壺菌綱（學名：）是真菌下的一綱。它們可以分佈在土壤、淡水及鹹水河口中。它們是原始的真菌，最初是在英國的瑞尼燧石中發現。最年它們的分類重新編排，排除了Neocallimastigomycota及Monoblepharidomycetes及將它們分別提升為門及其姊妹綱。又將擬油壺菌屬及Hypochytrium分類在其下。
壺菌綱是壺菌門下的主要綱，會造成如水蚤屬及兩棲類等生物的寄生性感染，
下级分类
本纲包括以下目：
;目的地位未定的科：
;目和科的地位未定的属：
參考
壺菌綱（學名：）是真菌下的一綱。它們可以分佈在土壤、淡水及鹹水河口中。它們是原始的真菌，最初是在英國的瑞尼燧石中發現。最年它們的分類重新編排，排除了Neocallimastigomycota及Monoblepharidomycetes及將它們分別提升為門及其姊妹綱。又將擬油壺菌屬及Hypochytrium分類在其下。
壺菌綱是壺菌門下的主要綱，會造成如水蚤屬及兩棲類等生物的寄生性感染，
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;目和科的地位未定的属：
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