真菌 · 茶年 · 中文维基百科

{{Automatic taxobox
| fossil_range = （詳見「化石紀錄」一節）
|image = Fungi collage.jpg
|image_caption = 從左上角起順時針：
擔子菌門的毒蠅傘；
子囊菌門的；
發霉的麵包；
一種壺菌；
麴菌的分生孢子
|taxon= Fungi
|authority = (L., 1753) R.T.Moore, 1980
|subdivision_ranks = 門
|subdivision =
（Tedersoo等人2018年發表的分類。此一字根也出現其他歐洲語言中，例如德文意指黴菌的「Schimmel」也源於此字根。「mycology」一詞最早出現於英國自然學家的著作《English Flora of Sir James Edward Smith》第五卷。於此時期在討論真菌類的指稱時，開始出現所指涉的名詞是指「廣義真菌」或「狹義真菌」（僅包含真菌的核心成員）的問題。1981年，湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯曾建議以「真真菌界」（Eufungi）作為狹義真菌的界名。1992年則建議以「fungi」視為廣義真菌的指稱，同年唐納德·J·S·巴爾（Donald J. S. Barr）等人又建議以「總真菌」（Union of Fungi）代指廣義真菌，「Eumycota」則訂為狹義真菌的界名。因此當時在使用Fungi一詞時，必須同時說明指的是廣義真菌還是狹義真菌。

為了解決這個混亂的命名問題，1993年卡弗利爾-史密斯規範真菌界的名稱為「Fungi」，不屬於真菌界核心成員的物種直接畫出真菌界的範圍，不再使用「Eumycota」或「Eufungi」等名詞，目前「真菌界」在共識上稱為「Kingdom Fungi」。黏菌、卵菌，及絲壺菌等非屬核心真菌的物種，近幾年已經明確移出真菌界的範圍內，因此「菌物」一詞指涉的為廣義真菌。台灣的吳聲華博士則認為現今的「真菌界」指的為狹義真菌。

特徵
在分子系统发生学問世以前，分類學家一般認為真菌屬於植物，這是因為真菌與植物有許多共同特徵，例如兩者皆不會移動，大致的形態與棲地也相當類似，真菌與植物都生長在土壤中，且部分真菌形成的產孢結構子實體外型與苔蘚植物相當類似。現在真菌被認為是獨立的一界生物，與植物與動物均不同，它們早在十億年前（大約是新元古代）就在演化上與動物分道揚鑣了，並生產許多醣類，包括糖醇（如甘露醇）、雙醣（如海藻糖）與多醣（如也存在於動物體內的肝糖）。作為真核生物。真菌也可以甲羥戊酸與焦磷酸鹽為原料合成萜烯類化合物。
*與植物：真菌與植物都具有細胞壁與大型液胞。某些真菌合成的次級代謝產物與植物合成的相當類似。不過有些外型相似的生物，例如綠藻，是靠細胞分裂來生長延長。
*類似某些動物與植物，有可以發光，另一種鑑定物種的方法是透過生理與生化性質，即依的結果來分辨。分子生物學興起後，DNA測序與支序分析等技術對真菌多樣性的研究起了決定性的作用，不但大大提高了對新物種的分辨能力（特別是隱真菌門等傳統上不清楚的低等真菌），也更能反映不同類群真菌在演化上的關聯。

歷史
真菌學是一門相對較新的科學，在十七世紀顯微鏡發明後才出現。早在1588年，吉安巴蒂斯塔·德拉·波尔塔就發現了真菌的孢子，但真菌學真正的濫觴一般認為是1729年義大利植物學家出版的《》，他除了觀察到孢子之外，還發現在適當條件下孢子可以萌發，並生長成當初產生該孢子的同一種真菌。荷蘭科學家克里斯蒂安·亨德里克·珀森被認為是現代真菌學的開創者，他以林奈的二名法為基礎建立了第一套菇類分類基礎。隨後伊利阿斯·马格努斯·弗里斯進一步採集了大量真菌標本，並以孢子顏色與其他微觀結構對真菌進行分類，許多標準至今仍被分類學家採用。其他重要的真菌學者還包括、、安東·德·巴里、與兄弟、、與等。二十世紀隨著分子生物學、生物化學、遺傳學與生物技術的突破，真菌學的研究方法逐漸現代化，DNA定序與支序分類學為真菌多樣性與演化的研究打開了另一扇門，也挑戰了許多傳統以形態為基礎的分類系統觀點，使一個隔間具有一或數個細胞核，多核菌絲則沒有隔板，基本上就是一個含有多個細胞核的巨大細胞。

