吉林河流列表列舉了《中国河湖大典·黑龙江、辽河卷》中收录的（有条目的）全部或部分在吉林省境內的河流，並依照流域排列；支流則由河口至源頭排序。
遼河水系
*遼河
**招苏台河
***二道河
***条子河
**東遼河：跨省區河流，上、中游各有一小段為吉林、遼寧界河，下游位於內蒙古、遼寧境內。
***兴开河
***小辽河
***卡伦河
***乌龙半截河
***半截河
***大梨树河
***渭津河
***灯杆河
**西遼河：跨省區河流，下游分屬遼寧、內蒙古、吉林，中、上游位於內蒙古境內。
***新开河：跨省區河流，下游最末段為內蒙古、吉林界河，其餘位於內蒙古境內。
***文牛格尺河
鴨綠江水系
*鴨綠江：跨國、跨省河流，中國、朝鮮界河。
**浑江：跨省河流，下游位於遼寧境內。
***富尔江：跨省河流，中游位於遼寧境內。
***小新开河
***苇沙河
***蝲蛄河
***哈泥河
***大罗圈河
***红土崖河
**三道沟河
**五道沟河
**八道沟河
**十三道沟河
**十九道沟河
圖們江水系
*圖們江：跨國河流，中國、朝鮮界河。
**琿春河
***兰家趟子河
**密江
**嘎呀河
***布尔哈通河
****海兰河
*****长仁河
*****蜂蜜河
****朝阳河
****福兴河
***汪清河
***前河
***春阳河
***桦皮甸子河
**红旗河
***大马鹿河
綏芬河水系
*綏芬河
**瑚布图河
**大綏芬河
黑龍江水系
*黑龙江：跨國河流
**松花江：跨省河流。
***牡丹江：跨省河流，下游位於黑龍江省境內。
****海浪河
****珠尔多河
****沙河
****黄泥河
****小石河
***拉林河：跨省河流，下游為吉林、黑龍江界河，上游位於黑龍江省境內。
****大荒沟
****卡岔河
*****二道河
****溪浪河：跨省河流，下游位於黑龍江省境內。
*****霍伦河
******桃源河
***嫩江：跨省區河流，源流位於內蒙古境內，上游為吉林、內蒙古界河，中、下游位於吉林境內，但有一小段為吉林、內蒙古界河。
****霍林河：跨省區河流，上游位於內蒙古境內。（下游為季節性河流）
****洮儿河：跨省區河流，上游位於內蒙古境內。
*****蛟流河：跨省區河流，上游位於內蒙古境內。
******那金河：跨省區河流，上游位於內蒙古境內。
***飲馬河
****伊通河
*****新凯河
******宝泉河
****雾开河
****岔路河
****双阳河
***沐石河
***团山子河
***鳌龙河
****大绥河
***牤牛河
***温德河
***蛟河
****拉法河
***漂河
***辉发河
****金沙河
****呼兰河
****富太河
****挡石河
****三统河
****一统河
****大沙河
****莲河
****大横道河
***山麻河
***头道松花江
****那尔轰河
****珠子河
****松江河
****锦江
***露水河
***头道白河
***古洞河
****富尔河
***五道白河
參考文獻
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