至2007年，中华人民共和国新疆维吾尔族自治区共有大型水库20座，按库容量依次为克孜尔水库、小海子水库、乌鲁瓦提水利枢纽、“635”水库、福海水库、塘巴湖水库、上游水库、蘑菇湖水库、大西海子二库、恰拉水库、多浪水库、可可托海水库、永安坝南库、苏库恰克水库、胜利水库、跃进水库 (玛纳斯)、柳沟水库、夹河子水库、西克尔水库、风城水库。
根据中华人民共和国水利部发布的《中国水库名称代码》（中华人民共和国行业标准SL259-2000）将新疆维吾尔族自治区所有大型水库及中型水库列表如下。
大型水库
伊犁河-额敏河流域
*乌拉斯台水库 塔城市
*乌什水水库 额敏县
*黄羊泉水库 克拉玛依市
额尔齐斯河水系
*可可托海水库 富蕴县可可托海
*183团6号水库 阿尔泰市183团
*托洪台水库 布尔津县
*塘巴湖水库 阿尔泰市红墩乡
*阿苇滩水库 阿尔泰市
*青年水库 阿尔泰市
*额敏水库 额敏县
准噶尔内流区
*福海水库 福海县顶点
*哈拉霍英水库 福海县哈拉霍英
*顶山水库 福海县
*加音塔拉水库 和布克赛尔县
*白杨河水库 克拉玛依市白杨河
*白碱滩水库 克拉玛依市
*奎屯河水库 乌苏市
*车排子水库 乌苏市
*黄沟一库 乌苏市
*黄沟二库 乌苏市
*泉沟水库 奎屯市
*柳沟水库 乌苏市
*五一水库 (博乐) 博乐市
*鄂托克赛尔水库 温泉县
*蘑菇湖水库 石河子市
*大泉沟水库 石河子市石河子
*跃进水库 玛纳斯县
*夹河子水库 玛纳斯县
*新户坪水库 玛纳斯县
*安集海一库 沙湾县
*安集海二库 沙湾县
*洪沟水库 沙湾县
*小海子水库 呼图壁县
*大海子水库 呼图壁县五工台
*三屯河水库 昌吉市碾盘庄
*头屯河水库 昌吉市
*乌拉泊水库 乌鲁木齐市南郊
*红雁池水库 乌鲁木齐市南郊
*猛进水库 昌吉市五家渠
*红山水库 (托克逊) 托克逊县
*西大龙口水库 吉木萨县三台
*下新湖水库 吉木萨县吉木萨尔
*龙王庙水库 木垒县木垒
*柯柯亚水库 鄯善县
*八一水库 (昌吉) 昌吉市
*红岩水库 乌鲁木齐市南郊
*冰湖水库 阜康县
塔里木内流区
*帕满水库 沙雅县
*结然力克水库 沙雅县
*其满水库 沙雅县
*大寨水库 沙雅县
*卡尔其克水库 尉犁县卡尔其克
*塔里木水库 尉犁县塔里木乡
*卡拉水库 尉犁县
*大西海子一库 尉犁县
*大西海子二库 尉犁县
*托克拉克水库 阿图什市
*西克尔水库 伽师县西克尔乡
*卡达苏盖提水库 疏勒县塔孜其乡
*苏库恰克水库 莎车县艾力西湖
*依干其水库 莎车县依干其镇
*艾力西湖水库上 莎车县艾力西湖
*艾力西湖水库下 莎车县艾力西湖
*东方红水库 上 莎车县西库力
*东方红水库 下 莎车县西库力
*东巴克水库 莎车县阿瓦提镇
*米吉东水库 莎车县阿瓦提镇
*塞力吾依水库 莎车县莎车
*塔哈其水库 莎车县塔哈其
*吉仁力马水库 麦盖提县吐曼塔勒
*前进水库 麦盖提县吐麦盖提
*红海子水库 巴楚县红海子乡
*卫星水库 巴楚县红海子乡
*草龙水库 巴楚县毛拉乡
*阿吉根水库 巴楚县毛拉乡
*小海子水库 巴楚县
*永安坝南库 巴楚县
*永安坝北库 巴楚县
*上游水库 阿瓦提县
*汗可尔水库 麦盖提县
*新井子水库 阿克苏市
*西大桥水库 阿克苏市
*多浪水库 阿克苏市
*胜利水库 阿克苏市
*东风水库 墨玉县扎瓦
*卡尔赛水库 墨玉县奎牙
*新建水库 墨玉县沙依巴格
*英尔里克水库 和田县英尔里克
*东方红水库 (和田) 和田县吐沙拉乡
*哈拉块力水库 洛甫县普拉乡
*克孜尔水库 拜城县拜城
*跃进水库 库车县
*五一水库 (新和) 新和县
*民兵水库 沙雅县
*沙汗水库 英吉沙县沙汗乡
*阿湖水库 阿图什市
*托卡依水库 阿图什市
*保尔水库 叶城县洛克乡
*雅普泉水库 皮山县固玛镇
*桑株水库 皮山县柯尔柯孜
*先锋水库 策勒县
*东方红水库 (于田) 于田县
*克里西水库 库车县
参考文献
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