以下為日本現存的神道神社列表，以日本都道府縣排列。
北海道地方
札幌市
*北海道神宮
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*信濃神社
*札幌護國神社
*苗穗神社
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*水天宮 (札幌市)
*定山渓神社
*瑞穂神社
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*星置神社
*三里塚神社
*豊畑神社
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*豊滝神社
*札幌藤野神社
北廣島市
*廣島神社
*輪厚神社
*大曲神社
*西の里神社
江別市
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*大麻神社
*豊幌神社
石狩市
*
*生振神社
*
*高岡神社 (石狩市)
*
*当別神社
*
*材木澤神社
*新篠津神社
*
*厚田八幡神社
*
*群別稲荷神社
*川下八幡神社
*幌稲荷神社
*生北神社
*
石狩郡
*中小屋神社
*対雁通相馬神社
*東裏神社
*
*愛宕神社 (石狩郡)
*獅子內神社
惠庭市
*
*恵庭神社
*
*柏木神社 (恵庭市)
千歲市
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函館市
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*大山祇神社 (函館市)
*住三吉神社
*船魂神社
*上湯川稲荷神社
*豊川稲荷神社
*大森稲荷神社
*船見稲荷神社
*海神社
*函館水天宮
*尻岸内八幡神社
*惠山嚴島神社
*日浦稲荷神社
*海積神社
*八幡神社 (函館市八幡町)
*比遅里神社
*三島神社
*鍛治稲荷神社
*根崎川濯神社
*志海苔八幡神社
*銭亀八幡神社
*石倉稲荷神社
*古川川濯神社
*石崎八幡神社
*臼尻嚴島神社
*安浦稲荷神社
*大船稲荷神社
*神山稲荷神社
*石崎地主海神社
*川上神社
*乃木神社 (函館市)
松前郡
*江良八幡神社
*原口八幡神社
*清部八幡神社
*赤神神社
*館浜稲荷神社
*渡海神社 (松前郡)
*浅間神社 (松前郡松前町)
*荒神神社 (松前郡)
*松前神社
*
*熊野神社 (松前郡)
*天満神社 (松前郡)
*
*三社神社 (松前郡)
*大澤神社
*狩場神社
*稲荷神社 (松前町荒谷)
*
*宮歌八幡神社
*吉野八幡神社
*福島大神宮
*月崎神社
*白符大神宮
*弁天神社
北斗市
*矢不来天満宮
*丸山神社 (北斗市)
*瑞石神社
*七重浜海津見神社
亀田郡
*三嶋神社
*大中山神社
*字峠稲荷神社
*鶴野稲荷神社
*藤城稲荷神社
*上軍川稲荷神社
*一本栗地主神社
茅部郡
*鹿部稲荷神社
*本別稲荷神社
二海郡
*八雲神社
山越郡
*飯生神社
檜山郡
*
*檜山護國神社
*上ノ國八幡宮
*中須田稲荷神社
*扇石愛宕神社
东北地方
青森縣
*櫛引八幡宮
*弘前八幡宮
*諏訪神社
*猿賀神社
*岩木山神社
岩手縣
*
*駒形神社
宮城縣
- 八幡神社
*仙台東照宮
*志波彦神社
*鹽竈神社（鹽竈市）
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*竹駒神社
*櫻田山神社
秋田縣
*古四王神社
山形縣
*湯殿山神社
*出羽神社
*月山神社
*鳥海山大物忌神社
*上杉神社
*八所神社
福島縣
*靈山神社
*馬場都都古別神社
*八槻都都古別神社
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*伊佐須美神社
