VDAC1

电压依赖性阴离子选择性通道1VDAC1)是一种β桶蛋白,在人类中是由5号染色体上的VDAC1基因所製造。此蛋白質會在线粒体外膜(OMM)和细胞膜中形成离子通道:在OMM上,ATP通過該離子通道而能自线粒体扩散至细胞质;在细胞膜中,VDAC1則参与体积的调节。在所有真核细胞中,线粒体皆負責ATP的合成,並同時合成其他细胞存活所需的代谢物,VDAC1也因而參與线粒体和细胞间的通信,進而調節细胞代谢和死亡之间的平衡。除代谢物的渗透外,VDAC1还可作为己糖激酶等蛋白质的支架,參與代謝過程的調節。

该蛋白质是电压依赖性阴离子通道,与其他VDAC同种型(VDAC2和VDAC3)具有高度结构同源性,其参与细胞代谢、线粒体凋亡和精子发生的调节。该通道的过度表达和错误调节可导致细胞凋亡,导致体内多种疾病。特别是,由于VDAC1是主要的阴离子离子转运通道,其功能障碍与癌症,帕金森病(PD)和阿尔茨海默病有关。

结构
三种VDAC同种型(VDAC1,VDAC2和VDAC3)具有高度保守的DNA序列以及形成宽β-桶结构的3D结构,其中α螺旋N-末端区段驻留以部分闭合通道。VDAC1的结构由3个独立的实验室通过X射线晶体学,核磁共振(NMR)光谱学或两者的组合来解决。这些结构研究中的两个用于确定人VDAC1(hVDAC1)结构,而X射线晶体学用于解决鼠VDAC1(mVDAC1)结构,其仅与hVDAC1相差仅两个残基。这些确定的结构与先前的圆二色研究一致,该研究预测了α螺旋和β链结构域的存在。

mVDAC1的结构分析显示由19个两亲性β-链组成的桶状通道,其N-末端和C-末端均朝向线粒体的膜间隙。β-链通过环转连接并以反平行模式排列,除了平行的β-链1和19。闭合状态构象尚未被确定。另外,N-末端具有α螺旋区段,其通过与β-折叠8-18链上的残基的疏水相互作用而保持在通道的内壁。

功能
VDAC1属于线粒体孔蛋白家族,并且预测与其他VDAC同种型具有相似的生物学功能。在三种同种型中,VDAC1是主要的钙离子转运通道,并且转录最多。VDAC1通过在线粒体外膜(OMM)上运输ATP和其他小代谢物参与细胞代谢,从而允许调节TCA循环,并通过延伸,调节活性氧(ROS)的产生。

VDAC1在钙离子转运中的功能也与神经退行性疾病有关。在PD中,VDAC1增加线粒体内的钙离子水平,导致线粒体通透性增加,线粒体膜电位破坏,ROS产生增加,细胞死亡和神经元变性。已显示VDAC1与淀粉样蛋白β(Aβ)相互作用,导致通道的电导增加并最终导致细胞凋亡。

参考文献

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