生物鐘（英語：biological clock），在生物學與時間生物學領域中指生物體內調控各種生理活動的時間機制或節律系統，又稱為生理時鐘。這些內在節律使得生物體能夠預測並適應外在環境的週期性變化，尤其是日夜（晝夜）循環。生物鐘範疇包括分子時鐘、晝夜節律、與年週期等多種時間性節律。
起源
自然界有当生命的节奏与自然环境的节奏吻合的时候，生命才能够更好地生存，才能在生物演化的过程中被自然选择而保存下来。从生物的演化和自然选择原理来说，地球上所有的生命现象都是大自然对生物适应环境的演化选择的结果。由于生命约出现于地球形成10亿年之后，从它诞生开始，生命最简单的生物分子之间的生物化学反应就受到地球上早已存在的各种物质和环境因素的影响，其后的变化也都在地球环境的掌控之中，因此地球上生命的一切活动都受到地球周期性律动的影响，所有的生物节律也都是环境对生物演化选择的结果。
結構與機制
在哺乳動物中，主生物鐘位於大腦的下丘腦視交叉上核（suprachiasmatic nucleus, SCN），由約20,000個神經元組成，可透過視網膜感知光線訊號，使內在節律與日夜循環同步。主生物鐘再透過激素分泌與神經訊號，協調外周器官（如肝臟、心臟等）的節律，形成全身一致的節奏網絡。
生物鐘的分子基礎包括一組所謂的時鐘基因與蛋白質反饋迴路，這些基因在細胞層面上以週期性方式表達，形成大約24小時的生物時鐘振盪。近期科學報導指出，體內的生物鐘不僅調節常見的日夜節律，在細胞能量代謝與日常行為功能上也扮演關鍵角色。研究人員指出，光照條件與日常作息對生物鐘的同步性具有顯著影響，而不規律生活可能導致協調性下降。現代研究亦發現細胞內的粒線體存在自己的節律，影響能量生成與整體健康。
相關
*昼夜节律
*時間生物學
*深宵 (基因)
参考资料
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