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关东地方
茨城縣
*八幡神信仰・八幡宮
**若宮八幡宮(常陸太田市)
*常盤神社（茨城縣）
*筑波山神社（茨城縣くば市）
*静神社（那珂市）
*酒列磯前神社
*春日神社
**本源：鹿島神宮（鹿嶋市）
*大杉神社
**總本社：大杉神社（稲敷市）
*大洗磯前神社
*稻荷神信仰・稻荷神社
**笠間稲荷神社（笠間市）
栃木縣
*二荒山神社(日光市)：⇒日光二荒山神社
*二荒山神社(宇都宮市)：⇒宇都宮二荒山神社
*＜東照宮＞
**本社：日光東照宮（栃木縣日光市）
*唐澤山神社
群馬縣
*世良田東照宮
*一之宮貫前神社（群馬縣富岡市）：⇒貫前神社
埼玉縣
*秩父神社(秩父市)
*箭弓稻荷神社(東松山)
*＜氷川神社＞
**本社：冰川神社(川越市)
*氷川女体神社
*所澤神明社（埼玉縣所澤市）
*調神社
*高麗神社
*金鑚神社
*＜大杉神社＞
**大杉神社（埼玉縣ふじみ野市）
千葉縣
*玉前神社（千葉縣）
*小御門神社
*＜春日神社＞
**本源
***香取神宮(香取市)
*安房神社(館山市)
東京都
*明治神宫（東京都）
*神田神社
*大國魂神社 (武蔵)(東京都府中市)
*東郷神社
*靖國神社(東京都千代田區)
*谷保天満宮
*＜日吉神社、日枝神社、山王権現＞
**日枝神社(東京都千代田區)
*乃木神社（東京都港區、山口縣下関市）
*築土神社（東京都千代田區）
*＜水天宮＞
**水天宮
*松陰神社（東京都世田谷區、山口縣萩市）
*宮中三殿（賢所、皇霊殿、神殿）（東京都千代田區皇居内）
*大國魂神社（東京都府中市）
*出雲大社（島根縣出雲市）
**出雲大社東京分祠（東京都港區）
*＜愛宕神社＞
**愛宕神社（東京都港區）
*御獄神社
神奈川縣
*＜辯才天信仰、宗像三神＞
**江島神社
*船越神社(横須賀市船越町)
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**鶴岡八幡宮（神奈川縣鎌倉市）
**富岡八幡宮（橫濱市金沢區）
*箱根神社
*鶴嶺八幡宮（茅ヶ崎市）
*瀬戸神社（橫濱市）
*杉山神社（橫濱市）
*寒川神社（寒川町）
*兒玉神社（神奈川縣藤澤市、山口縣周南市）
*雷神社 (橫須賀市追浜)
*鎌倉宮
*大山阿夫利神社（伊勢原市）
*江島神社
*蛭子神社
中部地方
新潟縣
*度津神社（新潟縣佐渡市）
*弥彦神社
富山縣
*＜日吉神社、日枝神社、山王権現＞
**日枝神社（富山市）
*速星神社（富山市）
*高瀨神社（富山縣）
*杉原神社
*白鳥神社（婦負郡）
*雄山神社（立山町）
*鵜坂神社
*射水神社（高岡市）
*赤丸淺井神社
*氣多神社（高岡市，越中国一宮）
石川縣
*
*＜白山神社＞
**本社：白山比咩神社（「咩」＝「口羊」）
*氣多大社
*尾山神社
*宇多须神社
福井縣
*若狭彦神社
*藤島神社
*剣神社（福井縣）
*氣比神宮（敦賀市）
*金崎宮
山梨縣
*＜浅間神社＞ (山梨縣)
**北口本宮冨士浅間神社(富士吉田市)
**浅間神社（笛吹市）：⇒一宮浅間神社
長野縣
*穂高神社
*戸隠神社（長野縣）
*＜多賀神社＞
**多賀神社（松本市）
*＜諏訪神社＞
**本社：諏訪大社
*＜塩釜神社＞
**塩釜神社(松本市)
*芋川神社（飯綱町）
*生島足島神社
岐阜縣
*養老神社(養老町)
*水無神社
*南宮大社（岐阜縣垂井町）
*伊奈波神社（岐阜市）
静岡縣
- ＜三嶋神社、三島神社（事代主神）＞
** 本社：三嶋大社（静岡縣）
*＜東照宮＞
*久能山東照宮（静岡市）
*小國神社
*伊豆山神社
*井伊谷宮
*＜浅間神社＞
**本社：浅間大社（富士宮市）：⇒富士山本宮浅間大社
**浅間神社（静岡市葵區）：⇒静岡浅間神社
*＜秋葉神社＞
