人类Y染色体DNA单倍型类群

人类Y染色体DNA单倍型类群(Human Y-chromosome DNA haplogroup)是利用Y染色体遺傳變異特性進行人類學研究的一門科學,主要用于研究人類的“非洲起源論”及以後的種群分布的分子人類學證據。

理论基础
人類有23對46条染色体,其中22對44条为常染色体,另外一對為性染色体,XY组合的为男性,XX组合的为女性。Y染色體非重組區發生的突變會被男性後代一直繼承下去,在一層子代Y染色體上不斷出現新突變的同時,其所有子代Y染色體DNA序列上都會仍保留著突變。人類社會的大規模的人口遷移往往是男性主導的,因此父系遺傳的Y染色體單倍群的分佈有助於理解歷史上的人口遷徙事件。從各個單倍群的起源地、起源年代、擴散狀態以及它在當代/古代人群中的分佈,可以推測歷史事件發生的過程。

人类Y染色体谱系树是根据Y染色体单倍型类群的不同把全部现代智人分为不同类型,用从A到T的大写英文字母作为索引,但各索引的尺度是不同的。谱系树中的父节点代表的对应基因突变是所有子节点共有的,但反之不然。Y染色体亚当是理论上人类父系的最近共同祖先,生活在約20-30万年前。

Y染色体的命名有Y-SNP和ISOGG兩種:Y-SNP。(Y-chromosome Single Nucleotide Polymorphism,Y染色体-單核苷酸多態性)命名使用大写字母索引-實驗室大写英文字母前綴+阿拉伯數字編號的方式,其名稱恆定,便於追蹤和定義,不同實驗室可能對同一等價位點的命名不同(知名命名一般被各機構沿用),但缺點是單個SNP命名不能直接反映系統發育,反映系統發育時使用「>」連接各SNP,展示整個或部分節點;ISOGG(International Society of Genetic Genealogy,國際遺傳譜系學會)命名使用大写字母索引+(每增加一層系統發育分支,就在名字後面增加一個層級標記,阿拉伯數字和小写英文字母交替使用),可以從名字上直接反映系統發育,但缺點是隨著新SNP的不斷發現,樹型結構會不斷改變,命名也會隨著變化,出現不同版本的ISOGG,同樣的ISOGG命名在不同版本上對應不同的SNP,ISOGG版本更新跟不上不斷更新的新SNP,完整的ISOGG命名會非常長,只展示前部命名又不準確,還有一個問題是有些SNP的一級分支數量會超過26個英文字母的上限。Y染色體命名中,若於名稱後標註「*」,則表示該樣本實際所屬之下游分支無法進一步判定,且不屬於任何已知下游,若於名稱後標註「(xSNP)」,則表示該樣本已排除所列之特定下游分支,但其實際所屬之其他下游分支類型仍未能確定。

智人及近亲支序图
研究显示,尼安德特人的Y染色体与线粒体曾被智人替换。

支序图
{{Clade
| label1=单倍群类型A00-T
| 1={{Clade
| 1=单倍型类群 A00
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| 1=单倍型类群 A0
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| 1=单倍型类群 A1
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| 1=单倍型类群 B
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| label2=CF
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}}
}}
}}
}}
}}
}}

单倍型类群
单倍型类群A 和 B
单倍型类群A是非洲人的子单倍型类群,现代的所有单倍型类群起源点。BT是单倍型类群A的分支。 它有两个主要谱系,单倍型类群B和CT。

*单倍型类群 A (M91) 分布于非洲,特别分布于科伊桑人、埃塞俄比亚人(特别分布于贝塔以色列)和尼罗-撒哈拉人
**BT (M42, M94, M139, M299)约55000年前分离
***单倍型类群 B (M60) 分布于非洲, 特别分布于俾格米人和
***CT (见下)

有M168 (CT)变异的单倍型类群
定义突变分离CT(除A和B的所有单倍型类群)为M168和M294。这些突变早于“走出非洲”的迁移。DE突变的定义可能发生在非洲东北部,大约65000年前。 P143突变定义了单倍型类群CF。可能发生在那时,将现代人类带至亚洲南部海岸。

