2006年世界盃-非洲區外圍賽透過淘汰賽及分組賽決定5隊非洲國家隊參加決賽周，賽事由非洲足協（CAF）負責管轄，52個成員國當中只有東非國家吉布提沒有參賽。賽事除了決定參加世界盃決賽周的球隊外，還擔任2006年非洲國家盃外圍賽的角色，各組首3名晉身2006年非洲國家盃決賽周。

出線決賽周的球隊中有4隊首次出席世界盃：安哥拉，科特迪瓦，加納，多哥，上屆世界盃5隊非洲球隊當中：喀麥隆，尼日利亞，南非，塞內加爾及突尼西亞，只有突尼西亞能夠順利出線。

賽制
外圍賽共有分為兩輪，包括有淘汰賽及分組賽。首圈有42支球隊參加，兩隊球隊以兩回合主客制作賽。21支勝出球隊晉升第二圈分組賽。第二圈將30支參賽球隊分為5組，每組均為6隊，每組首名可晉身決賽周。

第一圈
賽制
首圈淘汰賽是由42支球隊進行抽籤，兩隊球隊以兩回合主客制作賽。21支勝方與2002年世界杯的5支非洲球隊：塞內加爾、喀麥隆、尼日利亞、突尼西亞以及南非以及根據2003年6月25日前的國際足協世界排名當中4隊最高排名的非洲球隊：埃及、摩洛哥、民主刚果、科特迪瓦合計30隊進入分組賽階段

粗體字代表出線球隊

• 由於中非共和國退出，因此布吉納法索可自動出線分組賽階段。

晉級球隊
晉級球隊共有21隊，包括：（2004年11月時世界排名）

• (47)
• (59)
• (61)
• (65)
• (70)
• (73)
• (75)
• (83)
• (84)
• (85)
• (85)
• (97)
• (100)
• (105)
• (106)
• (109)
• (113)
• (113)
• (117)
• (121)
• (125)

第二圈
30支進入分組賽階段的球隊會分為五組，每組各有六隊，每隊互相對賽，採取主客雙循環賽制，勝出得3 分，和得1分，負則0分。按各隊於分組賽的總得分排列，每組的首名可直接晉身2006年世界盃決賽周。

• 若有隊伍於分組賽上出現相同分數，則需順序按以下方法排列名次：

有關隊伍的對賽成績

有關隊伍的對賽球差

有關隊伍的對賽入球數字

在分組賽中的總球差

在分組賽中的總入球數字

於中立場進行一場附加賽決勝負

• 粗體字代表出線球隊

第一組
第二組
第三組
第四組
第五組
外部連結

• [http://www.cafonline.com 非洲足協官方網站]