**本社：秋葉山本宮秋葉神社（濱松市）
愛知縣
*若宮八幡社(名古屋市)
*矢作神社(岡崎市)
*真清田神社(愛知縣)
*氷上姉子神社(名古屋市)
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**鳴海八幡宮(名古屋市綠區)
**足助八幡宮(豊田市足助町)
*那古野神社（名古屋市）
*成海神社（名古屋市緑區）
**豊國神社（名古屋市中村區）
*砥鹿神社
*津島神社
*高座結御子神社（名古屋市）
*田縣神社（小牧市）
*＜鹽釜神社＞
**鹽竈神社（名古屋市天白區）
*尾張大國靈神社
*大縣神社
*＜稻荷神信仰・稻荷神社＞
**寺院：豊川稻荷（豊川閣妙嚴寺）（豊川市）
*熱田神宮（名古屋市熱田區）
近畿地方
三重縣
*＜伊勢信仰＞
**正宮：伊势神宫（三重縣伊勢市）
**內宮：皇大神宮（伊勢市）
***内宮別宮：荒祭宮（内宮域内）・月讀宮（伊勢市）・月讀荒御魂宮（月讀宮域内）・伊佐奈岐宮（月讀宮域内）・伊佐奈弥宮（月讀宮域内）・瀧原宮（大紀町）・瀧原竝宮（瀧原宮域内）・伊雜宮（志摩市）・風日祈宮（内宮域内）・倭姫宮（伊勢市）
**外宮：豐受大神宮（伊勢市）
***外宮別宮：多賀宮（外宮域内）・土宮（外宮域内）・月夜見宮（伊勢市）・風宮（外宮域内）
*＜天満宮、天神社＞
**上野天神（菅原神社）
*＜春日神社＞
**春日神社（桑名市）
*結城神社（津市）
*水屋神社（松阪市）
*椿大神社（鈴鹿市）
*多度大社（桑名市）
*高倉神社（伊賀市）
*猿田彦神社（伊勢市）
*北畠神社（津市）
*敢國神社（伊賀市）
*伊射波神社（鳥羽市，志摩国一宮）
*都波岐奈加等神社（鈴鹿市）
滋賀縣
*御上神社
*＜辯才天信仰、宗像三神＞
**竹生島神社（都久夫須麻神社）(滋賀縣びわ町)
*＜日吉神社、日枝神社、山王権現＞
**本社：日吉大社(大津市)
*長等神社（大津市）
*建部大社（滋賀縣大津市）
*＜多賀神社＞
**本社:多賀大社（多賀町）
*近江神宮（大津市）
京都府
*宇治上神社(京都市宇治市)
*吉田神社
*六孫王神社(京都市南區)
*離宮八幡宮(大山崎町)
*八坂神社(京都市東山區)
*元伊勢籠神社：⇒籠神社
*三宅八幡宮(京都市左京區)
- ＜松尾神社＞
** 本社：松尾大社（京都市西京區）
*豊国神社（京都市東山區）
*平野神社(京都市北區)
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**石清水八幡宮（八幡市）
**離宮八幡宮（大山崎町）
*長岡天満宮（長岡京市）
*梨木神社(京都府)
*＜天満宮、天神社＞
**本社：北野天満宮（京都市）
*建勲神社
*晴明神社
*白峰神宮
*城南宮(京都市)
*志磨神社
*籠神社
*護王神社
*御香宮神社（京都市伏見區）
*貴船神社（京都市）
*北野天満宮（京都市）
*祇園社（京都府）：⇒八坂神社
*賀茂神社（京都市）
**賀茂別雷神社（上賀茂神社）(京都市北區)
**賀茂御祖神社（下鴨神社）(京都市左京區)
*＜春日神社＞
**大原野神社
**吉田神社
*梅宮大社（京都市）
*石清水八幡宮（八幡市）
*＜稻荷神信仰・稲荷神社＞
**本社：伏見稲荷大社（京都市伏見區）
*出雲大神宮（京都府龜岡市）
*＜愛宕神社＞
**本社：愛宕神社（京都市右京區）
*旦椋神社
*大嶋坐天照御魂神社
大阪府
*日根神社(泉佐野市)
*開口神社(堺市堺區)
*飛鳥戸神社(羽曳野市)
*阿部野神社(大阪市阿倍野区)
*水無瀬神宮(島本町)
*方違神社(堺市)
*星田神社(交野市)
*星田妙見宮(交野市)
*船待神社(堺市)
*舊府神社(和泉市)
*枚岡神社(東大阪市)（河内一宮）
*聖神社(和泉市)
*＜八幡神信仰・八幡＞
**（羽曳野市）
**（堺市）
*豊国神社（大阪市中央區）
*（高石市）