*单倍型类群 CF(P143):分布于非洲之外、包括整个欧亚大陆、大洋洲、和美洲
**单倍型类群 C(M130、M216):分布于亚洲、 大洋洲、北美
***单倍型类群 C1(M8、M105、M131):分布于日本
***单倍型类群 C2(M38):分布于印度尼西亚、 新几内亚、 美拉尼西亚、密克罗尼西亚,和玻利尼西亚
***单倍型类群 C3(M217、 P44):分布于整个欧亚大陆和美洲,高频分布于通古斯民族、蒙古人、卡爾梅克人等人群
***单倍型类群 C4(M347):分布于澳大利亚原住民
***单倍型类群 C5(M356):分布于印度次大陆、阿拉伯半岛,和東亞大陸北部
**单倍型类群 F(M89、M213)(见下)
*单倍型类群 DE(M1、 M145、 M203):约65000年前
**单倍型类群 D(M174):分布于安达曼群岛、雲貴高原、青藏高原、庫頁岛、千島群島、日本群島
***单倍型类群 D1(M15)
***单倍型类群 D2(M55、 M57、 M64。1、 M179、 P12、 P37。1、 P41。1 (M359。1)、12f2。2)
***单倍型类群 D3 (P47)
**单倍型类群 E (M40、M96):主要分布于非洲
***单倍型类群 E1 (P147)
****单倍型类群 E1a(M33、M132):之前为E1
****单倍型类群 E1b(P177)
*****单倍型类群 E1b1(P2、DYS391p):之前为E3
******单倍型类群 E1b1a(V38):分布于非洲、特别分布在尼日尔-刚果语系人群;之前为E3a
******单倍型类群 E1b1b(M215):分布于东非、 北非、中东、和欧洲(特别分布于地中海地区);之前为E3b
***单倍型类群 E2 (M75)

单倍型类群 F (G, H & IJK)
单倍型类群F发现于大约90%的世界人口,但几乎完全在撒哈拉以南非洲地区之外。IJ的突变对应于45000年前的一个中东或南亚地区的移民浪潮,随后迁移到欧洲 (克罗马儂人)。
单倍型类群G,30000年前起源于中东地区,或更东的地区至巴基斯坦,并迁移至欧洲引发新石器革命。单倍型类群H可能30000-40000年前起源于印度,并随罗姆人迁移至西方。单倍型类群K在欧亚大陆, 澳洲和南太平洋分布极广。

单倍型类群 F(极少发现)

*单倍型类群 G (M201)约21000年前分离分布于欧亚大陆很多民族; 常见于高加索, 伊朗, 安纳托利亚和黎凡特。几乎分布于所有的欧洲国家,但最常见于加告兹、罗马尼亚东南部、希腊、意大利、西班牙、葡萄牙、蒂罗尔和波希米亚,在地中海群岛上最尤为常见; 在北欧则不常见少量分布于中国西北部和印度、巴基斯坦、斯里兰卡、马来西亚和北非
**单倍型类群 G1
**单倍型类群 G2
***单倍型类群 G2a
****单倍型类群 G2a1
****单倍型类群 G2a2
****单倍型类群 G2a3
*****单倍型类群 G2a3a
*****单倍型类群 G2a3b
******单倍型类群 G2a3b1
***单倍型类群 G2b
***单倍型类群 G2c (之前为单倍型类群 G5)
****单倍型类群 G2c1

*单倍型类群 H(M69)主要分布于南亚
**单倍型类群 H1
**单倍型类群 H2

*单倍型类群 IJK
**单倍型类群 IJ (P123, P124, P125, P126, P127, P129, P130) 约45000年前分离
***单倍型类群 I (M170, M258) 分布于欧洲和部分近东地区
****单倍型类群 I1 (M253) 主要分布于北欧
****单倍型类群 I2 (P215) 主要分布于巴爾幹半島和撒丁岛;I2B1 (m223)主要分布于歐洲西部、中部和北部。
***单倍型类群 J (M304, S6, S34, S35)
***单倍型类群 J (索科特拉岛之外非常罕见)
****单倍型类群 J1关联于东北高加索语系人群,分布于美索不达米亚达吉斯坦共和国和闪米特人、黎凡特、阿拉伯半岛、埃塞俄比亚和北非
****单倍型类群 J2 (M172) 主要分布在美索不达米亚、安纳托利亚、地中海东部、希腊、巴尔干、意大利、伊朗和高加索地区。于中国的一项遗传学研究表明J2-M172在维吾尔族(17/50 = 34%)和乌兹别克族(7/23 = 30.4%)中出现频率较高,在帕米尔高原(5/31)中的出现频率为中等(16.1%),并且在汉族中也有分布(10%)。
**单倍型类群 K (M9) 遍布欧亚大陆、大洋洲和美洲
***LT (见下)

