托马斯·亨特·摩尔根（，），美国进化生物学家、遗传学家、胚胎学家，染色体遗传学的奠基人。
摩尔根于1890年在约翰斯·霍普金斯大学研究胚胎学，获得动物学博士学位，并在布林茅尔学院任教期间从事胚胎学研究。1900年孟德尔遗传规律重新被发现后，摩尔根开始研究黑腹果蝇的遗传特性。在哥伦比亚大学谢默霍恩楼（Schermerhorn Hall）著名的“果蝇实验室”中，摩尔根证明基因位于染色体上，而染色体是遗传的物理基础。这些发现奠定了现代遗传学的科学基础。
1933年，摩尔根因阐明染色体在遗传中的作用而获颁诺贝尔生理学或医学奖。在其学术生涯中，摩尔根共撰写22部专著与370篇科学论文。
他发现位于同一染色体上的基因之间的链锁遗传特性，将多种突变基因定位在染色体上，制成染色体图谱，即基因的连锁图。
他著有《基因论》《进化论的科学基础》《胚胎学和实验遗传学》等书。
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