*＜天満宮、天神社＞
**大阪天満宮（大阪市）
**（大阪市）
**（藤井寺市）
*（御初天神、大阪市）
*（堺市南区）
*高須神社（堺市堺区）
*（高石市）
*＜住吉三神信仰・住吉神社＞
**本社：住吉大社 （大阪市住吉区）
*助松神社（泉大津市）
*（和泉市）
*四条畷神社（四條畷市）
*（池田市）
*（枚方市）
*（堺市西区）
*（岸和田市）
*方違神社（大阪府堺市）
*＜春日神社＞
**本源：元春日・枚岡神社
*大鳥大社（堺市西区）
*大津神社（泉大津市）
*（堺市西区）
*（大阪市浪速区）
*＜稲荷神信仰・稲荷神社＞
**（東大阪市）
**（堺市東区）
*（泉大津市）
*（和泉市）
*（東大阪市）
*（堺市堺区）
*坐摩神社（大阪市中央区）
*生国魂神社（大阪市天王寺區）
兵庫縣
*海神社
*賣布神社（寶塚市）
*寶塚神社（寶塚市）
*湊川神社（神戸市）
*松原八幡神社（姫路市）
*廣田神社（西宮市）
*東天神社（伊丹市）
*西天神社（伊丹市）
*西宮神社（西宮市）
*長田神社（神戸市）
*多田神社（川西市）
*宗佐厄神八幡神社（加古川市）
*＜住吉三神信仰・住吉神社＞
**住吉神社（神戸市）
*生石神社（石之寶殿、高砂市）
*伊和都比売神社（赤穂市）
*伊和神社（宍粟市，播磨国一宮）
*猪名野神社（伊丹市）
*射楯兵主神社（播磨國總社、姫路市）
*魚吹八幡神社（津之宮）（姫路市）
*出石神社（豐岡市，但馬国一宮）
*伊弉諾神宮（淡路市，淡路国一宮）
*生田神社（神戸市中央區）
*岡田神社
*粟鹿神社（朝来市，但馬国一宮）
*廣峯神社（姫路市，廣峯牛頭天王）
奈良縣
*鏡作神社
*竜穴神社(室生町)
*吉水神社(吉野町)
*吉野水分神社(吉野町)
*吉野神宮(吉野町)
*玉置神社(奈良縣吉野郡十津川村)
*夜支布山口神社
*六県神社
*＜辯才天信仰、宗像三神＞
**天河神社(天河大辯財天社，天河神社・天川村)
*広瀬大社
*桧原神社(櫻井市)
*氷室神社(奈良市)
*兵主神社(櫻井市)
*一言主神社(御所市)
*脳天大神（奈良縣）
*丹生川上神社
*談山神社（櫻井市）
*手向山八幡宮（奈良市）
*龍田大社
*高天彦神社（御所市）
*高鴨神社（御所市）
*狭井神社
*源九郎稲荷神社
*金峰神社（吉野町）
*漢国神社（奈良市）
*勝手神社（吉野町）
*＜春日神社＞
**本社：春日大社（奈良市）
*橿原神宮（橿原市）
*鏡作神社
*柿本神社
*大和神社：（大倭供）
*大神神社（櫻井市）
*采女神社（奈良市）
*石床神社
*石上神宮（天理市）
*往馬神社（生駒市）
*率川神社（奈良市）
*天乃岩立神社（奈良市）
*飛鳥坐神社（明日香村）
*十二神社
和歌山縣
*藤白神社(海南市)
*日前神宮（和歌山縣和歌山市）
*丹生官省符神社
*丹生都比売神社 (和歌山縣伊都郡かつらぎ町)
*＜熊野神社＞
**主系統本社：
***熊野速玉大社 (和歌山縣新宮市)
***熊野本宮大社 (和歌山縣田邊市本宮町)
***熊野那智大社 (和歌山縣東牟婁郡那智聖埔町)
*國懸神社
*竈山神社
*伊太祁曽神社（和歌山市）
中国地方
鳥取縣
*名和神社（鳥取縣）
*倭文神社
*大神山神社
*宇部神社
*賣沼神社
*酒賀神社
*白兔神社
*若櫻神社
島根縣
*物部神社
*美保神社
*水若酢神社(舊五箇村；現隠岐島町)
*日御崎神社
*玉若酢命神社（島根縣隠岐島町）
*須佐神社
*佐太神社
*＜熊野神社＞
**別系統：熊野大社
*＜稲荷神信仰・稲荷神社＞
**太鼓谷稲成神社 （津和野町）
*出雲大社（出雲市）
*由良比女神社
*岩根神社
岡山縣
*和気神社
*中山神社（岡山縣）
*吉備津彦神社（岡山市）
*吉備津神社（岡山市）
*＜稲荷神信仰・稲荷神社＞
**寺院：最上稲荷（稲荷山妙教寺）
*安仁神社
*總社宮
廣島縣
*＜辯才天信仰、宗像三神＞
