日本—菲律賓關係（日语：日本とフィリピンの関係、他加禄语：Ugnayang Hapon-Pilipinas、英語：Japan–Philippines relations），又称日菲关系或菲日关系，是指日本国與菲律賓共和国之间的外交关系。目前，两国互设大使馆，日本还在菲律宾第二大城市达沃、第三大城市宿雾拥有总领事馆，而菲律宾也在日本名古屋和大阪设有总领事馆。
背景
日本與菲律賓關係主要因為日本海上經濟貿易與交通線會通過南海海域相關，日本為了確保在南海海域的海上航道安全與在南海的自由航行權，加強與南海海域相關國家的交流。南海海域相關東南亞國家因為中國針對南海島礁的軍事化建設引發南海爭議，南海周邊與中國發生島礁領土爭議衝突的菲律賓也期望透過日本的介入，平衡中國在南海的影響力。
2017年8月，新加坡聯合早報報導日本準備40,000個UH-1 Iroquois直升機零件給菲律賓，以保持菲律賓軍隊直升機維護效能。
2026年5月，菲律宾总统小費迪南德·馬科斯与日本首相高市早苗在日本东京会面，共同宣布日菲两国共同开展太平洋专属经济区与大陆架划界谈判，划界范围覆盖台湾岛以东地区。中华人民共和国外交部发言人毛宁表示，依据《联合国海洋法公约》在内的国际法，中国拥有台湾岛东部海域主权，中方对日菲擅自启动“海域划界”谈判表示强烈不满、坚决反对，并向日菲两国提出严正交涉。同月1日，中国海警派出岱山舰在台灣島以東海域開展執法巡查，並稱行为是「針對日菲單方面啟動相關劃界談判所採取的必要行動」。6月11日，針對中華人民共和國藉口到台灣東部海域執法一事，中華民國大陸委員會副主委兼發言人梁文傑在例行記者會上表示：「中共對台步步進逼，已從隱憂成為‘明憂’，其消滅中華民國的意圖不會改變，台灣要沉著以對，更要堅定」。
軍事合作
2024年7月8日，菲律宾和日本签署了《相互准入协议》(RAA)，該協議允许两国军队进入对方国家进行联合军事训练。
基礎建設
2017年10月30日，日本首相安倍晉三與菲律賓總統在東京會談後，日本表示將提供菲律賓馬尼拉首都圈地下鐵建設工程貸款，首期貸款金額為1,139億日圓，年息0.1%分攤40年償還。
文化交流
日本動漫創作者松井孝浩，畫家由今野涼，在網路推出Jose Rizal免費動漫，故事主角為菲律賓國父、菲律賓人的民族英雄黎剎，動漫語言有日文及英文兩種版本，出版商為TORICO株式會社。
民眾互信
2017年12月8日到16日，菲律賓民眾對於日本國的淨信任評分互信民調顯示，日本在菲律賓民眾心目中是第三信任的國家（+54分），排名第一名的最信任國家是美国（+68分），以及第二名加拿大（+55分）。
參考文獻
菲律賓雙邊關係
日本雙邊關係
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