单倍型类群 K (M9)
单倍型类群L主要分布于南亚。单倍型类群M则最流行于美拉尼西亚。NO单倍型类群在35000-40000年前出现在亚洲。
单倍型类群N可能起源于东南亚并扩散到西伯利亚北部和西部,最常见分布于乌拉尔语系人群。单倍型类群O最常见分布于东亚和东南亚,少量分布于大洋洲、中亚和南亚。单倍型类群P引出了群组Q和R,并且很少发现在其未分化的阶段。很可能起源于中亚或阿尔泰地区。单倍型类群Q也起源于中亚,向东迁移到北美。

单倍型类群 K分布于美拉尼西亚和澳洲
*单倍型类群K1(之前为单倍型类群 K3)分布于印度次大陆
*单倍型类群K2(之前为单倍型类群 K4)
*单倍型类群K3(之前为单倍型类群 K6)分布于美拉尼西亚和玻利尼西亚
*单倍型类群K4 分布于巴厘岛

*单倍型类群 LT (K1/L298/P326)
**单倍型类群 L (M20) 分布于南亚、中亚、西南亚、地中海
**单倍型类群 T (之前被称为“单倍型类群 K2”) (M184、M70、M193、M272) 分布于非洲 (主要为亚非语系人群)、中东、地中海、南亚。极少分布于夏卡、索马里人、伊维萨岛、斯泰尔维奥、埃塞俄比亚人、富拉尼人、埃及人和阿曼; 也很少分布在整个地中海和印度局部
*单倍型类群 MNOPS (K2/K(xLT)/rs2033003/M526)
**单倍型类群K2a (M2313)
***单倍型类群 NO (M214) 35000-40000年前分离
***单倍型类群 NO (极少发现)
****单倍型类群 N (M231) 高频分布于欧亚大陆北端,特别是乌拉尔语系人群
****单倍型类群 O (M175) 分布于东亚,东南亚,南太平洋
**单倍型类群K2b (P331)
***单倍型类群 SM
****单倍型类群 S (M230)(之前被称为“单倍型类群 K5”)分布于新几内亚高地
****单倍型类群 M (P256) 分布于新几内亚和美拉尼西亚
***单倍型类群 P (M45)
***单倍型类群 P (极少发现)
****单倍型类群 Q (MEH2、M242、P36) 分布于土库曼斯坦、西伯利亚和美洲
****单倍型类群 R (M207、M306) 分布于欧洲,西亚,中亚和南亚

单倍型类群 NO (M214)
NO单倍型类群在35000-40000年前出现在东亚。单倍型类群N可能起源于亚洲东部并向北和向西传播于西伯利亚,高频分布于一些乌拉尔语系人群。单倍型类群O最常分布于东亚、东南亚等

*单倍型类群 NO (M214)35000-40000年前分离(极少发现)。
**单倍型类群 N (M231) 主要分布于东亚、北亚、北歐、東歐等,高频分布于乌拉尔语系人群、波羅的人、雅库特人等
***单倍型类群 N1 (LLY22g)
**单倍型类群 O (M175) 主要分布于东亚、西伯利亚、中亚、东南亚、南亚和南太平洋诸岛
***单倍型类群 O1a (MSY2.2) 主要分布于东亚和东南亚和南太平洋诸岛
***单倍型类群 O1b (P31, M268)
****单倍型类群 O1b1a1a (M95) 主要分布于东亚、东南亚和南亞
****单倍型类群 O1b2 (SRY465,M176) 主要分布于日本群島和朝鲜半岛
***单倍型类群 O2 (M122) 主要分布于东亚、东南亚、南亚、中亚,高频于分布于漢藏民族、朝鮮族等