**嚴島神社(廿日市市宮島町)
*速谷神社
*沼名前神社(福山市)
*吉備津神社（廣島縣福山市）
*糸崎八幡神社（三原市）
山口縣
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**遠石八幡宮(周南市)
*野田神社（山口縣山口市）
*豊榮神社（山口市）
*＜天満宮、天神社＞
**防府天満宮（防府市）
*玉祖神社（防府市）
*＜住吉三神信仰・住吉神社＞
**住吉神社 (長門國)（下関市）
*松陰神社（東京都世田谷區、山口縣萩市）
*兒玉神社（神奈川縣藤澤市、山口縣周南市）
*忌宮神社（下関市）
*赤間神宮（下関市）
四国地方
德島縣
*大麻比古神社（德島縣）
*忌部神社
香川縣
*田村神社（香川縣）
*＜金比羅神社＞
**本社：金刀比羅宮（琴平町）
*琴弾八幡宮（觀音寺市）
愛媛縣
- ＜三嶋神社、三島神社（大山祇神）＞
** 本社：大山祇神社（愛媛縣）
*伊曽乃神社
**出雲大社松山分祠（松山市）
*石鎚神社
*浮島神社
高知縣
*山内神社
*土佐神社（高知縣）
九州地方
福岡縣
*＜辯才天信仰、宗像三神＞
**本社：宗像大社(宗像市)
*風浪宮(大川市)
*英彦山神宮
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**八幡古表神社
**宇美八幡宮（宇美町）
*筥崎宮（福岡市）
*＜天満宮、天神社＞
**本社：太宰府天満宮（福岡縣太宰府市）
*＜水天宮＞
**本社：久留米水天宮
*志賀海神社
*高良大社
*櫛田神社（福岡市博多區）
*竈門神社
*香椎宮
*＜愛宕神社＞
**愛宕神社（福岡市西區）
*春日神社（春日市）
佐賀縣
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**本社：宇佐神宮（大分縣宇佐市）
**千栗八幡宮（佐賀縣）
*豊玉姫神社
*田島神社
*佐嘉神社
*＜稻荷神信仰・稻荷神社＞
**祐德稻荷神社（鹿島市）
長崎縣
*海神神社
*諏訪神社（長崎縣）
*＜住吉三神信仰・住吉神社＞
**住吉神社
*天手長男神社（壱岐市）（壱岐一宮）
熊本縣
*八代宮
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**藤崎八幡宮
*菊地神社（熊本縣）
*阿蘇神社（阿蘇市）
大分縣
*日田神社(日田市)（奉祀大蔵永季。相撲之神）
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**大波羅(大原)八幡宮(日田市)
**柞原八幡宮
*＜宇佐神宮＞
**本社：宇佐神宮（大分縣宇佐市）
**薦神社（中津市）：稱之為宇佐神宮的祖宮
*中津神社（中津市）
*西寒田神社
宫崎縣
*榎原神社(南郷町)
*宮崎神宮
*都農神社（宮崎縣）
*鵜戸神宮
鹿兒島縣
*宮浦宮
*枚聞神社
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**別系統：鹿兒島神宮(大隈八幡宮)
*新田神社（鹿兒島縣）
*照國神社（鹿兒島市）
*霧島神宮
冲绳地方
沖繩縣
*普天間宮
*＜八幡神信仰・八幡宮＞
**別系統：安里八幡宮：原來也有別的神祇、現在為祭拜八幡神。
*波上宮（沖繩縣那霸市）
*末吉宮
*識名宮
*＜熊野神社＞
*沖宮
*天久宮
*金武宮
*十山神社（與那國町）〈日本最西端神社〉
參見
*鳥居
*神社
*神宮
*神道
*社格
*別表神社
*二十二社
*延喜式神名帳
*近代社格制度
*名神大社
*一宮
*日本寺院列表
*朝鮮神社列表
*台灣神社列表
*中國大陸神社列表
*满洲国神社列表
外部連結
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