許多真菌的菌絲形成特化的構造，以更容易從宿主身上吸收養分，例如許多植物病原真菌具有吸器，許多球囊菌門的真菌則形成叢枝（Arbuscular）穿透共生的植物細胞以吸取養份。有些真菌相當長壽，且可以長到非常大的體積，美國馬盧爾國家森林的一個蜜環菌菌落已生長到超過900公頃，其生長時間推測已超過9000年。

生長與生理
becoming progressively discolored and disfigured|黴菌在一顆腐爛的桃子上生長]]
真菌在固體介質中以菌絲形式生長，在水中則常以單細胞酵母菌形式生長，皆是為了提升表面積以增加吸收養分的效率。據統計有超過三分之一的真菌物種採用一種以上的方式繁殖，例如無性時期產生無性孢子，有性時期又產生不同種類的有性孢子。不同的環境刺激可以啟動特定基因表現，讓真菌長出不同的特化結構以產生無性或有性孢子。

無性生殖
真菌的無性生殖有透過產生無性孢子與菌絲斷裂（mycelial fragmentation）等機制，前者包括以孢子囊、分生孢子囊柄等特化的結構產生孢子，後者則是菌絲斷裂成為許多片段，每一片段都長成一條新的菌絲。無性生殖可以產生基因上與母體相同、佔據同樣生態棲位的子代，繁殖效率也較有性生殖迅速，可以在短時間快速拓殖。子囊菌門子实层中雙核的菌絲會形成一個鉤狀結構（crozier），以確保細胞核分裂時，兩個子細胞核可以分別妥善分配到上方與下方的細胞中，維持菌絲異質雙核（有來自雙親的兩個細胞核）的狀態。細胞中的兩個核融合之後，會立刻進行減數分裂產生子囊孢子，子囊孢子釋放、散播到其他地方後可以萌發長成新的單倍體菌絲。擔子菌門真菌的有性生殖過程與子囊菌門的類似，也是始於兩株真菌單倍體的菌絲融合而產生雙核體的菌絲，不過雙核體在擔子菌門更為普遍，除了子實體外，有時連營養菌絲也是雙核的狀態。擔子菌門的子實層會形成一種稱為扣子體的微觀結構，與子囊菌門的鉤狀結構類似，可以控制細胞核分裂後兩個子細胞核的分佈，維持菌絲異質雙核的狀態。擔子菌的子實體會特化出擔子，擔子中的兩個細胞核融合之後進行減數分裂，會產生擔孢子。最為人所知的擔子菌便是菇類，不過擔子菌也能以其他形態存在。

視野下的子囊，其中含有八枚子囊孢子]]

接合菌門的真菌在兩個體的單倍體菌絲融合後，會形成一個特化的孢子囊，孢子囊會進一步特化行成厚壁的接合孢子，對環境的抗性很大，當環境有利真菌生長時接合孢子便會萌發，進行減數分裂以產生單倍體的子細胞，並生長成菌絲。

孢子的釋放
真菌有許多主動將無性與有性孢子釋放的機制，以確保孢子可以離開子實體或菌絲而長距離傳播。許多菌絲生理、機械的機制，以及孢子表面的結構都有助於孢子的散播。有些真菌孢子的釋放機制較為特殊，馬勃與鳥巢菌的孢子需要雨水等外力將子實體爆破後才能釋出。

其他生殖方式
青黴菌與麴菌有準性生殖的現象，兩個個體的菌絲可能發生融合，造成菌絲中存在來自不同個體的細胞核，這些細胞核可能進一步發生核融合，同源染色體間產生基因重組後再分裂形成單倍體的細胞，其過程與有性生殖類似，但沒有減數分裂的發生，其發生頻率與重要性也仍不清楚。除了在同種真菌發生外，研究時則會使用酸性溶液將化石周圍的基質溶解，再使用光學顯微鏡或扫描电子显微镜觀察表面的詳細構造。

最早具有典型真菌特徵的化石可追溯至24億年前的古元古代，是棲息於海底的生物，具有可能可以互相接合的菌絲狀構造。2009年的一篇研究顯示子囊菌門的共祖便是腐生的，隨後多次在不同類群中，獨立演化出地衣的生長型態
，但因兩者缺乏許多真菌共有的特徵，生活型態也與真菌差異較大

參考書目
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真菌

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