单倍型类群 P
P是单倍群K的一个分支,单倍群NO是另一个分支。P-P295有两个分支:P1 (P-M45)和 P2 (P-B253)。P1是单倍群Q和单倍群R的祖先。Q-M242和R-M207,都有一个共同的标记M45。虽然今天东南亞、西伯利亚、中亚都有P*,但是P(P295)可能起源于东南亚,向北边迁移,分为单倍群R和单倍群Q,向欧洲和美洲迁徙。目前,单倍群Q和R包括很多欧洲人、美洲原住民、和南亚人。

单倍型类群 Q
Q被定义由SNP M242。认为出现在大约35000-40000年前的中亚。单倍型类群Q的亚类型和定义变异,根据2008 ISOGG树在下文提供。作为一种新型的Q系(Q5),在印度人中已经被低频率发现

2008 ISOGG树

*Q (M242)
*Q
**Q1 (P36。2)
**Q1
***Q1a (MEH2)
***Q1a
****Q1a1 (M120, M265/N14) 少量分布于东干人、汉族、哈扎拉人、日本人、朝鲜族和藏族
****Q1a2 (M25, M143) 中低分布于西南亚、中亚和西伯利亚
****Q1a3 (M346)
****Q1a3 少量分布于巴基斯坦、印度和西藏
*****Q1a3a (M3) 典型分布于美洲原住民
*****Q1a3a
******Q1a3a1 (M19) 分布于一些南美原住民,如和瓦尤人
******Q1a3a2 (M194)
******Q1a3a3 (M199, P106, P292)
****Q1a4 (P48)
****Q1a5 (P89)
****Q1a6 (M323) 极少分布于也门犹太人
***Q1b (M378) 少量分布于哈扎拉族和信德族

单倍型类群 R
单倍型类群R的定义由SNP M207。大部分单倍型类群 R表现为R1a和R1b。
R1a可能起源于欧亚大草原,伴随斯基泰人文化和原始印欧语人群的扩张。主要分布于中亚、南亚和东欧。R1b可能起源于中亚。在西欧占主导地位,也稀少分布在亚洲和非洲。其子群R1b1a2 (M269)在现代欧洲人分布最常见,特别在西欧。

*单倍型类群 R1 (M173) 分布于整个欧亚大陆西部
**单倍型类群 R1a (M17) 分布于中亚、南亚和欧洲中部、北部、东部
**单倍型类群 R1b (M343) 分布于西欧、西亚、中亚、北非、乍得和北部喀麦隆
*单倍型类群 R2 (M124) 分布于南亚、高加索、中亚和东欧

单倍型类群在欧洲的时间发展
相关条目

  • 东亚和东南亚人群的Y染色体DNA单倍型类群

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  • 人类线粒体DNA单倍体群

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  • 单倍型类群

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  • 基因学

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参考文献

外部連結
*[https://web.archive.org/web/20080202072252/http://www/。scs。uiuc。edu/~mcdonald/WorldHaplogroupsMaps。pdf UIUC maps showing worldwide distribution of Y chromosome和Mitochondrial DNA haplogroups]
*[https://web.archive.org/web/20160111230315/http://v/。youku。com/v_show/id_XMTcwNzU1NzE2。html youku科普視頻《人類學、族群、姓氏和Y染色體》]
*[http://www。isogg。org/tree/ ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree]
[https://web.archive.org/web/20060326070849/http://www/。scs。uiuc。edu/~mcdonald/WorldHaplogroupsMaps。pdf Map of Y Haplogroups][https://web.archive.org/web/20050628201830/http://www3/。nationalgeographic。com/genographic/atlas。html Atlas ofHuman Journey], fromGenographic Project, National Geographic
*[http://www。dnaheritage。com/ysnptree。asp DNA Heritage's Y-haplogroup map]
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[http://www。worldfamilies。net/yhapprojects Worldfamilies Y Haplogroup & Sub-clade Projects][https://web.archive.org/web/20060326070849/http://www/。kerchner。com/haplogroups-ydna。htm Kerchner's YDNA Haplogroup Descriptions, Projects & Links]
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