1945–46年香港甲組足球聯賽是香港甲組足球聯賽經過二次世界大戰停頓後，於1946年初復辦，戰後第一屆甲組聯賽共有 10 隊參加，除了南華、東方與光華三支華人球隊外，其餘七隊均是英軍球隊。

這屆聯賽只進行了單循環比賽，由空軍贏得聯賽冠軍，亦是英軍球隊最後一次奪得香港甲組足球聯賽冠軍，亞軍是第44營金冕多，華人球隊則以東方成績最好，獲得季軍。

聯賽榜
若果有部分球隊於聯賽榜中取得相同分數，則根據有關球會的對賽成績決定。而對賽成績相同之排名方法，則根據下列次序排名：# 有關賽事的分數

有關賽事的得失球率

有關賽事的得球

參考資料
外部連結

• [http://www.hkfa.com/ 香港足球總會官方網頁]
• [http://www.davidto.com/siuming/pastleague/?year=1946 香港足球聯賽歷屆資料]