巴伐利亞的瑪格麗特（德語：Margarete von Bayern）可以指：

，路易四世的女兒

巴伐利亞的瑪格麗特 (1363-1424)，阿爾布雷希特一世的女兒

，阿爾布雷希特三世的女兒

巴伐利亞的瑪格麗特 (1456-1501)，路易九世的女兒

，格奧爾格的女兒