1938–39年香港甲組足球聯賽，由上屆的 10 隊增加至 11 球隊。兩件前才誕生的九華宣佈退出，海軍重新加入，光華則首次升上甲組聯賽角逐。

南華A奪得聯賽冠軍，東方首次躋身前列獲得亞軍，海軍得到季軍。

高級銀牌賽決賽，南華A以 5–3 擊敗警察，成為「雙料冠軍」。

聯賽榜
若果有部分球隊於聯賽榜中取得相同分數，則根據有關球會的對賽成績決定。而對賽成績相同之排名方法，則根據下列次序排名：# 有關賽事的分數

有關賽事的得失球

有關賽事的得球

• 註：東方與海軍同得29分，兩隊於1939年4月30日進行附加賽，東方以3－2擊敗海軍，獲得亞軍。

參考資料
外部連結

• [http://www.hkfa.com/ 香港足球總會官方網頁]
• [http://www.davidto.com/siuming/pastleague/?year=1946 香港足球聯賽歷屆資料]