農業部畜產試驗所（簡稱畜試所），成立於1940年，位於臺南市新化區，是中華民國農業部的附屬機關。並在新竹、宜蘭、屏東等8處設有場區，負責臺灣畜產試驗研究工作。
沿革
*日治昭和十五年（1940年），臺灣總督府成立「臺灣總督府種馬牧場」。
*戰後民國34年（1945年），國民政府接管臺灣後改制為「臺灣省行政長官公署農林處種馬牧場」。
*民國36年（1947年），改組為「臺灣省政府農林廳西部種畜場」，養馬業務移交中華民國國防部。
*民國41年（1952年），改組為「臺灣省農業試驗所新化畜產試驗分所」。
*民國47年（1958年），合併農業試驗所畜產系及恒春分所，改成立「臺灣省畜產試驗所」，隸屬於臺灣省政府農林廳。
*民國54年（1965年），臺灣省政府農林廳山地農牧局第三示範牧場改隸本所，並改名為楊梅分所。
*民國62年（1973年），各區農業改良場（台北、新竹、台中、台東、高雄及花蓮）之畜牧課及畜牧分所均改隸本所，分別成立為宜蘭、彰化、高雄、台東、花蓮等五個種畜繁殖中心及楊梅分所崎頂示範牧場，另高雄區農業改良場之澎湖分場成立為本所澎湖種畜推廣工作站。
*民國65年（1976年），原五個種畜繁殖中心改制成立為宜蘭、彰化、高雄、台東及花蓮種畜繁殖場，澎湖種畜推廣工作站改為澎湖種畜繁殖中心，崎頂示範牧場改為苗栗種畜繁殖場。
*民國70年（1981年），楊梅分所改為新竹分所，宜蘭種畜繁殖場改為宜蘭分所。
*民國77年（1988年），苗栗種畜繁殖場裁撤，部份員工移撥新竹分所並成立養豬系，部份員工移撥臺灣省家畜衛生試驗所。
*民國86年（1997年），總所移撥三公頃土地供臺灣省立臺南醫院分院之用地。
*民國88年（1999年）精省而改隸於行政院農業委員會，更銜為「行政院農業委員會畜產試驗所」。
*民國98年（2009年），新竹分所從新竹市香山區遷場至苗栗縣西湖鄉。
*民國103年（2014年），農業科技研究院於新竹分所香山區原址成立。
*民國112年（2023年）5月31日，制定公布《農業部畜產試驗所組織法》。同年8月1日起隨農委會升格為農業部，農業部成立後更名為「農業部畜產試驗所」並進行組織整併，新竹分所、彰化種畜場併為北區分所，恆春分所、高雄種畜場與澎湖工作站併為南區分所，宜蘭分所、花蓮種畜場與臺東種畜場併為東區分所。
歷任首長
組織
*遺傳生理組
*畜產加工組
*畜產經營組
*動物營養組
*飼料作物組
*技術服務組
*主計室
*人事室
*政風室
*秘書室
所屬單位
*南區分所：恆春場區、屏東場區、澎湖場區
*北區分所：新竹場區、彰化場區
*東區分所：宜蘭場區、花蓮場區、臺東場區
File:高雄種畜繁殖場.jpg|南區分所屏東場區
File:畜產試驗所恆春分所.jpg|南區分所恆春場區
參考來源
外部連結
*[http://www.tlri.gov.tw/ 農業部畜產試驗所]
*[https://web.archive.org/web/20100118014727/http://trade.coa.gov.tw/ 台灣農產品外銷網]
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