即“後生動物”組。
真菌界
包括子囊菌、擔子菌、接合菌、壺菌、聚合菌和微孢子蟲。
其餘真核生物（原生生物和真核藻類）
真核生物除動物、植物、真菌三界之外統稱原生生物，爲並系群。
- 等輻骨蟲綱（Acantharea），如等棘蟲。
- 放射蟲綱
- 雙滴蟲類（Diplomonadida），如曲滴蟲、賈第蟲。
- Parabasalidea
** 毛滴蟲綱（Trichomonada）
** 超鞭毛綱（Hypermastigia）
- 異葉足綱（Heterolobosea），如集胞菌。
- 眼蟲門
** 動質體目（Kinetoplastida）
** 眼蟲綱
- 隱藻綱（Cryptophyta）
- 定鞭藻綱（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。
- 不等鞭毛類，除下列分類還包括輻球蟲、蛙片蟲等。
** 金藻綱
**硅鞭藻綱（Dictyochophyceae）
**針胞藻綱（Raphidophyceae）
**前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes）
**卵菌綱
**褐藻門，如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。
**硅藻門
**黃藻門
*囊泡蟲類
**頂複門，如瘧原蟲。
**纖毛蟲類，如喇叭蟲、中縊蟲、榴彈蟲、草履蟲、四膜蟲。
**甲藻門
*單孢子蟲門（Haplosporidia）
*絲足蟲類
*根腫菌類（Plasmodiophorida）
*粒網足蟲類（Granuloreticulosea），如有孔蟲。
*葉足綱（Lobosea），如變形蟲（阿米巴）。
*黏菌門
*灰胞藻綱（Glaucocystophyceae）
*紅藻門，如石花菜、紫菜。
註：以上真核生物列表不完全，尚包括有其他一些未歸類原生生物。
参见
- 分类阶元
- 进化生物学、系统生物学
- 亚里士多德：《工具论》
- 林奈：双名法
- 创造分类学
注释
参考文献
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