是比较基因组学的经典方法。此处为耶爾辛氏菌屬的八种细菌的比对：可以看出在所有八株菌种中都有这78个保守序列模块。Each chromosome has been laid out horizontally and homologous blocks in each genome are shown as identically colored regions linked across genomes. Regions that are inverted relative to Y. pestis KIM are shifted below a genome's center axis.]]
比较基因组学（）是基于基因组图谱和测序技术,对已知的基因特征和基因组结构进行比较以了解基因的功能、表达机制和不同物种親緣關係的生物学研究。基因组的特征可包括的DNA序列，基因，基因顺序，调控序列，和其它的基因组结构标志。这种方法不仅功能强大，而且速度也快。识别与农艺性状相关的基因座的先前方法需要几代仔细监测亲本菌株的繁殖，而这耗时的努力在比较基因组研究就不需要了。
医学
医学领域也受益于比较基因组学研究。由于基因组方法的问题，特别是疫苗技术已经在技术上取得了有益的进展。在的方法中，研究人员可以通过分析病原体或病原体家族的基因组来发现疫苗开发的候选抗原。
研究
比较基因组学在其他研究领域也开辟了新的途径。随着DNA定序技术的发展，出現越来越多樣不同的定序方式，同次定序能檢驗出的基因组数量也有所增加。 随着可用基因组数据的不断增加，比较基因组推断的效力也在增长。 在最近的灵长类动物研究中发现了这种增加的效力的一个显着的例子。 比较基因组方法使得研究人员可以使用先前的数据和方法收集关于灵长类动物遗传变异，差异基因表达和进化动态的信息。
参阅
- 数据挖掘
- 分子演化
- 比较解剖学
- 同源
参考资料
外部链接
- [http://www.genomesonline.org/ Genomes OnLine Database (GOLD)] -基因组在线数据库
- [http://www.genomenewsnetwork.org/ Genome News Network] -基因组新闻网
- [http://arquivo.pt/wayback/20160516145036/http://cmr.jcvi.org/ JCVI Comprehensive Microbial Resource] - JCVI综合微生物资源
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